More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1494 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  100 
 
 
582 aa  1179    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  57.78 
 
 
571 aa  628  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07390  NAD+ synthetase  57.97 
 
 
577 aa  607  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  54.28 
 
 
553 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  53.56 
 
 
598 aa  580  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  54.25 
 
 
599 aa  576  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  52.19 
 
 
591 aa  568  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.85 
 
 
597 aa  559  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  52.93 
 
 
577 aa  552  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  52.2 
 
 
584 aa  553  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3585  NAD+ synthetase  52.37 
 
 
586 aa  547  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  51.95 
 
 
591 aa  547  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1488  NAD+ synthetase  53.34 
 
 
553 aa  544  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  51.77 
 
 
590 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0887  NAD+ synthetase  48.26 
 
 
570 aa  536  1e-151  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1765  NAD+ synthetase  51.33 
 
 
601 aa  533  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  hitchhiker  0.000901061 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  50.25 
 
 
611 aa  528  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4955  NAD+ synthetase  51.1 
 
 
586 aa  524  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3146  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  50.57 
 
 
606 aa  518  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.814025  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0695  putative amidohydrolase  50.17 
 
 
565 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1848  NAD+ synthetase  51.95 
 
 
547 aa  509  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5512  NAD+ synthetase  45.85 
 
 
583 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.362156  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  44.58 
 
 
566 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  44.43 
 
 
566 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  40.93 
 
 
573 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.52 
 
 
566 aa  450  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  46.01 
 
 
546 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  45.26 
 
 
571 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  45.89 
 
 
561 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  39.26 
 
 
574 aa  445  1e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  42.49 
 
 
567 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  41.75 
 
 
583 aa  441  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  45.38 
 
 
556 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  42.66 
 
 
567 aa  434  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  42.37 
 
 
545 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  38.62 
 
 
575 aa  434  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  41.44 
 
 
552 aa  434  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  43.44 
 
 
545 aa  430  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.2 
 
 
543 aa  429  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  42.69 
 
 
576 aa  427  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  43.76 
 
 
539 aa  428  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  45.22 
 
 
540 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  44 
 
 
564 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.54 
 
 
577 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  46.9 
 
 
539 aa  423  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  42.52 
 
 
576 aa  425  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  45.72 
 
 
554 aa  425  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  45.72 
 
 
554 aa  424  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  45.25 
 
 
546 aa  422  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  42.23 
 
 
561 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  42.49 
 
 
540 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  42.49 
 
 
540 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  42.31 
 
 
540 aa  420  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  44.8 
 
 
550 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  44.39 
 
 
538 aa  415  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  40.71 
 
 
566 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  40.93 
 
 
540 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  45.67 
 
 
564 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4875  NAD+ synthetase  44.33 
 
 
559 aa  415  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  44.1 
 
 
554 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.68 
 
 
559 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  42.76 
 
 
587 aa  412  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  42.74 
 
 
539 aa  412  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  45.38 
 
 
545 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  44.43 
 
 
541 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  40 
 
 
542 aa  408  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  44.86 
 
 
545 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  42.37 
 
 
552 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  43.36 
 
 
566 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  39.83 
 
 
542 aa  403  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  40.03 
 
 
543 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2091  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.86 
 
 
550 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  42.2 
 
 
565 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  41.67 
 
 
550 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  42.96 
 
 
537 aa  402  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  42.76 
 
 
559 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  42.25 
 
 
559 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  42.86 
 
 
554 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.32 
 
 
535 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  42.28 
 
 
562 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  40.17 
 
 
536 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0771  hypothetical protein  40.34 
 
 
536 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  41.5 
 
 
550 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  43.65 
 
 
562 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  39.76 
 
 
540 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  43.57 
 
 
577 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  40.65 
 
 
538 aa  395  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  42.52 
 
 
542 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  43.46 
 
 
576 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  41.23 
 
 
559 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  38.44 
 
 
561 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  38.6 
 
 
561 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  38.29 
 
 
561 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  38.29 
 
 
561 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  41.53 
 
 
577 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  43.19 
 
 
567 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  42.15 
 
 
559 aa  389  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  42.81 
 
 
566 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0970  NAD synthetase  42.47 
 
 
573 aa  388  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615743  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1036  NAD+ synthetase  39.43 
 
 
558 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>