More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1404 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  57.67 
 
 		 576 aa  696    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  100 
 
 		 574 aa  1162    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  57.49 
 
 		 576 aa  696    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  52.6 
 
 		 575 aa  608  1e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  52.85 
 
 		 583 aa  597  1e-169  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  51.39 
 
 		 573 aa  585  1e-166  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.52 
 
 		 577 aa  551  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  48.69 
 
 		 566 aa  546  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  48.34 
 
 		 566 aa  545  1e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  47.3 
 
 		 566 aa  537  1e-151  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  43.6 
 
 		 587 aa  522  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  45.2 
 
 		 542 aa  495  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  43.65 
 
 		 556 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  45.03 
 
 		 542 aa  492  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  44.68 
 
 		 554 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  43.33 
 
 		 545 aa  479  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  40.28 
 
 		 571 aa  478  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  44.15 
 
 		 561 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  42.01 
 
 		 540 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  42.98 
 
 		 552 aa  473  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  42.43 
 
 		 545 aa  473  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  44.15 
 
 		 561 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  44.35 
 
 		 561 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  40.55 
 
 		 571 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  44.18 
 
 		 561 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  42.33 
 
 		 540 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  41.49 
 
 		 540 aa  465  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  41.49 
 
 		 540 aa  465  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  39.39 
 
 		 599 aa  462  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  40.31 
 
 		 541 aa  463  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  41.32 
 
 		 540 aa  464  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  40.87 
 
 		 549 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  41.64 
 
 		 567 aa  462  9.999999999999999e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  41.36 
 
 		 566 aa  459  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  40.87 
 
 		 549 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  41.81 
 
 		 567 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  44.88 
 
 		 543 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1409  NAD synthetase  45.76 
 
 		 561 aa  461  9.999999999999999e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  42.23 
 
 		 546 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  41.04 
 
 		 539 aa  457  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  43.3 
 
 		 567 aa  456  1e-127  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  39.51 
 
 		 542 aa  457  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  40.41 
 
 		 564 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  38.8 
 
 		 611 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  39.83 
 
 		 560 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  41.03 
 
 		 559 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  39.56 
 
 		 584 aa  451  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  40.99 
 
 		 561 aa  449  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  43.11 
 
 		 564 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  40.07 
 
 		 559 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  42.13 
 
 		 543 aa  451  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2524  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.34 
 
 		 556 aa  451  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  40.34 
 
 		 559 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  40.07 
 
 		 598 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  41.08 
 
 		 539 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  38.62 
 
 		 591 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  41.23 
 
 		 577 aa  447  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  39.26 
 
 		 591 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  41.81 
 
 		 560 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  40.51 
 
 		 552 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  40.28 
 
 		 554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  39.83 
 
 		 550 aa  443  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07390  NAD+ synthetase  38.58 
 
 		 577 aa  443  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  40.37 
 
 		 554 aa  444  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  38.71 
 
 		 567 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  40.07 
 
 		 559 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  39.4 
 
 		 582 aa  444  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.67 
 
 		 597 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  40.37 
 
 		 554 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.03 
 
 		 559 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  39.56 
 
 		 553 aa  441  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  40.59 
 
 		 538 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.03 
 
 		 537 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  41.44 
 
 		 577 aa  439  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.88 
 
 		 535 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0887  NAD+ synthetase  38.22 
 
 		 570 aa  442  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  39.66 
 
 		 550 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  40.41 
 
 		 545 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  41.52 
 
 		 560 aa  436  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  37.69 
 
 		 590 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  40.58 
 
 		 545 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  39.62 
 
 		 576 aa  437  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3277  NAD+ synthetase  38.49 
 
 		 554 aa  436  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3756  NAD+ synthetase  38.51 
 
 		 573 aa  438  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3217  NAD+ synthetase  42.3 
 
 		 557 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4955  NAD+ synthetase  39.59 
 
 		 586 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  40.17 
 
 		 546 aa  433  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  38.67 
 
 		 577 aa  434  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  39.41 
 
 		 557 aa  434  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0970  NAD synthetase  38.62 
 
 		 573 aa  435  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615743  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  39.8 
 
 		 562 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  39.38 
 
 		 583 aa  433  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1984  NAD synthetase  41.34 
 
 		 584 aa  432  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1765  NAD+ synthetase  37.92 
 
 		 601 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  hitchhiker  0.000901061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  39.25 
 
 		 587 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  38.87 
 
 		 566 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0882  NAD synthetase  39.53 
 
 		 561 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  39.73 
 
 		 561 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  39.83 
 
 		 562 aa  432  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  40.42 
 
 		 539 aa  431  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>