More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0878 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  100 
 
 
566 aa  1132    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  70.3 
 
 
545 aa  752    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  70.41 
 
 
546 aa  763    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  62.19 
 
 
559 aa  642    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  88.32 
 
 
566 aa  943    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  88.14 
 
 
566 aa  940    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  88.14 
 
 
566 aa  942    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5739  NAD synthetase  92.59 
 
 
568 aa  976    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.630816  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  92.12 
 
 
572 aa  985    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  60.61 
 
 
554 aa  644    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  84.19 
 
 
566 aa  914    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0882  NAD synthetase  88.41 
 
 
561 aa  931    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  62.66 
 
 
577 aa  643    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  88.32 
 
 
566 aa  943    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  56.69 
 
 
561 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  84.62 
 
 
562 aa  911    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  59.82 
 
 
539 aa  662    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1800  NAD synthetase  92.12 
 
 
572 aa  987    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  88.32 
 
 
609 aa  942    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  88.14 
 
 
566 aa  942    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  60.9 
 
 
539 aa  676    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2457  NAD synthetase  92 
 
 
576 aa  993    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0627806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2412  NAD synthetase  92.12 
 
 
572 aa  987    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  59.58 
 
 
564 aa  653    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  70.66 
 
 
545 aa  753    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  61.68 
 
 
550 aa  650    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2322  NAD synthetase  92.17 
 
 
576 aa  987    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509077  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  61.04 
 
 
554 aa  644    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  88.32 
 
 
609 aa  942    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  57.4 
 
 
552 aa  634  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  55.81 
 
 
565 aa  625  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  57.71 
 
 
538 aa  622  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  55.75 
 
 
562 aa  614  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  56.41 
 
 
538 aa  611  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  58.3 
 
 
535 aa  610  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4875  NAD+ synthetase  57.92 
 
 
559 aa  602  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  57.27 
 
 
542 aa  597  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  56.96 
 
 
537 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  52.6 
 
 
542 aa  554  1e-156  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  52.42 
 
 
542 aa  550  1e-155  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  52.71 
 
 
540 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  52.71 
 
 
540 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  52.53 
 
 
540 aa  548  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  53.41 
 
 
554 aa  550  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  54.45 
 
 
539 aa  546  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  51.81 
 
 
540 aa  545  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  49.11 
 
 
545 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  51.94 
 
 
556 aa  532  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  51.06 
 
 
583 aa  526  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  52.51 
 
 
561 aa  525  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  49.82 
 
 
545 aa  526  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  50.81 
 
 
540 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  50.62 
 
 
587 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  54.29 
 
 
549 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  54.29 
 
 
549 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  50.8 
 
 
546 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  50.52 
 
 
587 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  49.28 
 
 
543 aa  497  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  45.3 
 
 
576 aa  495  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  45.13 
 
 
576 aa  495  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  47.66 
 
 
536 aa  493  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1225  NAD synthetase  49.31 
 
 
583 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410513  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.1 
 
 
566 aa  492  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  50 
 
 
585 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  47.8 
 
 
554 aa  492  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  50 
 
 
585 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.235816 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  49.03 
 
 
557 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  49.19 
 
 
541 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  48.41 
 
 
550 aa  490  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0771  hypothetical protein  47.47 
 
 
536 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  47.42 
 
 
545 aa  489  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  48.23 
 
 
550 aa  489  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  44.88 
 
 
566 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  46.55 
 
 
577 aa  491  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  45.7 
 
 
552 aa  489  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  44.71 
 
 
566 aa  486  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  48.51 
 
 
576 aa  487  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  47 
 
 
559 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  46.07 
 
 
567 aa  483  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  47.06 
 
 
545 aa  485  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  47.95 
 
 
547 aa  482  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  43.62 
 
 
573 aa  484  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  45.89 
 
 
567 aa  484  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  47.59 
 
 
544 aa  483  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  48.4 
 
 
577 aa  484  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  46.29 
 
 
559 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1986  NAD synthetase  49.47 
 
 
583 aa  476  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  46.92 
 
 
559 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  49.48 
 
 
564 aa  475  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0853  NAD synthetase  46.67 
 
 
556 aa  475  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1593  NAD synthetase  47.52 
 
 
554 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.635718  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  46.11 
 
 
559 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0687  NAD synthetase  50.8 
 
 
558 aa  474  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776924  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  46.82 
 
 
560 aa  472  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1377  NAD synthetase  47.78 
 
 
569 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0970  NAD synthetase  45.86 
 
 
573 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615743  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  43.71 
 
 
583 aa  470  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1008  NAD synthetase  46.99 
 
 
554 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.535669  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  44.54 
 
 
560 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3346  NAD synthetase  46.19 
 
 
552 aa  468  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>