More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0900 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0900  NAD synthetase  100 
 
 
246 aa  502  1e-141  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.953423  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0901  NAD synthetase  57.14 
 
 
246 aa  284  9e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0831  NAD synthetase  57.14 
 
 
246 aa  284  9e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0228382  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1200  NAD synthetase  55.1 
 
 
246 aa  273  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0125  NAD+ synthetase  54.39 
 
 
250 aa  269  4e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1025  NAD+ synthetase  51.85 
 
 
247 aa  254  8e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0851  NAD(+) synthase  48.99 
 
 
257 aa  227  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3754  NAD synthetase  42.8 
 
 
273 aa  209  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.583588  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1078  NAD+ synthetase  47.96 
 
 
248 aa  207  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1348  NAD+ synthetase  43.44 
 
 
267 aa  204  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2862  NAD synthetase  42.4 
 
 
271 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158436  hitchhiker  0.000000740071 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0652  NAD synthetase  41.6 
 
 
273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2118  NAD+ synthetase  41.96 
 
 
283 aa  195  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3482  NAD synthetase  40.8 
 
 
273 aa  192  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000292303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2228  NAD synthetase  38.8 
 
 
273 aa  191  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.529939  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3421  NAD synthetase  41.2 
 
 
273 aa  191  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0247  NAD+ synthetase  39.84 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0701  NAD synthetase  38.4 
 
 
278 aa  186  4e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000652237  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1279  NAD synthetase  40 
 
 
276 aa  185  7e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.610842  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1813  NAD synthetase  38.8 
 
 
277 aa  182  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.501702  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0810  NAD synthetase  39.2 
 
 
277 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00066605  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0524  NAD synthetase  37.2 
 
 
283 aa  177  9e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00084684  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0564  NAD synthetase  41.2 
 
 
277 aa  176  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.514395  normal  0.335445 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0857  NAD synthetase  40.4 
 
 
277 aa  175  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  39.2 
 
 
263 aa  175  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0662  NAD+ synthetase  39.61 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0164353  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  41.03 
 
 
263 aa  172  5e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  39.45 
 
 
265 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  39.32 
 
 
258 aa  162  6e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4289  NAD+ synthetase  38.37 
 
 
622 aa  160  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967523  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2324  NAD+ synthetase  43.14 
 
 
248 aa  159  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1302  NAD synthetase  38.55 
 
 
269 aa  155  4e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.120392  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0594  NAD+ synthetase  39.82 
 
 
258 aa  155  7e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0895907  normal  0.216266 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0229  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.17 
 
 
258 aa  154  9e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  37.92 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1324  NAD+ synthetase  38.46 
 
 
258 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.873585  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19030  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  37.27 
 
 
247 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3277  NAD+ synthetase  39.17 
 
 
554 aa  149  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1366  NAD+ synthetase  34.45 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1197  NAD+ synthetase  38.94 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2601  NAD+ synthetase  36.05 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0966  NAD+ synthetase  39.04 
 
 
237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0240319 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1353  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  38.94 
 
 
251 aa  146  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000287377 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2828  NAD+ synthetase  37.4 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  37.92 
 
 
567 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  31.89 
 
 
285 aa  145  5e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1444  NAD+ synthetase  35.62 
 
 
279 aa  144  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1657  NAD+ synthetase  41.75 
 
 
241 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251103  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  33.99 
 
 
281 aa  142  4e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1352  NAD synthetase  34.69 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280388  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1801  NAD+ synthetase  35.83 
 
 
250 aa  139  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431835 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1409  NAD synthetase  41.44 
 
 
561 aa  139  3.9999999999999997e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2846  NAD+ synthetase  36.44 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165139  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0476  NAD+ synthetase  38.35 
 
 
264 aa  138  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0182  NAD+ synthetase  34.94 
 
 
526 aa  138  7.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1635  NAD+ synthetase  34.48 
 
 
243 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.35662  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0097  NAD+ synthetase  34.44 
 
 
268 aa  137  1e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0090  NAD synthetase  33.06 
 
 
277 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.670089  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0310  NAD synthetase  37.6 
 
 
267 aa  137  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.737359  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  37.55 
 
 
575 aa  136  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  38.16 
 
 
543 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2526  NAD+ synthetase  39.44 
 
 
246 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  38.59 
 
 
561 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  38.59 
 
 
561 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  35.77 
 
 
566 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  36.8 
 
 
553 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0217  NAD+ synthetase  39.13 
 
 
554 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0922  NAD+ synthetase  34.58 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0793  NAD synthetase  34.41 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1161  NAD synthetase  37.5 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1454  NAD+ synthetase  35 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.770644 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0283  NAD+ synthetase  32.81 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000382877  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  34.35 
 
 
574 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  36.17 
 
 
546 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3513  NAD+ synthetase  33.6 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0526  NAD+ synthetase  34.72 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313435  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  34.82 
 
 
576 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  38 
 
 
597 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2901  NAD+ synthetase  41.04 
 
 
304 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19800  NAD+ synthetase  32.69 
 
 
268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.497011  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0798  NAD+ synthetase  33.9 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  34.41 
 
 
576 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  35.6 
 
 
591 aa  126  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0716  NAD synthetase  33.47 
 
 
264 aa  126  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.866923 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0284  NAD+ synthetase  30.96 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  37.83 
 
 
540 aa  125  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  37.5 
 
 
560 aa  125  6e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11710  NAD+ synthetase  36.58 
 
 
276 aa  125  8.000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.996966  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1437  NAD+ synthetase  35.37 
 
 
249 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.541928  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl521  NH3-dependent NAD+ synthetase  34.6 
 
 
244 aa  124  2e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2475  NAD+ synthetase  35.44 
 
 
284 aa  123  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  35.68 
 
 
560 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2524  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  34.76 
 
 
556 aa  122  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  33.63 
 
 
554 aa  122  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0275  NAD+ synthetase  30.65 
 
 
289 aa  122  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  34.78 
 
 
550 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  34.35 
 
 
536 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  35.42 
 
 
561 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  37.2 
 
 
576 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  34.06 
 
 
571 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>