More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0449 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2091  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  64.92 
 
 
550 aa  679    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  73.94 
 
 
559 aa  798    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  100 
 
 
556 aa  1122    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  55.27 
 
 
567 aa  610  1e-173  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  56.83 
 
 
548 aa  592  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  53.31 
 
 
566 aa  587  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  50.88 
 
 
561 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3217  NAD+ synthetase  53.12 
 
 
557 aa  574  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  50.71 
 
 
561 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  49.91 
 
 
560 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2239  NAD synthetase  54.29 
 
 
558 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.572998 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  48.24 
 
 
561 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0105  NAD synthetase  51.19 
 
 
574 aa  543  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.1435  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  48.06 
 
 
561 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1984  NAD synthetase  48.98 
 
 
584 aa  535  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187378  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2524  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  49.82 
 
 
556 aa  518  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  50.35 
 
 
567 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1435  NAD+ synthetase  51.62 
 
 
529 aa  495  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0116683  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  44.41 
 
 
566 aa  488  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  45.78 
 
 
566 aa  487  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  44.58 
 
 
566 aa  482  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  44.78 
 
 
543 aa  480  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.36 
 
 
577 aa  477  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2180  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  49.38 
 
 
561 aa  473  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.432565 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04891  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  47.54 
 
 
564 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0977  NAD+ synthase  42.36 
 
 
569 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18451  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  42.53 
 
 
569 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.522379 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0495  NAD+ synthase  47.42 
 
 
558 aa  471  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  47.83 
 
 
571 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15651  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  44.29 
 
 
576 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.873266  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  45.32 
 
 
540 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3756  NAD+ synthetase  46.14 
 
 
573 aa  466  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0752  NAD+ synthetase  47.27 
 
 
560 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.204171  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0572  NAD+ synthetase  48 
 
 
552 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323116  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  45.95 
 
 
538 aa  463  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1036  NAD+ synthetase  43.11 
 
 
558 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  47.88 
 
 
554 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0285  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  51.14 
 
 
569 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.210766  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  47.12 
 
 
577 aa  461  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  47.07 
 
 
550 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  47.7 
 
 
554 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0217  NAD+ synthetase  44.52 
 
 
554 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  45.5 
 
 
539 aa  457  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  48.33 
 
 
559 aa  455  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  45.42 
 
 
552 aa  457  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  47.51 
 
 
556 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  43.32 
 
 
576 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0307  NAD+ synthetase  51.31 
 
 
569 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.770204  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  43.15 
 
 
576 aa  451  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  44.52 
 
 
564 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3277  NAD+ synthetase  45.49 
 
 
554 aa  448  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  46.8 
 
 
545 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  44.72 
 
 
540 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  44.77 
 
 
540 aa  447  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  46.62 
 
 
545 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0296  NAD+ synthetase  50.35 
 
 
569 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  44.72 
 
 
540 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  44.54 
 
 
540 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  44.5 
 
 
539 aa  444  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  44.89 
 
 
562 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  44.21 
 
 
565 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  46.47 
 
 
546 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  43.67 
 
 
561 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  45.88 
 
 
577 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  42.42 
 
 
546 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  42.75 
 
 
542 aa  435  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0882  NAD synthetase  47.11 
 
 
561 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  45.67 
 
 
542 aa  437  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  48.65 
 
 
543 aa  438  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  45.47 
 
 
554 aa  436  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  42.57 
 
 
542 aa  432  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  44.36 
 
 
540 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  47.22 
 
 
566 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  47.22 
 
 
566 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  47.22 
 
 
566 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  47.22 
 
 
566 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  47.22 
 
 
609 aa  432  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  47.22 
 
 
566 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16481  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  40.03 
 
 
565 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  47.22 
 
 
609 aa  432  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4875  NAD+ synthetase  45.13 
 
 
559 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  45.83 
 
 
566 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  42.99 
 
 
538 aa  427  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  48.39 
 
 
549 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  43.65 
 
 
587 aa  427  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  47.55 
 
 
566 aa  428  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  48.39 
 
 
549 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  46.15 
 
 
562 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  40.71 
 
 
545 aa  419  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1539  NAD+ synthetase  39.4 
 
 
565 aa  422  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  46.56 
 
 
572 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16361  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  39.4 
 
 
565 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1800  NAD synthetase  46.39 
 
 
572 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2412  NAD synthetase  46.39 
 
 
572 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16251  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  38.14 
 
 
565 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  41.12 
 
 
583 aa  417  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2457  NAD synthetase  46.34 
 
 
576 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0627806  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  37.67 
 
 
575 aa  413  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5739  NAD synthetase  46.37 
 
 
568 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.630816  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  42.78 
 
 
559 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.355506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>