More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0524 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0524  NAD synthetase  100 
 
 
283 aa  574  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00084684  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0857  NAD synthetase  77.45 
 
 
277 aa  443  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0810  NAD synthetase  74.91 
 
 
277 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00066605  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0564  NAD synthetase  73.09 
 
 
277 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.514395  normal  0.335445 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1279  NAD synthetase  70.96 
 
 
276 aa  410  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.610842  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1813  NAD synthetase  71.64 
 
 
277 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.501702  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0701  NAD synthetase  69.85 
 
 
278 aa  397  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000652237  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3754  NAD synthetase  52.99 
 
 
273 aa  298  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.583588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0652  NAD synthetase  53.36 
 
 
273 aa  296  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2118  NAD+ synthetase  54.58 
 
 
283 aa  296  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3482  NAD synthetase  52.24 
 
 
273 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000292303 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3421  NAD synthetase  51.87 
 
 
273 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2862  NAD synthetase  50.75 
 
 
271 aa  286  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158436  hitchhiker  0.000000740071 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2228  NAD synthetase  51.12 
 
 
273 aa  285  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.529939  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0247  NAD+ synthetase  46.48 
 
 
261 aa  242  5e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1348  NAD+ synthetase  44.22 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0851  NAD(+) synthase  46.18 
 
 
257 aa  225  7e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0125  NAD+ synthetase  44.44 
 
 
250 aa  209  3e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  40.52 
 
 
285 aa  210  3e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4289  NAD+ synthetase  43.85 
 
 
622 aa  205  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967523  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0275  NAD+ synthetase  43.91 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0901  NAD synthetase  40.64 
 
 
246 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0831  NAD synthetase  40.64 
 
 
246 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0228382  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1078  NAD+ synthetase  41.18 
 
 
248 aa  189  5e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  41.11 
 
 
265 aa  188  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  38.31 
 
 
246 aa  188  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1200  NAD synthetase  40.24 
 
 
246 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0662  NAD+ synthetase  39.5 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0164353  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1025  NAD+ synthetase  37.21 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  38.89 
 
 
263 aa  179  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  37.98 
 
 
281 aa  178  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0900  NAD synthetase  37.2 
 
 
246 aa  177  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.953423  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0090  NAD synthetase  36.43 
 
 
277 aa  175  6e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.670089  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0476  NAD+ synthetase  40.25 
 
 
264 aa  175  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  39.69 
 
 
263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2846  NAD+ synthetase  38.75 
 
 
264 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165139  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1444  NAD+ synthetase  39.47 
 
 
279 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1352  NAD synthetase  36.25 
 
 
275 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280388  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  40.69 
 
 
258 aa  166  5e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1324  NAD+ synthetase  41.18 
 
 
258 aa  165  8e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.873585  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0594  NAD+ synthetase  40.2 
 
 
258 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0895907  normal  0.216266 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0229  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  41.79 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1161  NAD synthetase  37.45 
 
 
277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1302  NAD synthetase  39.92 
 
 
269 aa  160  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.120392  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1454  NAD+ synthetase  39.45 
 
 
263 aa  160  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.770644 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  35.9 
 
 
546 aa  159  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19030  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  41.83 
 
 
247 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  39.93 
 
 
554 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1353  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  45.05 
 
 
251 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000287377 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0526  NAD+ synthetase  38.87 
 
 
263 aa  157  3e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313435  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  38.29 
 
 
560 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0248  NAD synthetase  43.12 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1197  NAD+ synthetase  38.96 
 
 
238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  40 
 
 
540 aa  153  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0793  NAD synthetase  39.37 
 
 
276 aa  152  5e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  38.38 
 
 
576 aa  152  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  38.3 
 
 
591 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  38.06 
 
 
561 aa  151  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  39.77 
 
 
546 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2901  NAD+ synthetase  35.16 
 
 
304 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  39.39 
 
 
567 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  36.26 
 
 
545 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0716  NAD synthetase  38.82 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.866923 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3513  NAD+ synthetase  32.73 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  37.17 
 
 
585 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0310  NAD synthetase  38.61 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.737359  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0966  NAD+ synthetase  35.37 
 
 
237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0240319 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0982  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  36.13 
 
 
552 aa  146  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  36.26 
 
 
546 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  36.26 
 
 
545 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  34.8 
 
 
542 aa  145  8.000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  37.55 
 
 
554 aa  145  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  39 
 
 
577 aa  145  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  35.32 
 
 
559 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  34.96 
 
 
576 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  36.76 
 
 
557 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  37.5 
 
 
543 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  34.8 
 
 
542 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2475  NAD+ synthetase  32.45 
 
 
284 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1463  NAD synthetase  36.16 
 
 
572 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00661124  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  37.55 
 
 
540 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0572  NAD+ synthetase  37.84 
 
 
552 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323116  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  35.32 
 
 
550 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  35.25 
 
 
574 aa  143  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  36.8 
 
 
559 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  37.5 
 
 
567 aa  143  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1044  NAD+ synthetase  36.96 
 
 
268 aa  143  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1657  NAD+ synthetase  36.21 
 
 
241 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251103  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  37.5 
 
 
567 aa  143  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  34.96 
 
 
576 aa  143  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  39.01 
 
 
571 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  36.8 
 
 
587 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  35.93 
 
 
583 aa  142  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  36.8 
 
 
559 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  39.47 
 
 
591 aa  142  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  35.19 
 
 
572 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11710  NAD+ synthetase  38.63 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.996966  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2601  NAD+ synthetase  40.87 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  38.46 
 
 
556 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  36.16 
 
 
559 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>