More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2228 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2228  NAD synthetase  100 
 
 
273 aa  567  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.529939  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3754  NAD synthetase  78.02 
 
 
273 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.583588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0652  NAD synthetase  77.66 
 
 
273 aa  448  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3482  NAD synthetase  75.82 
 
 
273 aa  448  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000292303 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3421  NAD synthetase  76.19 
 
 
273 aa  448  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2862  NAD synthetase  75.46 
 
 
271 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158436  hitchhiker  0.000000740071 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2118  NAD+ synthetase  59.78 
 
 
283 aa  335  5e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0701  NAD synthetase  55.97 
 
 
278 aa  311  4.999999999999999e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000652237  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1813  NAD synthetase  56.34 
 
 
277 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.501702  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0247  NAD+ synthetase  55.98 
 
 
261 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1279  NAD synthetase  54.48 
 
 
276 aa  301  6.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.610842  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0810  NAD synthetase  52.24 
 
 
277 aa  292  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00066605  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0857  NAD synthetase  53.73 
 
 
277 aa  291  7e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0524  NAD synthetase  51.12 
 
 
283 aa  285  4e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00084684  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0564  NAD synthetase  52.61 
 
 
277 aa  282  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.514395  normal  0.335445 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4289  NAD+ synthetase  46.95 
 
 
622 aa  230  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967523  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1348  NAD+ synthetase  44.26 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0275  NAD+ synthetase  45.76 
 
 
289 aa  219  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0851  NAD(+) synthase  44.72 
 
 
257 aa  218  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0125  NAD+ synthetase  41.94 
 
 
250 aa  210  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  40.32 
 
 
265 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  43.32 
 
 
263 aa  194  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  38.95 
 
 
285 aa  194  1e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0900  NAD synthetase  38.8 
 
 
246 aa  191  9e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.953423  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1025  NAD+ synthetase  36.84 
 
 
247 aa  186  4e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0901  NAD synthetase  39.76 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0831  NAD synthetase  39.76 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0228382  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1078  NAD+ synthetase  38.15 
 
 
248 aa  183  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0594  NAD+ synthetase  44.2 
 
 
258 aa  182  6e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0895907  normal  0.216266 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1200  NAD synthetase  38.71 
 
 
246 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0090  NAD synthetase  40.82 
 
 
277 aa  180  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.670089  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  39.1 
 
 
258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1352  NAD synthetase  39.09 
 
 
275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280388  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1324  NAD+ synthetase  43.75 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.873585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0229  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.38 
 
 
258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  39.83 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  40.32 
 
 
543 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  39.37 
 
 
263 aa  171  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  39.16 
 
 
546 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0476  NAD+ synthetase  39.59 
 
 
264 aa  169  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2846  NAD+ synthetase  40.33 
 
 
264 aa  169  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165139  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  38.82 
 
 
281 aa  168  9e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0662  NAD+ synthetase  36.61 
 
 
254 aa  167  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0164353  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3513  NAD+ synthetase  37.08 
 
 
302 aa  165  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.15 
 
 
591 aa  158  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  38.26 
 
 
546 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  38.64 
 
 
543 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1197  NAD+ synthetase  41.1 
 
 
238 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  39.34 
 
 
611 aa  156  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1161  NAD synthetase  36.84 
 
 
277 aa  156  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  39.18 
 
 
540 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  36.67 
 
 
557 aa  156  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2601  NAD+ synthetase  42.93 
 
 
245 aa  156  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  39.18 
 
 
540 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0182  NAD+ synthetase  37.5 
 
 
526 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  39.18 
 
 
540 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  37.69 
 
 
540 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1444  NAD+ synthetase  38.14 
 
 
279 aa  154  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  37.64 
 
 
545 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  38.26 
 
 
591 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  36.23 
 
 
567 aa  154  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  38.06 
 
 
553 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  37.17 
 
 
583 aa  152  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1353  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.3 
 
 
251 aa  152  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000287377 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  38.15 
 
 
540 aa  152  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5739  NAD synthetase  36.26 
 
 
568 aa  152  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.630816  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  37.26 
 
 
545 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  38.02 
 
 
546 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2322  NAD synthetase  35.9 
 
 
576 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509077  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  37.04 
 
 
550 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  35.74 
 
 
560 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  40.08 
 
 
571 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3346  NAD synthetase  38.28 
 
 
552 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1454  NAD+ synthetase  40.41 
 
 
263 aa  151  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.770644 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  39.25 
 
 
540 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  35.07 
 
 
576 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  35.9 
 
 
572 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1800  NAD synthetase  36.63 
 
 
572 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2412  NAD synthetase  36.63 
 
 
572 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0526  NAD+ synthetase  39.37 
 
 
263 aa  149  4e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313435  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  35.06 
 
 
576 aa  149  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  35.34 
 
 
583 aa  149  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  35.36 
 
 
566 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0882  NAD synthetase  37 
 
 
561 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  38.11 
 
 
577 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  36.67 
 
 
550 aa  149  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  35.36 
 
 
609 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  37.88 
 
 
571 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  35.36 
 
 
609 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  35.36 
 
 
566 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  35.36 
 
 
566 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  34.64 
 
 
566 aa  148  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  35.36 
 
 
566 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  35.36 
 
 
566 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0822  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  34.8 
 
 
505 aa  148  9e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1463  NAD synthetase  36.1 
 
 
572 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00661124  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2457  NAD synthetase  35 
 
 
576 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0627806  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  37.23 
 
 
544 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  38.43 
 
 
556 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  36.59 
 
 
564 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>