More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2347 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  69.28 
 
 		 572 aa  726    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  100 
 
 		 546 aa  1105    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  64.91 
 
 		 559 aa  668    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  70.34 
 
 		 566 aa  728    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  70.34 
 
 		 566 aa  728    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  70.41 
 
 		 566 aa  725    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5739  NAD synthetase  69.2 
 
 		 568 aa  717    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.630816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2322  NAD synthetase  68.99 
 
 		 576 aa  716    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0882  NAD synthetase  70.05 
 
 		 561 aa  711    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  62.27 
 
 		 577 aa  639    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  70.34 
 
 		 566 aa  728    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  57.75 
 
 		 561 aa  643    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  68.69 
 
 		 562 aa  726    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  60.29 
 
 		 554 aa  638    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1800  NAD synthetase  69.11 
 
 		 572 aa  723    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  64.02 
 
 		 539 aa  695    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2457  NAD synthetase  68.06 
 
 		 576 aa  719    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0627806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2412  NAD synthetase  69.11 
 
 		 572 aa  723    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  70.16 
 
 		 566 aa  726    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  70.34 
 
 		 609 aa  728    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  69.27 
 
 		 566 aa  742    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  64.02 
 
 		 539 aa  697    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  70.34 
 
 		 566 aa  728    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  90.29 
 
 		 545 aa  974    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  59.5 
 
 		 564 aa  642    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  61.15 
 
 		 550 aa  640    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  90.11 
 
 		 545 aa  967    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  60.83 
 
 		 554 aa  642    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  70.34 
 
 		 609 aa  728    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  58.66 
 
 		 552 aa  635    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  57.22 
 
 		 538 aa  629  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  58.35 
 
 		 538 aa  624  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  59.74 
 
 		 542 aa  624  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  57.17 
 
 		 562 aa  616  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  55.95 
 
 		 565 aa  614  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4875  NAD+ synthetase  58.84 
 
 		 559 aa  610  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  56.48 
 
 		 535 aa  595  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  53.94 
 
 		 540 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  53.94 
 
 		 540 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  53.76 
 
 		 540 aa  552  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  54 
 
 		 556 aa  546  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  54.36 
 
 		 539 aa  543  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  51.18 
 
 		 542 aa  544  1e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  52.55 
 
 		 540 aa  543  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  51 
 
 		 542 aa  541  9.999999999999999e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  51 
 
 		 545 aa  534  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  53.2 
 
 		 554 aa  530  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  55.03 
 
 		 537 aa  528  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  52.9 
 
 		 546 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  49.09 
 
 		 545 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  51.93 
 
 		 543 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  51.81 
 
 		 561 aa  514  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  54.35 
 
 		 549 aa  511  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  50.82 
 
 		 540 aa  509  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  54.35 
 
 		 549 aa  511  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  50.53 
 
 		 583 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  48.99 
 
 		 536 aa  502  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  50.89 
 
 		 587 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  50.55 
 
 		 541 aa  502  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0771  hypothetical protein  48.8 
 
 		 536 aa  499  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  51.07 
 
 		 587 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  50.34 
 
 		 577 aa  490  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  45.19 
 
 		 573 aa  486  1e-136  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  45.72 
 
 		 567 aa  486  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  45.54 
 
 		 567 aa  484  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  46.52 
 
 		 552 aa  483  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  48.05 
 
 		 576 aa  484  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  50.8 
 
 		 585 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.235816 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  50.27 
 
 		 585 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  46.75 
 
 		 577 aa  480  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  45.1 
 
 		 566 aa  476  1e-133  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1225  NAD synthetase  49.11 
 
 		 583 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  45.1 
 
 		 566 aa  477  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  47.57 
 
 		 554 aa  474  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  50.26 
 
 		 564 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  48.02 
 
 		 550 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  45.8 
 
 		 557 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  45.03 
 
 		 566 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  47.82 
 
 		 545 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  47.84 
 
 		 550 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  47.27 
 
 		 545 aa  464  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  46.29 
 
 		 544 aa  459  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  44.46 
 
 		 583 aa  461  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1377  NAD synthetase  47.95 
 
 		 569 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  46.92 
 
 		 547 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  45.62 
 
 		 559 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  46.95 
 
 		 559 aa  458  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  45.66 
 
 		 560 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  45.86 
 
 		 559 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  44.14 
 
 		 576 aa  449  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  46.17 
 
 		 587 aa  450  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  44.98 
 
 		 566 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  45.86 
 
 		 559 aa  445  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  43.79 
 
 		 576 aa  443  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0970  NAD synthetase  45.39 
 
 		 573 aa  441  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615743  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3346  NAD synthetase  44.31 
 
 		 552 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  42.91 
 
 		 561 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.92 
 
 		 591 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  42.91 
 
 		 561 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  44.24 
 
 		 560 aa  442  9.999999999999999e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>