More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0652 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0652  NAD synthetase  100 
 
 
273 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3754  NAD synthetase  85.35 
 
 
273 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.583588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2862  NAD synthetase  85.45 
 
 
271 aa  484  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158436  hitchhiker  0.000000740071 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3482  NAD synthetase  80.95 
 
 
273 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000292303 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3421  NAD synthetase  81.32 
 
 
273 aa  462  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2228  NAD synthetase  77.66 
 
 
273 aa  448  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.529939  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2118  NAD+ synthetase  62.77 
 
 
283 aa  346  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0701  NAD synthetase  54.65 
 
 
278 aa  308  4e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000652237  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1813  NAD synthetase  56.72 
 
 
277 aa  308  4e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.501702  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0247  NAD+ synthetase  55.6 
 
 
261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1279  NAD synthetase  56.02 
 
 
276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.610842  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0810  NAD synthetase  54.1 
 
 
277 aa  298  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00066605  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0524  NAD synthetase  53.36 
 
 
283 aa  296  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00084684  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0564  NAD synthetase  55.6 
 
 
277 aa  296  3e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.514395  normal  0.335445 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0857  NAD synthetase  54.1 
 
 
277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4289  NAD+ synthetase  48.09 
 
 
622 aa  239  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967523  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0851  NAD(+) synthase  47.62 
 
 
257 aa  233  3e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1348  NAD+ synthetase  44.98 
 
 
267 aa  224  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0125  NAD+ synthetase  43.55 
 
 
250 aa  219  3e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  41.57 
 
 
285 aa  202  5e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0275  NAD+ synthetase  41.33 
 
 
289 aa  202  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  42.86 
 
 
265 aa  199  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0900  NAD synthetase  41.6 
 
 
246 aa  196  3e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.953423  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  47.12 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  43.72 
 
 
263 aa  194  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0594  NAD+ synthetase  46.63 
 
 
258 aa  192  4e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0895907  normal  0.216266 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1078  NAD+ synthetase  41.18 
 
 
248 aa  192  4e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0901  NAD synthetase  41.06 
 
 
246 aa  191  8e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0831  NAD synthetase  41.06 
 
 
246 aa  191  8e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0228382  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1324  NAD+ synthetase  46.63 
 
 
258 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.873585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0229  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  48.26 
 
 
258 aa  190  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1200  NAD synthetase  40.24 
 
 
246 aa  189  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1025  NAD+ synthetase  38.75 
 
 
247 aa  188  9e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0090  NAD synthetase  41.98 
 
 
277 aa  185  9e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.670089  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  42.19 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0662  NAD+ synthetase  45.71 
 
 
254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0164353  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0476  NAD+ synthetase  41.39 
 
 
264 aa  178  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1352  NAD synthetase  40.57 
 
 
275 aa  178  8e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280388  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  41 
 
 
263 aa  176  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  40.78 
 
 
281 aa  176  3e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2846  NAD+ synthetase  40.42 
 
 
264 aa  176  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165139  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1444  NAD+ synthetase  40.68 
 
 
279 aa  167  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  40.98 
 
 
553 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  38.4 
 
 
546 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  36.43 
 
 
550 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  39.71 
 
 
546 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  36.06 
 
 
550 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  40.57 
 
 
543 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1161  NAD synthetase  38.11 
 
 
277 aa  159  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  36.06 
 
 
559 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2601  NAD+ synthetase  47.8 
 
 
245 aa  159  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.15 
 
 
577 aa  159  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19800  NAD+ synthetase  39.08 
 
 
268 aa  159  7e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.497011  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  36.4 
 
 
554 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.53 
 
 
591 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1454  NAD+ synthetase  41.3 
 
 
263 aa  158  1e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.770644 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2475  NAD+ synthetase  37.11 
 
 
284 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0526  NAD+ synthetase  40.15 
 
 
263 aa  157  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313435  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3513  NAD+ synthetase  41.18 
 
 
302 aa  156  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  34.78 
 
 
560 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  37.09 
 
 
543 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  37.96 
 
 
591 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  35.51 
 
 
559 aa  155  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  39.47 
 
 
611 aa  155  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  37.86 
 
 
587 aa  155  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  36.43 
 
 
557 aa  155  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15651  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  36.08 
 
 
576 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.873266  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1302  NAD synthetase  39.09 
 
 
269 aa  154  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.120392  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  36.88 
 
 
583 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1463  NAD synthetase  34.78 
 
 
572 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00661124  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  36.3 
 
 
574 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  35.93 
 
 
576 aa  152  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  36.4 
 
 
567 aa  152  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  36.55 
 
 
560 aa  152  5e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  36.4 
 
 
567 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  37.96 
 
 
571 aa  152  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0248  NAD synthetase  40.74 
 
 
270 aa  151  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0822  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  35.16 
 
 
505 aa  151  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  38.35 
 
 
540 aa  150  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  36.26 
 
 
576 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  37.78 
 
 
556 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1657  NAD+ synthetase  40.1 
 
 
241 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251103  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  34.94 
 
 
576 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1435  NAD+ synthetase  38.15 
 
 
529 aa  150  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0116683  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  36.16 
 
 
583 aa  149  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3277  NAD+ synthetase  37.69 
 
 
554 aa  149  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  39.03 
 
 
567 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  34.06 
 
 
559 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1488  NAD+ synthetase  40.53 
 
 
553 aa  149  6e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  39.92 
 
 
584 aa  149  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  35.14 
 
 
559 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1197  NAD+ synthetase  40.25 
 
 
238 aa  149  7e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19030  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.1 
 
 
247 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0182  NAD+ synthetase  35.98 
 
 
526 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  35.5 
 
 
575 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  36.86 
 
 
599 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5739  NAD synthetase  34.64 
 
 
568 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.630816  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  35.32 
 
 
562 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1353  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  41.06 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000287377 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  34.94 
 
 
566 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>