More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0887 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0695  putative amidohydrolase  74.04 
 
 		 565 aa  825    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0887  NAD+ synthetase  100 
 
 		 570 aa  1166    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  60.87 
 
 		 553 aa  684    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1488  NAD+ synthetase  58.96 
 
 		 553 aa  639    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1848  NAD+ synthetase  54.9 
 
 		 547 aa  585  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  50.59 
 
 		 571 aa  562  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07390  NAD+ synthetase  50.83 
 
 		 577 aa  565  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  50.17 
 
 		 599 aa  558  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  48.26 
 
 		 582 aa  536  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  48.36 
 
 		 591 aa  538  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  46.73 
 
 		 591 aa  525  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  47.28 
 
 		 597 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.33 
 
 		 577 aa  519  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  46.56 
 
 		 598 aa  519  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  47.15 
 
 		 590 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1765  NAD+ synthetase  47.1 
 
 		 601 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  hitchhiker  0.000901061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  45.32 
 
 		 584 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  47.49 
 
 		 611 aa  502  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4955  NAD+ synthetase  48.51 
 
 		 586 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3585  NAD+ synthetase  46.47 
 
 		 586 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3146  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.25 
 
 		 606 aa  489  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.814025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5512  NAD+ synthetase  44.26 
 
 		 583 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.362156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.85 
 
 		 543 aa  441  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  38.71 
 
 		 574 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  43.97 
 
 		 545 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  41.43 
 
 		 566 aa  430  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  43.13 
 
 		 561 aa  429  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  43.08 
 
 		 540 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  42.31 
 
 		 583 aa  427  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  40.16 
 
 		 583 aa  427  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  41.93 
 
 		 566 aa  428  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  38.95 
 
 		 573 aa  424  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  40.88 
 
 		 567 aa  422  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  41.1 
 
 		 566 aa  425  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  40.88 
 
 		 567 aa  423  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  40.55 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  41.03 
 
 		 545 aa  421  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  40.07 
 
 		 552 aa  421  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1225  NAD synthetase  42.14 
 
 		 583 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  41.33 
 
 		 540 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  42.44 
 
 		 554 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  41.38 
 
 		 587 aa  416  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  41.16 
 
 		 540 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  43.13 
 
 		 554 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  43.18 
 
 		 585 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.235816 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  41.33 
 
 		 540 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  42.49 
 
 		 587 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  42.04 
 
 		 546 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  37.46 
 
 		 575 aa  415  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  41.19 
 
 		 540 aa  415  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  41.49 
 
 		 556 aa  413  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  41.03 
 
 		 539 aa  412  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  42.17 
 
 		 577 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  42.19 
 
 		 557 aa  415  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  41.84 
 
 		 546 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  43.7 
 
 		 576 aa  411  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  41.07 
 
 		 538 aa  412  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  41.97 
 
 		 559 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  41.77 
 
 		 545 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  42.27 
 
 		 554 aa  411  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  42.31 
 
 		 587 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  41.16 
 
 		 564 aa  408  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  41.77 
 
 		 545 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  40.97 
 
 		 559 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  39.41 
 
 		 543 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  42.46 
 
 		 539 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  40.89 
 
 		 571 aa  402  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  41.55 
 
 		 560 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  40.65 
 
 		 562 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1377  NAD synthetase  43.3 
 
 		 569 aa  405  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  38.62 
 
 		 561 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  38.79 
 
 		 561 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  41.82 
 
 		 547 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  38.13 
 
 		 542 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  40.44 
 
 		 559 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  41.77 
 
 		 585 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  40.68 
 
 		 565 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  40.82 
 
 		 560 aa  402  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  40.59 
 
 		 550 aa  396  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0771  hypothetical protein  38.37 
 
 		 536 aa  398  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  40.84 
 
 		 538 aa  398  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  41.19 
 
 		 537 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0970  NAD synthetase  41.21 
 
 		 573 aa  396  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615743  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  41.23 
 
 		 544 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  40.38 
 
 		 559 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  39.33 
 
 		 577 aa  398  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  37.95 
 
 		 542 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4875  NAD+ synthetase  41.46 
 
 		 559 aa  398  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  40.59 
 
 		 554 aa  398  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  38.34 
 
 		 536 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  40.21 
 
 		 552 aa  395  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  41.32 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  40.41 
 
 		 550 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0687  NAD synthetase  45.14 
 
 		 558 aa  393  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776924  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  40.27 
 
 		 561 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  39.93 
 
 		 535 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  40 
 
 		 539 aa  395  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  37.64 
 
 		 576 aa  390  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2091  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  42.27 
 
 		 550 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  40.37 
 
 		 562 aa  392  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>