More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07390 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  62.41 
 
 
577 aa  694    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.61 
 
 
597 aa  660    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  60.99 
 
 
598 aa  702    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  59.23 
 
 
611 aa  653    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  60.37 
 
 
590 aa  661    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07390  NAD+ synthetase  100 
 
 
577 aa  1158    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3585  NAD+ synthetase  61.43 
 
 
586 aa  668    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  60.34 
 
 
599 aa  675    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  69.57 
 
 
571 aa  802    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  59.59 
 
 
591 aa  655    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  57.41 
 
 
553 aa  645    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  58.74 
 
 
591 aa  653    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1765  NAD+ synthetase  59.4 
 
 
601 aa  639    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  hitchhiker  0.000901061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  57.94 
 
 
584 aa  634  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4955  NAD+ synthetase  59.86 
 
 
586 aa  627  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  57.97 
 
 
582 aa  623  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3146  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  57.07 
 
 
606 aa  621  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.814025  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1488  NAD+ synthetase  55.92 
 
 
553 aa  593  1e-168  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0887  NAD+ synthetase  50.83 
 
 
570 aa  580  1e-164  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0695  putative amidohydrolase  52.09 
 
 
565 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1848  NAD+ synthetase  55.94 
 
 
547 aa  564  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5512  NAD+ synthetase  52.46 
 
 
583 aa  551  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.362156  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  46.39 
 
 
566 aa  488  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.14 
 
 
566 aa  485  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  46.14 
 
 
566 aa  484  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  44.98 
 
 
552 aa  483  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  44.41 
 
 
583 aa  481  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  44.25 
 
 
567 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  42.2 
 
 
573 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  44.43 
 
 
567 aa  468  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  47.9 
 
 
571 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  40.34 
 
 
575 aa  460  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  48.37 
 
 
577 aa  455  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  38.92 
 
 
574 aa  457  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  46.59 
 
 
587 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  43.74 
 
 
545 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  44.5 
 
 
550 aa  451  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  42.66 
 
 
576 aa  449  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  42.66 
 
 
576 aa  451  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  45.11 
 
 
543 aa  449  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  43.52 
 
 
545 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  44.33 
 
 
550 aa  448  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  43.78 
 
 
564 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  45.75 
 
 
561 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  40.7 
 
 
566 aa  442  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  44.31 
 
 
540 aa  442  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  46.98 
 
 
539 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  43.01 
 
 
539 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  41.55 
 
 
542 aa  441  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  43.72 
 
 
559 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  42.83 
 
 
539 aa  435  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  41.38 
 
 
542 aa  438  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  44.29 
 
 
546 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  45.16 
 
 
556 aa  438  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  42.64 
 
 
538 aa  434  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  42.69 
 
 
559 aa  435  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  46.55 
 
 
567 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  42.16 
 
 
561 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  43.78 
 
 
560 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  43.5 
 
 
538 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  42.36 
 
 
540 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.1 
 
 
537 aa  428  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  42.69 
 
 
559 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  42.61 
 
 
554 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  43.4 
 
 
544 aa  426  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  44.41 
 
 
554 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  42.08 
 
 
559 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  44.71 
 
 
549 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  44.71 
 
 
549 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  43.17 
 
 
587 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  42.42 
 
 
577 aa  423  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  44.21 
 
 
554 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  44.48 
 
 
554 aa  423  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1225  NAD synthetase  42.83 
 
 
583 aa  419  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410513  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  45.07 
 
 
543 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0970  NAD synthetase  42.86 
 
 
573 aa  421  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615743  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  44.92 
 
 
576 aa  421  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  44.97 
 
 
550 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  42.36 
 
 
540 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  42.19 
 
 
540 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  42.36 
 
 
540 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  38.82 
 
 
561 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  44.14 
 
 
547 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  42.49 
 
 
583 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  43.15 
 
 
541 aa  418  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  43.62 
 
 
545 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  43.97 
 
 
545 aa  418  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  38.82 
 
 
561 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  40.03 
 
 
543 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  45.01 
 
 
559 aa  414  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  40.17 
 
 
536 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0771  hypothetical protein  39.83 
 
 
536 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  43.71 
 
 
587 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  41.68 
 
 
565 aa  413  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1593  NAD synthetase  44.44 
 
 
554 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.635718  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3217  NAD+ synthetase  40.51 
 
 
557 aa  410  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  42.42 
 
 
585 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3346  NAD synthetase  42.51 
 
 
552 aa  410  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.06 
 
 
535 aa  411  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  41.08 
 
 
562 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>