More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0857 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0857  NAD synthetase  100 
 
 		 277 aa  567  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0564  NAD synthetase  79.78 
 
 		 277 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.514395  normal  0.335445 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0810  NAD synthetase  77.98 
 
 		 277 aa  448  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00066605  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0524  NAD synthetase  77.45 
 
 		 283 aa  443  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00084684  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1279  NAD synthetase  75.27 
 
 		 276 aa  433  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.610842  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1813  NAD synthetase  74.01 
 
 		 277 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.501702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0701  NAD synthetase  72.86 
 
 		 278 aa  408  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000652237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2228  NAD synthetase  53.73 
 
 		 273 aa  291  7e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.529939  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3754  NAD synthetase  53.73 
 
 		 273 aa  288  9e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.583588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0652  NAD synthetase  54.1 
 
 		 273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2118  NAD+ synthetase  54.95 
 
 		 283 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3482  NAD synthetase  52.24 
 
 		 273 aa  274  9e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000292303 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2862  NAD synthetase  51.5 
 
 		 271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158436  hitchhiker  0.000000740071 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3421  NAD synthetase  51.87 
 
 		 273 aa  273  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1348  NAD+ synthetase  45.42 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0247  NAD+ synthetase  46.22 
 
 		 261 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0851  NAD(+) synthase  46.59 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0125  NAD+ synthetase  45.88 
 
 		 250 aa  211  9e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1078  NAD+ synthetase  44.09 
 
 		 248 aa  202  6e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0275  NAD+ synthetase  43.54 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4289  NAD+ synthetase  42.21 
 
 		 622 aa  195  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967523  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  38.2 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0901  NAD synthetase  44.58 
 
 		 246 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0831  NAD synthetase  44.58 
 
 		 246 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0228382  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  43.53 
 
 		 546 aa  188  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  43.41 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1200  NAD synthetase  43.33 
 
 		 246 aa  186  5e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  41.5 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1025  NAD+ synthetase  41.09 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0662  NAD+ synthetase  43.46 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0164353  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2846  NAD+ synthetase  38.82 
 
 		 264 aa  179  5.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165139  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  38.71 
 
 		 246 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  42.68 
 
 		 263 aa  179  5.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0900  NAD synthetase  40.4 
 
 		 246 aa  175  7e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.953423  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1352  NAD synthetase  37.97 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280388  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0090  NAD synthetase  36.68 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.670089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0476  NAD+ synthetase  40.25 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1444  NAD+ synthetase  41.53 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  44.28 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0229  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.63 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1324  NAD+ synthetase  43.78 
 
 		 258 aa  165  8e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.873585  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  40 
 
 		 554 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0594  NAD+ synthetase  43.28 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0895907  normal  0.216266 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  40.16 
 
 		 546 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  38.87 
 
 		 591 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1353  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  42.27 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000287377 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  37.25 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  42.13 
 
 		 543 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3513  NAD+ synthetase  35.02 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  37.74 
 
 		 576 aa  158  8e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  37.41 
 
 		 545 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  37.74 
 
 		 576 aa  157  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  37.41 
 
 		 545 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2601  NAD+ synthetase  43.84 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1197  NAD+ synthetase  42.22 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  37.22 
 
 		 546 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  37.87 
 
 		 557 aa  157  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  37.36 
 
 		 560 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  38.7 
 
 		 545 aa  155  9e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1454  NAD+ synthetase  39.84 
 
 		 263 aa  155  9e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.770644 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  38.11 
 
 		 559 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  39.06 
 
 		 540 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  37.73 
 
 		 574 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  39.37 
 
 		 556 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.62 
 
 		 577 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1161  NAD synthetase  35.39 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0793  NAD synthetase  38.98 
 
 		 276 aa  152  4e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0217  NAD+ synthetase  37.98 
 
 		 554 aa  153  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  40.89 
 
 		 571 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0716  NAD synthetase  41.96 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.866923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  36.86 
 
 		 560 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  36.9 
 
 		 576 aa  151  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  37.5 
 
 		 561 aa  151  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0182  NAD+ synthetase  38.1 
 
 		 526 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2901  NAD+ synthetase  39.57 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  35.94 
 
 		 566 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3346  NAD synthetase  35.38 
 
 		 552 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  38.01 
 
 		 543 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  38.13 
 
 		 564 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0526  NAD+ synthetase  39.84 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313435  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1463  NAD synthetase  36.23 
 
 		 572 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00661124  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  34.83 
 
 		 583 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  38.11 
 
 		 553 aa  149  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  35.14 
 
 		 567 aa  149  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1044  NAD+ synthetase  36.64 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1302  NAD synthetase  40.37 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.120392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  41.84 
 
 		 567 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  38.21 
 
 		 577 aa  149  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  37.34 
 
 		 599 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  36.23 
 
 		 585 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0572  NAD+ synthetase  36.3 
 
 		 552 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323116  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  39.45 
 
 		 540 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  35.04 
 
 		 542 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  36.68 
 
 		 566 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  36.06 
 
 		 554 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0982  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  36.12 
 
 		 552 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19030  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  41.35 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  36.78 
 
 		 566 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  36.15 
 
 		 561 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  36.78 
 
 		 609 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>