More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1253 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_07390  NAD+ synthetase  58.45 
 
 
577 aa  640    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  68.63 
 
 
577 aa  782    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  73.59 
 
 
591 aa  845    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3146  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  61.13 
 
 
606 aa  673    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.814025  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  58.74 
 
 
611 aa  661    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  64.42 
 
 
590 aa  725    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  59.73 
 
 
599 aa  693    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3585  NAD+ synthetase  60.1 
 
 
586 aa  651    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  77.27 
 
 
597 aa  922    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  100 
 
 
584 aa  1176    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  61.37 
 
 
571 aa  686    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  64.96 
 
 
591 aa  736    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  60.44 
 
 
598 aa  676    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1765  NAD+ synthetase  64.43 
 
 
601 aa  719    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  hitchhiker  0.000901061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4955  NAD+ synthetase  58.28 
 
 
586 aa  627  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5512  NAD+ synthetase  55.44 
 
 
583 aa  613  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.362156  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  53.33 
 
 
553 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  52.2 
 
 
582 aa  568  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1848  NAD+ synthetase  51.62 
 
 
547 aa  533  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  48.81 
 
 
566 aa  526  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1488  NAD+ synthetase  50.51 
 
 
553 aa  528  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  48.3 
 
 
566 aa  522  1e-147  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0887  NAD+ synthetase  45.65 
 
 
570 aa  517  1.0000000000000001e-145  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  48.13 
 
 
566 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  46.41 
 
 
583 aa  506  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  44.3 
 
 
573 aa  504  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  48.9 
 
 
577 aa  488  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0695  putative amidohydrolase  46.37 
 
 
565 aa  488  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  48.39 
 
 
587 aa  478  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  47.86 
 
 
537 aa  476  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  44.66 
 
 
567 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  44.83 
 
 
567 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  45.41 
 
 
564 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  39.56 
 
 
574 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  43.53 
 
 
566 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  43.74 
 
 
576 aa  456  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  40.7 
 
 
575 aa  456  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  44.54 
 
 
539 aa  457  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  42.81 
 
 
552 aa  456  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  42.59 
 
 
545 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  43.72 
 
 
576 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  44.54 
 
 
554 aa  450  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  45.72 
 
 
561 aa  450  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  43.69 
 
 
539 aa  451  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  45.75 
 
 
556 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  47.59 
 
 
549 aa  450  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  43.34 
 
 
540 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  46.84 
 
 
554 aa  451  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  47.59 
 
 
549 aa  450  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  44.03 
 
 
538 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  42.2 
 
 
538 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  44.16 
 
 
559 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  45.13 
 
 
546 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  44.35 
 
 
545 aa  444  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  42.15 
 
 
542 aa  444  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  43.91 
 
 
561 aa  444  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.71 
 
 
543 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  45.81 
 
 
554 aa  443  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  44.5 
 
 
559 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  45.47 
 
 
554 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  47.79 
 
 
559 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  41.98 
 
 
542 aa  440  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  44.95 
 
 
560 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  46.64 
 
 
539 aa  438  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  43.45 
 
 
577 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  43.9 
 
 
552 aa  435  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  44.16 
 
 
550 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  43.79 
 
 
540 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  43.79 
 
 
540 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  43.62 
 
 
540 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  43.69 
 
 
565 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  43.99 
 
 
550 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0882  NAD synthetase  44.46 
 
 
561 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  43.32 
 
 
559 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  46.09 
 
 
550 aa  430  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  43.49 
 
 
546 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  44.59 
 
 
566 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  42.24 
 
 
540 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  43.43 
 
 
559 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  44.35 
 
 
571 aa  427  1e-118  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0970  NAD synthetase  42.88 
 
 
573 aa  426  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615743  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  44.5 
 
 
587 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.99 
 
 
535 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  42.93 
 
 
562 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2524  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.84 
 
 
556 aa  427  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  44.59 
 
 
609 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  44.59 
 
 
609 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  44.59 
 
 
566 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  44.59 
 
 
566 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  44.43 
 
 
566 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  44.3 
 
 
583 aa  425  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  44.43 
 
 
566 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  42.78 
 
 
567 aa  424  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  43.71 
 
 
542 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  45.62 
 
 
567 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  44.22 
 
 
566 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  42.4 
 
 
560 aa  424  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1225  NAD synthetase  43.53 
 
 
583 aa  419  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410513  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  44.09 
 
 
587 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  43.08 
 
 
545 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>