More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0269 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0269  NAD synthetase  100 
 
 
330 aa  679    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0488  NAD synthetase  37.67 
 
 
342 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3650  NAD synthetase  38.91 
 
 
345 aa  219  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2957  NAD synthetase  36.96 
 
 
323 aa  212  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2865  NAD synthetase  36.96 
 
 
323 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1248  NAD synthetase  36.95 
 
 
324 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2788  NAD synthetase  36.36 
 
 
323 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4477  NAD synthetase  32.78 
 
 
328 aa  193  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2382  NAD synthetase  33.33 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.846278  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2881  NAD synthetase  33.67 
 
 
330 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4337  NAD synthetase  33.33 
 
 
335 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0886031  normal  0.014304 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2868  NAD synthetase  34.42 
 
 
332 aa  182  9.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0283  NAD+ synthetase  35.43 
 
 
281 aa  175  8e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000382877  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0284  NAD+ synthetase  36.09 
 
 
281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3178  NAD synthetase  31.48 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1083  NAD synthetase  32.17 
 
 
328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.402992  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5317  NAD+ synthetase  34.58 
 
 
325 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288579  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0878  NAD+ synthetase  31.7 
 
 
294 aa  138  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  32.38 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  31.54 
 
 
265 aa  132  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0229  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  31.13 
 
 
258 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  31.32 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0594  NAD+ synthetase  30.88 
 
 
258 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0895907  normal  0.216266 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0086  NAD+ synthetase  30.04 
 
 
279 aa  120  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.485052  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  27.96 
 
 
263 aa  119  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  29.93 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1324  NAD+ synthetase  29.47 
 
 
258 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.873585  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0662  NAD+ synthetase  28.14 
 
 
254 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0164353  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1279  NAD synthetase  25.71 
 
 
276 aa  114  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.610842  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  29.55 
 
 
246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2601  NAD+ synthetase  28.14 
 
 
245 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1353  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.36 
 
 
251 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000287377 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1352  NAD synthetase  26.09 
 
 
275 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280388  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0476  NAD+ synthetase  27.18 
 
 
264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1302  NAD synthetase  27.24 
 
 
269 aa  109  6e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.120392  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0652  NAD synthetase  29.57 
 
 
273 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3754  NAD synthetase  29.96 
 
 
273 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.583588  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1454  NAD+ synthetase  30.72 
 
 
263 aa  109  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.770644 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0857  NAD synthetase  26.89 
 
 
277 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1657  NAD+ synthetase  27.45 
 
 
241 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251103  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2475  NAD+ synthetase  26.25 
 
 
284 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3513  NAD+ synthetase  28.28 
 
 
302 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2862  NAD synthetase  28.57 
 
 
271 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158436  hitchhiker  0.000000740071 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0901  NAD synthetase  29.8 
 
 
246 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1197  NAD+ synthetase  31.13 
 
 
238 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0831  NAD synthetase  29.8 
 
 
246 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0228382  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0247  NAD+ synthetase  26.4 
 
 
261 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1200  NAD synthetase  29.8 
 
 
246 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1544  NAD+ synthetase  29.97 
 
 
332 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  29.84 
 
 
263 aa  104  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0526  NAD+ synthetase  30.07 
 
 
263 aa  104  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313435  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0524  NAD synthetase  26.56 
 
 
283 aa  104  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00084684  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2118  NAD+ synthetase  28.37 
 
 
283 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2228  NAD synthetase  29.15 
 
 
273 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.529939  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3421  NAD synthetase  27.87 
 
 
273 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3482  NAD synthetase  27.87 
 
 
273 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000292303 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0248  NAD synthetase  29 
 
 
270 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0564  NAD synthetase  27.56 
 
 
277 aa  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.514395  normal  0.335445 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1366  NAD+ synthetase  30.58 
 
 
241 aa  99.8  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0090  NAD synthetase  25.16 
 
 
277 aa  99.4  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.670089  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0793  NAD synthetase  30.04 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19030  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.99 
 
 
247 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1161  NAD synthetase  25.84 
 
 
277 aa  96.3  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0701  NAD synthetase  24.58 
 
 
278 aa  96.3  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000652237  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2901  NAD+ synthetase  37.88 
 
 
304 aa  95.5  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0922  NAD+ synthetase  31.4 
 
 
246 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0810  NAD synthetase  24.53 
 
 
277 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00066605  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0798  NAD+ synthetase  26.09 
 
 
255 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1635  NAD+ synthetase  30.13 
 
 
243 aa  92.8  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.35662  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0900  NAD synthetase  25 
 
 
246 aa  92.4  9e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.953423  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1025  NAD+ synthetase  24.21 
 
 
247 aa  92.4  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0926  NAD+ synthetase  29.92 
 
 
248 aa  91.3  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.486288  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  27.39 
 
 
540 aa  90.5  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2526  NAD+ synthetase  27.57 
 
 
246 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1348  NAD+ synthetase  26.74 
 
 
267 aa  90.9  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1444  NAD+ synthetase  26.52 
 
 
279 aa  90.9  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1813  NAD synthetase  25.65 
 
 
277 aa  89.7  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.501702  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0966  NAD+ synthetase  26.39 
 
 
237 aa  90.1  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0240319 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1078  NAD+ synthetase  27.35 
 
 
248 aa  89.4  9e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0716  NAD synthetase  40 
 
 
264 aa  88.6  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.866923 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  25.95 
 
 
543 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1801  NAD+ synthetase  34.87 
 
 
250 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431835 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl521  NH3-dependent NAD+ synthetase  29.41 
 
 
244 aa  88.2  2e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0125  NAD+ synthetase  26.45 
 
 
250 aa  88.2  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2324  NAD+ synthetase  27.9 
 
 
248 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  27.13 
 
 
561 aa  85.5  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1437  NAD+ synthetase  40 
 
 
249 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.541928  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0568  NAD+ synthetase  32.05 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  25.22 
 
 
583 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  26.22 
 
 
585 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.235816 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.24 
 
 
537 aa  83.2  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  24.92 
 
 
546 aa  83.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  26.47 
 
 
571 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2846  NAD+ synthetase  24.58 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165139  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1168  NAD+ synthetase  24.92 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.335254 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4289  NAD+ synthetase  23.28 
 
 
622 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967523  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0275  NAD+ synthetase  29.26 
 
 
289 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  25.38 
 
 
585 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf282  NH(3)-dependent NAD+ synthetase  29 
 
 
256 aa  82.4  0.00000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000329858  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  27.83 
 
 
565 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>