More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3146 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  57.05 
 
 		 599 aa  647    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  61.62 
 
 		 577 aa  706    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  58.04 
 
 		 571 aa  658    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  59.19 
 
 		 611 aa  655    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  62.23 
 
 		 597 aa  721    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1765  NAD+ synthetase  79.67 
 
 		 601 aa  919    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  hitchhiker  0.000901061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3146  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  100 
 
 		 606 aa  1202    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.814025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07390  NAD+ synthetase  57.71 
 
 		 577 aa  639    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  59.97 
 
 		 590 aa  683    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  64.07 
 
 		 591 aa  733    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  61.3 
 
 		 584 aa  705    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  62.91 
 
 		 591 aa  715    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  59.8 
 
 		 598 aa  672    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3585  NAD+ synthetase  58.65 
 
 		 586 aa  634  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4955  NAD+ synthetase  56.09 
 
 		 586 aa  597  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  52.48 
 
 		 553 aa  581  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5512  NAD+ synthetase  52.95 
 
 		 583 aa  581  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.362156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  51.39 
 
 		 582 aa  549  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1488  NAD+ synthetase  51.08 
 
 		 553 aa  541  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1848  NAD+ synthetase  53.45 
 
 		 547 aa  530  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0887  NAD+ synthetase  46.09 
 
 		 570 aa  515  1e-144  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  45.03 
 
 		 566 aa  492  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  45.03 
 
 		 566 aa  486  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  44.54 
 
 		 566 aa  483  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0695  putative amidohydrolase  46.46 
 
 		 565 aa  482  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  43.54 
 
 		 583 aa  478  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  47.19 
 
 		 587 aa  478  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  48.17 
 
 		 571 aa  473  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  40.36 
 
 		 573 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.18 
 
 		 537 aa  458  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  46.66 
 
 		 546 aa  459  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  44.78 
 
 		 540 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  47.18 
 
 		 539 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  43.84 
 
 		 561 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  45.7 
 
 		 577 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  46.66 
 
 		 550 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  41.21 
 
 		 576 aa  444  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  41.08 
 
 		 576 aa  443  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  43.62 
 
 		 539 aa  444  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  43.73 
 
 		 554 aa  443  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  39.33 
 
 		 575 aa  439  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  44.81 
 
 		 556 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  44.19 
 
 		 564 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  43.54 
 
 		 540 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  45.77 
 
 		 566 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  45.93 
 
 		 566 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  45.77 
 
 		 566 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  43.38 
 
 		 540 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  43.45 
 
 		 539 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  45.93 
 
 		 566 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  42.22 
 
 		 540 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  45.77 
 
 		 609 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  43.54 
 
 		 540 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  44.67 
 
 		 552 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  45.77 
 
 		 566 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  44.82 
 
 		 554 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  45.77 
 
 		 609 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  41.43 
 
 		 542 aa  435  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  41.42 
 
 		 538 aa  432  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  44 
 
 		 541 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  44.65 
 
 		 554 aa  434  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  44.83 
 
 		 566 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  40.66 
 
 		 566 aa  432  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  42.93 
 
 		 545 aa  432  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  41.26 
 
 		 542 aa  431  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  42.45 
 
 		 543 aa  430  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2457  NAD synthetase  43.98 
 
 		 576 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0627806  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  41.26 
 
 		 552 aa  430  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  45.03 
 
 		 559 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1800  NAD synthetase  43.62 
 
 		 572 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  44.05 
 
 		 566 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  42.88 
 
 		 544 aa  426  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2412  NAD synthetase  43.62 
 
 		 572 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  37.5 
 
 		 574 aa  426  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  43.62 
 
 		 572 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  44.55 
 
 		 545 aa  423  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  42.01 
 
 		 550 aa  419  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  43.74 
 
 		 538 aa  421  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  42.13 
 
 		 554 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.69 
 
 		 535 aa  422  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  42.74 
 
 		 562 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  40.7 
 
 		 567 aa  422  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  43.73 
 
 		 545 aa  420  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  41.99 
 
 		 577 aa  422  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  43.12 
 
 		 561 aa  422  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  42.62 
 
 		 565 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2322  NAD synthetase  43.82 
 
 		 576 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  40.37 
 
 		 567 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5739  NAD synthetase  42.81 
 
 		 568 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.630816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  45.08 
 
 		 577 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  44.77 
 
 		 567 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  43.67 
 
 		 545 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  43.19 
 
 		 562 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  41.85 
 
 		 550 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  44 
 
 		 546 aa  415  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  44.39 
 
 		 547 aa  413  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  41.91 
 
 		 559 aa  412  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  43.51 
 
 		 576 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  43.19 
 
 		 545 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4875  NAD+ synthetase  44.5 
 
 		 559 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>