More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2862 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2862  NAD synthetase  100 
 
 		 271 aa  560  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158436  hitchhiker  0.000000740071 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0652  NAD synthetase  85.45 
 
 		 273 aa  484  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3754  NAD synthetase  82.84 
 
 		 273 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.583588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3421  NAD synthetase  79.48 
 
 		 273 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3482  NAD synthetase  79.48 
 
 		 273 aa  447  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000292303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2228  NAD synthetase  75.46 
 
 		 273 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.529939  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2118  NAD+ synthetase  60.66 
 
 		 283 aa  337  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1813  NAD synthetase  54.51 
 
 		 277 aa  298  6e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.501702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0701  NAD synthetase  52.06 
 
 		 278 aa  294  1e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000652237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0247  NAD+ synthetase  53.15 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1279  NAD synthetase  52.43 
 
 		 276 aa  289  4e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.610842  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0524  NAD synthetase  50.75 
 
 		 283 aa  286  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00084684  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0564  NAD synthetase  53.56 
 
 		 277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.514395  normal  0.335445 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0810  NAD synthetase  52.71 
 
 		 277 aa  285  7e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00066605  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0857  NAD synthetase  51.5 
 
 		 277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4289  NAD+ synthetase  45.95 
 
 		 622 aa  231  8.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967523  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1348  NAD+ synthetase  45.34 
 
 		 267 aa  228  6e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0851  NAD(+) synthase  48.12 
 
 		 257 aa  225  7e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0125  NAD+ synthetase  42.74 
 
 		 250 aa  221  7e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  44 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0900  NAD synthetase  42.4 
 
 		 246 aa  204  2e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.953423  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  41.35 
 
 		 285 aa  203  3e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0275  NAD+ synthetase  40.74 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  47.44 
 
 		 258 aa  198  7e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0594  NAD+ synthetase  45 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0895907  normal  0.216266 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  44.13 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0229  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  45.42 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0901  NAD synthetase  42.04 
 
 		 246 aa  192  4e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0831  NAD synthetase  42.04 
 
 		 246 aa  192  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0228382  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1324  NAD+ synthetase  43.62 
 
 		 258 aa  192  6e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.873585  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1200  NAD synthetase  42.15 
 
 		 246 aa  191  8e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1078  NAD+ synthetase  40.24 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0662  NAD+ synthetase  41.9 
 
 		 254 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0164353  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  41.53 
 
 		 246 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1025  NAD+ synthetase  38.75 
 
 		 247 aa  185  6e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  40.94 
 
 		 281 aa  184  9e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0090  NAD synthetase  41.87 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.670089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1352  NAD synthetase  39.09 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280388  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2846  NAD+ synthetase  41.35 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165139  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0476  NAD+ synthetase  39.92 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  39.68 
 
 		 263 aa  172  6.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1444  NAD+ synthetase  39.83 
 
 		 279 aa  169  5e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1161  NAD synthetase  37.55 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  37.32 
 
 		 546 aa  162  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3513  NAD+ synthetase  38.01 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  37.04 
 
 		 543 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  36.33 
 
 		 546 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  39.34 
 
 		 543 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  37.5 
 
 		 560 aa  155  4e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2601  NAD+ synthetase  46.28 
 
 		 245 aa  155  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19030  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  38.33 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0182  NAD+ synthetase  36.36 
 
 		 526 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  38.35 
 
 		 611 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2475  NAD+ synthetase  36.25 
 
 		 284 aa  153  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  35.32 
 
 		 550 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1353  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.09 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000287377 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1454  NAD+ synthetase  39.68 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.770644 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1302  NAD synthetase  37.45 
 
 		 269 aa  152  7e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.120392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  35.96 
 
 		 576 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0248  NAD synthetase  41.56 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0966  NAD+ synthetase  39.19 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0240319 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  37.23 
 
 		 553 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  35.32 
 
 		 557 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0526  NAD+ synthetase  38.82 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313435  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0822  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  36.4 
 
 		 505 aa  150  2e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  34.94 
 
 		 550 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  37.94 
 
 		 540 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  37.5 
 
 		 540 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  34.78 
 
 		 560 aa  149  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  35.93 
 
 		 576 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  37.5 
 
 		 540 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  37.5 
 
 		 540 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  34.78 
 
 		 559 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  34.2 
 
 		 559 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  37.88 
 
 		 540 aa  149  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19800  NAD+ synthetase  39.67 
 
 		 268 aa  149  7e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.497011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1197  NAD+ synthetase  39.74 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  37.12 
 
 		 591 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15651  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  34.63 
 
 		 576 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.873266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  35.64 
 
 		 566 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  34.66 
 
 		 567 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1801  NAD+ synthetase  42.05 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431835 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  34.66 
 
 		 567 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  39.02 
 
 		 591 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  33.58 
 
 		 574 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  37.83 
 
 		 567 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2324  NAD+ synthetase  40.38 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  37.55 
 
 		 587 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  35.34 
 
 		 583 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  35.82 
 
 		 567 aa  146  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  35.11 
 
 		 575 aa  145  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  36.36 
 
 		 540 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  34.19 
 
 		 576 aa  145  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  35.85 
 
 		 583 aa  144  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1657  NAD+ synthetase  37.12 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251103  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  36.36 
 
 		 556 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2322  NAD synthetase  35.79 
 
 		 576 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  38.7 
 
 		 584 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0793  NAD synthetase  38.62 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  37.5 
 
 		 571 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>