More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3650 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  100 
 
 
540 aa  1107    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  89.63 
 
 
540 aa  1011    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  57.96 
 
 
556 aa  647    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  89.44 
 
 
540 aa  1011    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  89.44 
 
 
540 aa  1011    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  58.96 
 
 
554 aa  624  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  56.45 
 
 
540 aa  600  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  55.99 
 
 
546 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  52.5 
 
 
542 aa  588  1e-166  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  52.5 
 
 
542 aa  587  1e-166  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  54.8 
 
 
545 aa  579  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  55.97 
 
 
539 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  52.01 
 
 
545 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  56.29 
 
 
537 aa  570  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  55.41 
 
 
542 aa  567  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  53.33 
 
 
543 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  53.36 
 
 
538 aa  559  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  56.19 
 
 
549 aa  558  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  56.19 
 
 
549 aa  558  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  52.62 
 
 
539 aa  553  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  52.43 
 
 
538 aa  546  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  51.8 
 
 
564 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  52.55 
 
 
554 aa  545  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  53.38 
 
 
545 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  52.19 
 
 
554 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  51.46 
 
 
561 aa  540  9.999999999999999e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  51.21 
 
 
539 aa  538  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  53.11 
 
 
545 aa  538  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4875  NAD+ synthetase  53.47 
 
 
559 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  52.53 
 
 
535 aa  535  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  52.18 
 
 
550 aa  536  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  48.69 
 
 
552 aa  532  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  52.55 
 
 
546 aa  531  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  50.19 
 
 
536 aa  531  1e-149  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  50.27 
 
 
552 aa  525  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  49.26 
 
 
567 aa  526  1e-148  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  52.59 
 
 
566 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  49.45 
 
 
567 aa  527  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  51.01 
 
 
557 aa  528  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  50.47 
 
 
541 aa  526  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  52.59 
 
 
566 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  52.59 
 
 
566 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  52.89 
 
 
559 aa  524  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  52.59 
 
 
566 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  52.59 
 
 
609 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  52.59 
 
 
566 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  52.59 
 
 
609 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0771  hypothetical protein  49.26 
 
 
536 aa  521  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  50.45 
 
 
562 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  50.18 
 
 
565 aa  521  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2322  NAD synthetase  51.76 
 
 
576 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509077  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  49.17 
 
 
545 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  49.09 
 
 
554 aa  514  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  50.45 
 
 
564 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  49.36 
 
 
547 aa  513  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0882  NAD synthetase  51.9 
 
 
561 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  51.06 
 
 
572 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  50.18 
 
 
562 aa  514  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2457  NAD synthetase  51.41 
 
 
576 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0627806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  50.27 
 
 
566 aa  508  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5739  NAD synthetase  51.61 
 
 
568 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.630816  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  48.3 
 
 
561 aa  509  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1800  NAD synthetase  51.06 
 
 
572 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2412  NAD synthetase  51.06 
 
 
572 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  51.81 
 
 
566 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  48.89 
 
 
544 aa  505  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  48.62 
 
 
545 aa  508  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  46.02 
 
 
566 aa  507  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  46.26 
 
 
566 aa  504  1e-141  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0982  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  48.92 
 
 
552 aa  504  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  50.99 
 
 
577 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  48.82 
 
 
585 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  49.01 
 
 
587 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  48.1 
 
 
583 aa  496  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.37 
 
 
566 aa  496  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  44.91 
 
 
573 aa  494  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  49.73 
 
 
585 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.235816 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  48.27 
 
 
576 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0970  NAD synthetase  48.83 
 
 
573 aa  489  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615743  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1225  NAD synthetase  48.28 
 
 
583 aa  486  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410513  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  44.83 
 
 
583 aa  482  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  47.64 
 
 
587 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  47.25 
 
 
550 aa  478  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1986  NAD synthetase  48.09 
 
 
583 aa  479  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  47.8 
 
 
577 aa  479  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  46.8 
 
 
560 aa  478  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1377  NAD synthetase  47.34 
 
 
569 aa  475  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  45.98 
 
 
577 aa  478  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  47.07 
 
 
550 aa  476  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  41.84 
 
 
574 aa  472  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  45.85 
 
 
559 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  46.18 
 
 
559 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  45.52 
 
 
560 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  46.18 
 
 
559 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  45.8 
 
 
559 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2238  NAD+ synthetase  48.12 
 
 
538 aa  460  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.695951  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  44.89 
 
 
587 aa  457  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0687  NAD synthetase  47.01 
 
 
558 aa  455  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776924  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  43.86 
 
 
591 aa  449  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  42.56 
 
 
576 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>