More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_940 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  93.79 
 
 		 566 aa  1090    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  88.87 
 
 		 566 aa  1041    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  100 
 
 		 566 aa  1161    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  52.16 
 
 		 573 aa  606  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  54.69 
 
 		 577 aa  607  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  49.91 
 
 		 587 aa  577  1.0000000000000001e-163  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  51.64 
 
 		 583 aa  567  1e-160  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  49.57 
 
 		 576 aa  551  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  49.39 
 
 		 576 aa  550  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  47.22 
 
 		 574 aa  538  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  46.68 
 
 		 575 aa  527  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  51.43 
 
 		 539 aa  526  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  48.84 
 
 		 538 aa  521  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2524  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.38 
 
 		 556 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  47.89 
 
 		 546 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  49.03 
 
 		 554 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  46.02 
 
 		 540 aa  507  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  48.13 
 
 		 584 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  48.23 
 
 		 556 aa  505  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  46.62 
 
 		 598 aa  497  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  47.34 
 
 		 542 aa  496  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  47.34 
 
 		 542 aa  496  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  46.52 
 
 		 577 aa  495  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  46.46 
 
 		 566 aa  494  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  45.87 
 
 		 540 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  45.87 
 
 		 540 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  48.31 
 
 		 549 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  46.38 
 
 		 571 aa  495  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  46.04 
 
 		 591 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  48.31 
 
 		 549 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  46.14 
 
 		 567 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.63 
 
 		 537 aa  491  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  45.69 
 
 		 540 aa  491  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  46.79 
 
 		 542 aa  489  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  47.16 
 
 		 577 aa  491  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  45.33 
 
 		 539 aa  488  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  45.77 
 
 		 545 aa  488  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  46.11 
 
 		 538 aa  487  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  46.29 
 
 		 539 aa  487  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  46.07 
 
 		 567 aa  485  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.87 
 
 		 591 aa  488  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  44.71 
 
 		 564 aa  485  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  46.64 
 
 		 540 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3217  NAD+ synthetase  46.29 
 
 		 557 aa  481  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  43.84 
 
 		 561 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  44.93 
 
 		 597 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  44.43 
 
 		 561 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  46.76 
 
 		 545 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  47.35 
 
 		 543 aa  481  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  46.08 
 
 		 599 aa  481  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  45.83 
 
 		 561 aa  481  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  47.05 
 
 		 540 aa  481  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  44.52 
 
 		 571 aa  478  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  46.42 
 
 		 559 aa  481  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  43.71 
 
 		 565 aa  479  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  45.45 
 
 		 577 aa  476  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  44.44 
 
 		 560 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  46.68 
 
 		 543 aa  477  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  45.45 
 
 		 552 aa  478  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  43.84 
 
 		 561 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  45.39 
 
 		 535 aa  475  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  45.47 
 
 		 545 aa  475  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  45.99 
 
 		 541 aa  476  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  45.3 
 
 		 554 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  44.9 
 
 		 567 aa  473  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  42.81 
 
 		 561 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2091  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.27 
 
 		 550 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  44.54 
 
 		 544 aa  474  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  46.63 
 
 		 547 aa  474  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  43.66 
 
 		 562 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  46.09 
 
 		 543 aa  474  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  45.01 
 
 		 590 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  45.88 
 
 		 545 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  45.49 
 
 		 562 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1036  NAD+ synthetase  45.83 
 
 		 558 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  44.9 
 
 		 567 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  45.53 
 
 		 577 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  45.42 
 
 		 566 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  45.31 
 
 		 545 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  42.64 
 
 		 561 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  44.95 
 
 		 554 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  44.76 
 
 		 546 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07390  NAD+ synthetase  46.14 
 
 		 577 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  44.19 
 
 		 611 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  45.49 
 
 		 545 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2239  NAD synthetase  46.62 
 
 		 558 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.572998 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  43.21 
 
 		 552 aa  465  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3585  NAD+ synthetase  46.27 
 
 		 586 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  45.75 
 
 		 566 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  45.75 
 
 		 566 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  45.75 
 
 		 566 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  45.75 
 
 		 566 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  45.75 
 
 		 609 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  46.27 
 
 		 564 aa  465  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  44.58 
 
 		 556 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  45.09 
 
 		 571 aa  465  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  45.75 
 
 		 566 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  45.75 
 
 		 609 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0882  NAD synthetase  45.28 
 
 		 561 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  44.92 
 
 		 553 aa  459  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>