More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1699 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  74.51 
 
 		 552 aa  851    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  57.75 
 
 		 546 aa  635    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  64.49 
 
 		 577 aa  694    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  58.06 
 
 		 539 aa  645    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  74.02 
 
 		 564 aa  853    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4875  NAD+ synthetase  66.25 
 
 		 559 aa  721    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  100 
 
 		 561 aa  1148    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  79.65 
 
 		 562 aa  919    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  57.89 
 
 		 539 aa  641    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  68.42 
 
 		 559 aa  734    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  70.92 
 
 		 550 aa  789    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  77.17 
 
 		 565 aa  900    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  69.88 
 
 		 554 aa  797    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  70.05 
 
 		 554 aa  801    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  58.01 
 
 		 545 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  58.19 
 
 		 545 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  58.04 
 
 		 566 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  58.04 
 
 		 566 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  58.04 
 
 		 566 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  58.04 
 
 		 609 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  56.57 
 
 		 572 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  58.04 
 
 		 566 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1800  NAD synthetase  56.75 
 
 		 572 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2412  NAD synthetase  56.75 
 
 		 572 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  58.04 
 
 		 609 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  58.04 
 
 		 566 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  56.82 
 
 		 566 aa  608  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5739  NAD synthetase  56.62 
 
 		 568 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.630816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  57.04 
 
 		 562 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2457  NAD synthetase  56.36 
 
 		 576 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0627806  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  56.69 
 
 		 566 aa  600  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0882  NAD synthetase  57.32 
 
 		 561 aa  599  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2322  NAD synthetase  55.67 
 
 		 576 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  54.29 
 
 		 542 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  53.94 
 
 		 538 aa  580  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  52.58 
 
 		 538 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  54.58 
 
 		 535 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  54.35 
 
 		 537 aa  548  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  50.81 
 
 		 542 aa  542  1e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  50.63 
 
 		 542 aa  538  9.999999999999999e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  50.71 
 
 		 556 aa  533  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  52.31 
 
 		 546 aa  528  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  50.8 
 
 		 539 aa  522  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  50 
 
 		 554 aa  524  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  48.76 
 
 		 545 aa  519  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  51.25 
 
 		 543 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  49.02 
 
 		 540 aa  513  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  49.19 
 
 		 540 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  49.19 
 
 		 540 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  48.3 
 
 		 540 aa  509  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  47.47 
 
 		 561 aa  503  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  49.03 
 
 		 583 aa  502  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  48.85 
 
 		 540 aa  501  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  45.54 
 
 		 545 aa  495  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  51.42 
 
 		 549 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  51.42 
 
 		 549 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  48.32 
 
 		 547 aa  498  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  49.29 
 
 		 541 aa  492  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  47.45 
 
 		 544 aa  489  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  48.94 
 
 		 587 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  45.5 
 
 		 552 aa  483  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  47.7 
 
 		 545 aa  483  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  44.43 
 
 		 566 aa  479  1e-134  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  43.87 
 
 		 566 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  47.16 
 
 		 545 aa  478  1e-133  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  42.86 
 
 		 561 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  45.28 
 
 		 567 aa  476  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  43.74 
 
 		 566 aa  473  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  46.25 
 
 		 536 aa  473  1e-132  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  44.46 
 
 		 567 aa  473  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1225  NAD synthetase  47.63 
 
 		 583 aa  474  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  48.68 
 
 		 587 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  42.68 
 
 		 561 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1986  NAD synthetase  49.82 
 
 		 583 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  47.93 
 
 		 564 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  43.17 
 
 		 577 aa  469  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  45.88 
 
 		 587 aa  470  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0771  hypothetical protein  45.54 
 
 		 536 aa  468  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.74 
 
 		 566 aa  468  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  48.24 
 
 		 585 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  46.63 
 
 		 550 aa  463  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  45.1 
 
 		 553 aa  462  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  46.38 
 
 		 559 aa  460  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  48.43 
 
 		 585 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.235816 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  45.58 
 
 		 554 aa  460  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  46.45 
 
 		 550 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  41.01 
 
 		 560 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  46.13 
 
 		 560 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  46.19 
 
 		 576 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  42.83 
 
 		 576 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3217  NAD+ synthetase  42.71 
 
 		 557 aa  453  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  46.38 
 
 		 559 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  46.38 
 
 		 559 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1377  NAD synthetase  47.44 
 
 		 569 aa  452  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  41.82 
 
 		 573 aa  450  1e-125  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  44.37 
 
 		 557 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  44.78 
 
 		 560 aa  451  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.69 
 
 		 577 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  42.66 
 
 		 576 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  45.58 
 
 		 559 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>