More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3421 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3421  NAD synthetase  100 
 
 		 273 aa  565  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3482  NAD synthetase  97.8 
 
 		 273 aa  551  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000292303 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3754  NAD synthetase  82.05 
 
 		 273 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.583588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0652  NAD synthetase  81.32 
 
 		 273 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2862  NAD synthetase  79.48 
 
 		 271 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158436  hitchhiker  0.000000740071 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2228  NAD synthetase  76.19 
 
 		 273 aa  448  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.529939  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2118  NAD+ synthetase  59.49 
 
 		 283 aa  330  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1813  NAD synthetase  57.25 
 
 		 277 aa  315  8e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.501702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0247  NAD+ synthetase  54.05 
 
 		 261 aa  301  1e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0701  NAD synthetase  52.99 
 
 		 278 aa  300  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000652237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1279  NAD synthetase  52.61 
 
 		 276 aa  289  3e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.610842  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0524  NAD synthetase  51.87 
 
 		 283 aa  288  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00084684  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0810  NAD synthetase  51.49 
 
 		 277 aa  284  9e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00066605  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0564  NAD synthetase  52.99 
 
 		 277 aa  281  1e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.514395  normal  0.335445 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0857  NAD synthetase  51.87 
 
 		 277 aa  273  3e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4289  NAD+ synthetase  47.13 
 
 		 622 aa  238  8e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967523  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1348  NAD+ synthetase  43.78 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0851  NAD(+) synthase  46.89 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0125  NAD+ synthetase  41.53 
 
 		 250 aa  211  7e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0275  NAD+ synthetase  41.7 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  41.02 
 
 		 265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0900  NAD synthetase  41.2 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.953423  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  42.91 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  39.33 
 
 		 285 aa  186  4e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1200  NAD synthetase  40.5 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0831  NAD synthetase  40.08 
 
 		 246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0228382  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0901  NAD synthetase  40.08 
 
 		 246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  45.77 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1025  NAD+ synthetase  35.83 
 
 		 247 aa  178  7e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0594  NAD+ synthetase  45.24 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0895907  normal  0.216266 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0229  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  45.89 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1324  NAD+ synthetase  43.81 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.873585  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0662  NAD+ synthetase  42.6 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0164353  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1078  NAD+ synthetase  37.9 
 
 		 248 aa  171  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  39.45 
 
 		 263 aa  169  6e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1352  NAD synthetase  37.86 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280388  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  37.84 
 
 		 281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0090  NAD synthetase  37.86 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.670089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0476  NAD+ synthetase  39.92 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2846  NAD+ synthetase  40.16 
 
 		 264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165139  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  39.41 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  40.36 
 
 		 546 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  40.16 
 
 		 543 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1444  NAD+ synthetase  37.71 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  36.78 
 
 		 546 aa  159  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.91 
 
 		 591 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0182  NAD+ synthetase  38.67 
 
 		 526 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  39.25 
 
 		 591 aa  156  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  41.44 
 
 		 584 aa  156  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  36.5 
 
 		 567 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3513  NAD+ synthetase  36.23 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1161  NAD synthetase  36.86 
 
 		 277 aa  153  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  38.64 
 
 		 543 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  40.23 
 
 		 553 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2601  NAD+ synthetase  40.51 
 
 		 245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  36.06 
 
 		 557 aa  151  8.999999999999999e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  39.02 
 
 		 577 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  39.33 
 
 		 567 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  38.35 
 
 		 556 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0307  NAD+ synthetase  39.34 
 
 		 569 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.770204  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  36.98 
 
 		 583 aa  150  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  35.14 
 
 		 560 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0822  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  35.14 
 
 		 505 aa  150  3e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  35.88 
 
 		 575 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  36.88 
 
 		 561 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0296  NAD+ synthetase  39.34 
 
 		 569 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  34.94 
 
 		 559 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  39.02 
 
 		 540 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  36.88 
 
 		 561 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  35.69 
 
 		 550 aa  149  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  38.21 
 
 		 545 aa  149  6e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0285  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  38.97 
 
 		 569 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.210766  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  38.21 
 
 		 545 aa  148  7e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  38.52 
 
 		 540 aa  149  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  38.52 
 
 		 540 aa  149  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  38.52 
 
 		 540 aa  148  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  37.41 
 
 		 560 aa  148  7e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  37.55 
 
 		 540 aa  148  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  36.3 
 
 		 574 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  37.78 
 
 		 540 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19800  NAD+ synthetase  40.08 
 
 		 268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.497011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  35.19 
 
 		 576 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  38.18 
 
 		 564 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  36.06 
 
 		 573 aa  147  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  35.32 
 
 		 550 aa  146  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  38.06 
 
 		 577 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  38.29 
 
 		 539 aa  146  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  35.87 
 
 		 559 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  34.81 
 
 		 576 aa  145  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  35.51 
 
 		 559 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.78 
 
 		 597 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  38.58 
 
 		 577 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  37.45 
 
 		 554 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  35.14 
 
 		 559 aa  145  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  37.08 
 
 		 611 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  38.29 
 
 		 582 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0261  NAD+ synthase  33.59 
 
 		 505 aa  144  2e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0371022  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  36.76 
 
 		 547 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  35.88 
 
 		 544 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  37.1 
 
 		 587 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>