More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1986 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  62.27 
 
 
550 aa  643    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1986  NAD synthetase  100 
 
 
583 aa  1173    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  60.4 
 
 
559 aa  651    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  59.53 
 
 
576 aa  637    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0970  NAD synthetase  59.25 
 
 
573 aa  653    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615743  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  62.09 
 
 
550 aa  641    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  61.17 
 
 
559 aa  639    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  61.41 
 
 
559 aa  656    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0687  NAD synthetase  63.64 
 
 
558 aa  630  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776924  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  59.43 
 
 
583 aa  630  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  60.33 
 
 
560 aa  630  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  60.51 
 
 
559 aa  631  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  58.03 
 
 
557 aa  627  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  57.92 
 
 
554 aa  625  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  59.93 
 
 
585 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  59.96 
 
 
587 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1463  NAD synthetase  61.32 
 
 
572 aa  612  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00661124  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  58.88 
 
 
587 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1377  NAD synthetase  59.49 
 
 
569 aa  610  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  59.03 
 
 
585 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.235816 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1225  NAD synthetase  57.99 
 
 
583 aa  596  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410513  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0982  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  56.08 
 
 
552 aa  590  1e-167  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  50.99 
 
 
560 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2943  NAD synthetase  56.76 
 
 
556 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1008  NAD synthetase  54.66 
 
 
554 aa  542  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.535669  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2333  NAD synthetase  54.48 
 
 
554 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0853  NAD synthetase  51.91 
 
 
556 aa  538  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1593  NAD synthetase  54.11 
 
 
554 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.635718  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  53.54 
 
 
550 aa  528  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  52.35 
 
 
554 aa  521  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  52.17 
 
 
554 aa  518  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3346  NAD synthetase  50.64 
 
 
552 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0601  NAD synthetase  51.19 
 
 
557 aa  512  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  50.18 
 
 
564 aa  515  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  51.44 
 
 
552 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2278  NAD synthetase  51.74 
 
 
553 aa  509  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  49.73 
 
 
545 aa  504  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  49.54 
 
 
538 aa  504  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  48.09 
 
 
540 aa  501  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  48.77 
 
 
565 aa  501  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  50.09 
 
 
564 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  48.29 
 
 
540 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  50.09 
 
 
546 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  49.82 
 
 
561 aa  498  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  49.56 
 
 
562 aa  498  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  50.73 
 
 
543 aa  496  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  48.29 
 
 
540 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  48.29 
 
 
540 aa  496  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4875  NAD+ synthetase  51.64 
 
 
559 aa  496  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  48.26 
 
 
539 aa  495  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  50.18 
 
 
541 aa  490  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  47.83 
 
 
577 aa  489  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  47.56 
 
 
552 aa  486  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  48.91 
 
 
535 aa  487  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  46.69 
 
 
539 aa  481  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  50.09 
 
 
537 aa  478  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  48.19 
 
 
556 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  45.27 
 
 
542 aa  476  1e-133  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  50.82 
 
 
549 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  50.82 
 
 
549 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  50.91 
 
 
539 aa  473  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  45.09 
 
 
542 aa  473  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  49.47 
 
 
566 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  48.78 
 
 
572 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  47.44 
 
 
538 aa  474  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  50.26 
 
 
566 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  47.96 
 
 
554 aa  475  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  50.26 
 
 
566 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  48.44 
 
 
542 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  50.26 
 
 
566 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  50.26 
 
 
566 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  50.26 
 
 
566 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  50.26 
 
 
609 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  49.56 
 
 
559 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  50.26 
 
 
609 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  49.47 
 
 
547 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  45.8 
 
 
567 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2322  NAD synthetase  48.62 
 
 
576 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509077  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5739  NAD synthetase  48.42 
 
 
568 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.630816  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  43.88 
 
 
545 aa  468  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0882  NAD synthetase  49.29 
 
 
561 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  47.63 
 
 
540 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  45.62 
 
 
567 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1800  NAD synthetase  48.08 
 
 
572 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2412  NAD synthetase  48.08 
 
 
572 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  48.15 
 
 
566 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  48.32 
 
 
562 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2457  NAD synthetase  48.44 
 
 
576 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0627806  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  48.02 
 
 
545 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  48.2 
 
 
546 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  47.48 
 
 
545 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  49.55 
 
 
577 aa  461  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  47.53 
 
 
561 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2238  NAD+ synthetase  50.99 
 
 
538 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.695951  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  47.31 
 
 
545 aa  456  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  47.49 
 
 
545 aa  458  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  45.28 
 
 
566 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  47.4 
 
 
544 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  44.43 
 
 
566 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  45.01 
 
 
566 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>