More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1765 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  64.05 
 
 
577 aa  723    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  60.13 
 
 
611 aa  646    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  58.24 
 
 
599 aa  656    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  58.47 
 
 
598 aa  654    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3146  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  79.67 
 
 
606 aa  888    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.814025  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  65.44 
 
 
591 aa  741    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07390  NAD+ synthetase  59.73 
 
 
577 aa  637    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  64.09 
 
 
584 aa  723    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  63.56 
 
 
597 aa  725    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  64.66 
 
 
591 aa  715    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  64.82 
 
 
590 aa  712    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1765  NAD+ synthetase  100 
 
 
601 aa  1195    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  hitchhiker  0.000901061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  59.9 
 
 
571 aa  655    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3585  NAD+ synthetase  58.72 
 
 
586 aa  624  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4955  NAD+ synthetase  58.47 
 
 
586 aa  610  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  54.77 
 
 
553 aa  592  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5512  NAD+ synthetase  54.26 
 
 
583 aa  581  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.362156  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1848  NAD+ synthetase  55.87 
 
 
547 aa  549  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  51.66 
 
 
582 aa  548  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0887  NAD+ synthetase  47.58 
 
 
570 aa  536  1e-151  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1488  NAD+ synthetase  52.09 
 
 
553 aa  530  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0695  putative amidohydrolase  47.8 
 
 
565 aa  499  1e-140  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  44.41 
 
 
566 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.48 
 
 
566 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  44.13 
 
 
566 aa  466  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  46.19 
 
 
587 aa  468  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  43.07 
 
 
583 aa  467  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  45.97 
 
 
540 aa  464  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  48.74 
 
 
546 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  47.52 
 
 
571 aa  463  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  47.24 
 
 
537 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  40.4 
 
 
573 aa  456  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  47.88 
 
 
550 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  47.05 
 
 
554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  46.88 
 
 
554 aa  450  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  45.83 
 
 
556 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  44.54 
 
 
561 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  45.3 
 
 
564 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  46.05 
 
 
554 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  45.01 
 
 
561 aa  442  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  42.2 
 
 
576 aa  444  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  47.47 
 
 
577 aa  443  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  41.87 
 
 
576 aa  444  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  45.19 
 
 
552 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  43.43 
 
 
545 aa  438  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  38.82 
 
 
575 aa  437  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.46 
 
 
543 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  42.42 
 
 
552 aa  436  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  46.57 
 
 
539 aa  432  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  43.24 
 
 
550 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  43.22 
 
 
540 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  41.14 
 
 
542 aa  433  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  44.05 
 
 
539 aa  434  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  37.86 
 
 
574 aa  433  1e-120  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  44.07 
 
 
540 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4875  NAD+ synthetase  46.54 
 
 
559 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  43.07 
 
 
550 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  40.97 
 
 
542 aa  430  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  43.9 
 
 
540 aa  431  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  43.97 
 
 
565 aa  432  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  44.07 
 
 
540 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  43.54 
 
 
554 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  42.57 
 
 
538 aa  427  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.42 
 
 
559 aa  425  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  44.01 
 
 
538 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  45.57 
 
 
587 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  46.28 
 
 
567 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  43.41 
 
 
559 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0970  NAD synthetase  43.72 
 
 
573 aa  422  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615743  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  43.45 
 
 
562 aa  425  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  42.4 
 
 
559 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  40.3 
 
 
566 aa  422  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  43.09 
 
 
560 aa  422  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  42.72 
 
 
559 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  41.36 
 
 
567 aa  421  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  44.03 
 
 
541 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  42.6 
 
 
539 aa  421  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0771  hypothetical protein  40.07 
 
 
536 aa  419  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  41.02 
 
 
567 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  42.3 
 
 
557 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  40.23 
 
 
545 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  44.59 
 
 
585 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.58 
 
 
535 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  46.47 
 
 
564 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  39.73 
 
 
536 aa  415  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  43.76 
 
 
576 aa  413  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  43.57 
 
 
544 aa  415  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  45.65 
 
 
585 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.235816 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  43.49 
 
 
583 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  44.3 
 
 
572 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  41.2 
 
 
559 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  43.57 
 
 
545 aa  409  1e-113  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  44.41 
 
 
545 aa  410  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2322  NAD synthetase  44.75 
 
 
576 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509077  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  44.52 
 
 
587 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  45.27 
 
 
577 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1800  NAD synthetase  43.72 
 
 
572 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2457  NAD synthetase  44.35 
 
 
576 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0627806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2412  NAD synthetase  43.72 
 
 
572 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  44.28 
 
 
566 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>