More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2038 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  100 
 
 
564 aa  1134    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  62.79 
 
 
546 aa  664    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  53.83 
 
 
545 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  55.14 
 
 
539 aa  552  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  53.86 
 
 
561 aa  553  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  51.98 
 
 
540 aa  551  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  51.8 
 
 
540 aa  550  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  51.98 
 
 
540 aa  551  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  54.32 
 
 
541 aa  551  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  52.78 
 
 
539 aa  542  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  52.05 
 
 
540 aa  542  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  53.2 
 
 
556 aa  544  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  52.24 
 
 
539 aa  542  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  53.32 
 
 
542 aa  539  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  50.45 
 
 
540 aa  541  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  52.68 
 
 
543 aa  532  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  50.72 
 
 
545 aa  532  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  51.43 
 
 
538 aa  529  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  48.74 
 
 
542 aa  531  1e-149  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  50.54 
 
 
538 aa  528  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  48.56 
 
 
542 aa  527  1e-148  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  50 
 
 
554 aa  518  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  52.16 
 
 
535 aa  520  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  51.43 
 
 
554 aa  518  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  52.19 
 
 
554 aa  520  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  52.19 
 
 
554 aa  518  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  50.26 
 
 
552 aa  517  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  52.5 
 
 
537 aa  507  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  51.85 
 
 
550 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  47.66 
 
 
566 aa  503  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  48.07 
 
 
566 aa  501  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  48.95 
 
 
576 aa  499  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  53.24 
 
 
549 aa  498  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  47.38 
 
 
564 aa  498  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  47.93 
 
 
561 aa  495  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  48.03 
 
 
562 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  53.24 
 
 
549 aa  498  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2238  NAD+ synthetase  52.88 
 
 
538 aa  494  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.695951  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  48.87 
 
 
560 aa  494  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  48.55 
 
 
565 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  46.45 
 
 
566 aa  490  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  48.35 
 
 
577 aa  489  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  51.11 
 
 
559 aa  490  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  50.26 
 
 
546 aa  487  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4875  NAD+ synthetase  51.41 
 
 
559 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  49.21 
 
 
545 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1986  NAD synthetase  49.91 
 
 
583 aa  488  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  47.47 
 
 
559 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  46.5 
 
 
536 aa  482  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  50 
 
 
545 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  47.99 
 
 
583 aa  483  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0982  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  48.34 
 
 
552 aa  484  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  47.46 
 
 
557 aa  483  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  50 
 
 
547 aa  481  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  47.84 
 
 
587 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  44.46 
 
 
567 aa  478  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  43.11 
 
 
573 aa  478  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  47.12 
 
 
559 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  45.36 
 
 
560 aa  479  1e-134  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0771  hypothetical protein  45.96 
 
 
536 aa  478  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  45.12 
 
 
567 aa  477  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  47.71 
 
 
559 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  48.69 
 
 
585 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.235816 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  45.86 
 
 
552 aa  477  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  46.49 
 
 
559 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  48.05 
 
 
572 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  51.12 
 
 
577 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1800  NAD synthetase  48.22 
 
 
572 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2412  NAD synthetase  48.22 
 
 
572 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  48.48 
 
 
544 aa  472  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  47.54 
 
 
550 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  49.48 
 
 
566 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  48.62 
 
 
562 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  47.36 
 
 
550 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  49.14 
 
 
566 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1225  NAD synthetase  47.99 
 
 
583 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410513  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  49.14 
 
 
566 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  49.14 
 
 
566 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  47.81 
 
 
585 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  49.14 
 
 
566 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  49.14 
 
 
609 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  47.99 
 
 
587 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  47.07 
 
 
587 aa  468  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  49.14 
 
 
566 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  49.14 
 
 
609 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5739  NAD synthetase  48.03 
 
 
568 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.630816  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1377  NAD synthetase  47.46 
 
 
569 aa  463  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0687  NAD synthetase  49.65 
 
 
558 aa  462  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776924  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0970  NAD synthetase  46.06 
 
 
573 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615743  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1463  NAD synthetase  48.43 
 
 
572 aa  463  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00661124  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2457  NAD synthetase  48.15 
 
 
576 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0627806  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2322  NAD synthetase  47.98 
 
 
576 aa  465  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509077  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  47.59 
 
 
566 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  43.28 
 
 
574 aa  463  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0882  NAD synthetase  48.35 
 
 
561 aa  458  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  49.04 
 
 
571 aa  456  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  44.59 
 
 
591 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  46.11 
 
 
571 aa  450  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  46.47 
 
 
545 aa  450  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  46.64 
 
 
545 aa  451  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>