More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1488 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0887  NAD+ synthetase  58.96 
 
 		 570 aa  665    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  71.92 
 
 		 553 aa  812    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0695  putative amidohydrolase  59.47 
 
 		 565 aa  640    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1488  NAD+ synthetase  100 
 
 		 553 aa  1123    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1848  NAD+ synthetase  61.01 
 
 		 547 aa  625  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  55.79 
 
 		 599 aa  622  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  56.33 
 
 		 571 aa  610  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07390  NAD+ synthetase  55.92 
 
 		 577 aa  599  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  51.61 
 
 		 591 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  53.34 
 
 		 582 aa  575  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  52.52 
 
 		 577 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  52.14 
 
 		 591 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  50 
 
 		 598 aa  553  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  48.73 
 
 		 597 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3146  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  50.75 
 
 		 606 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.814025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3585  NAD+ synthetase  51.2 
 
 		 586 aa  540  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1765  NAD+ synthetase  51.75 
 
 		 601 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  hitchhiker  0.000901061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  50.51 
 
 		 590 aa  538  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  50.68 
 
 		 611 aa  536  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  49.83 
 
 		 584 aa  533  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4955  NAD+ synthetase  50.77 
 
 		 586 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  49.1 
 
 		 543 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5512  NAD+ synthetase  47.26 
 
 		 583 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.362156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  45.67 
 
 		 587 aa  462  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  46.96 
 
 		 540 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  45.78 
 
 		 552 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  45.68 
 
 		 556 aa  450  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  39.86 
 
 		 573 aa  449  1e-125  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  44.62 
 
 		 566 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.09 
 
 		 559 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  41.06 
 
 		 574 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  44.21 
 
 		 561 aa  445  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  43.84 
 
 		 567 aa  443  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  46.17 
 
 		 577 aa  443  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  43.66 
 
 		 567 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  42.98 
 
 		 566 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  42.93 
 
 		 545 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  44.98 
 
 		 546 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  45 
 
 		 539 aa  440  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.84 
 
 		 566 aa  440  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  45.92 
 
 		 541 aa  439  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  43.35 
 
 		 538 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  41.3 
 
 		 583 aa  435  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  45.65 
 
 		 537 aa  438  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  44.94 
 
 		 554 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  45.89 
 
 		 554 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  43.32 
 
 		 566 aa  436  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  44.19 
 
 		 564 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  43.42 
 
 		 540 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  43.76 
 
 		 561 aa  432  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  43.24 
 
 		 540 aa  434  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  43.42 
 
 		 540 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  41.84 
 
 		 542 aa  433  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  44.82 
 
 		 583 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  45.06 
 
 		 554 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  45.89 
 
 		 554 aa  434  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  43.58 
 
 		 552 aa  433  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  45.89 
 
 		 543 aa  429  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  41.67 
 
 		 542 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  43.09 
 
 		 565 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  44.39 
 
 		 545 aa  428  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0970  NAD synthetase  43.77 
 
 		 573 aa  428  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615743  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  45.65 
 
 		 571 aa  428  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.92 
 
 		 535 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  43.06 
 
 		 562 aa  428  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  45.2 
 
 		 587 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  43.75 
 
 		 539 aa  427  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  42.33 
 
 		 576 aa  426  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  45.93 
 
 		 550 aa  425  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0771  hypothetical protein  41.65 
 
 		 536 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  42.52 
 
 		 540 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1225  NAD synthetase  44.19 
 
 		 583 aa  422  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  42.91 
 
 		 559 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  43.72 
 
 		 587 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.12 
 
 		 577 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  41.65 
 
 		 561 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  44.23 
 
 		 576 aa  423  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  42.33 
 
 		 576 aa  424  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  44.82 
 
 		 567 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  43.11 
 
 		 550 aa  421  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  41.65 
 
 		 536 aa  420  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  43.29 
 
 		 559 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  42.81 
 
 		 542 aa  420  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  40.77 
 
 		 543 aa  422  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  42.86 
 
 		 559 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  41.48 
 
 		 561 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  44.12 
 
 		 546 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  43.01 
 
 		 566 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  42.93 
 
 		 550 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  42.37 
 
 		 538 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  44.5 
 
 		 585 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  44.65 
 
 		 564 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  45.01 
 
 		 585 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.235816 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  43.09 
 
 		 609 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  43.09 
 
 		 566 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  38.27 
 
 		 575 aa  413  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  43.09 
 
 		 566 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  40.88 
 
 		 561 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  41.7 
 
 		 560 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  43.09 
 
 		 609 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>