More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0568 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0568  NAD+ synthetase  100 
 
 
259 aa  535  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06585  NH(3)-dependent NAD synthetase  58.02 
 
 
263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.878387  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1792  NAD+ synthetase  54.2 
 
 
268 aa  295  4e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0918  NAD+ synthetase  50.59 
 
 
256 aa  270  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.942289  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  38.13 
 
 
246 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19030  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  38.37 
 
 
247 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  34.62 
 
 
265 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  34.75 
 
 
263 aa  136  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0662  NAD+ synthetase  34.35 
 
 
254 aa  135  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0164353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1635  NAD+ synthetase  35.97 
 
 
243 aa  135  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.35662  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1366  NAD+ synthetase  38.04 
 
 
241 aa  135  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1352  NAD synthetase  34.25 
 
 
275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280388  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1801  NAD+ synthetase  34.92 
 
 
250 aa  132  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0798  NAD+ synthetase  33.46 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf282  NH(3)-dependent NAD+ synthetase  33.33 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000329858  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0476  NAD+ synthetase  33.85 
 
 
264 aa  129  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl521  NH3-dependent NAD+ synthetase  36.12 
 
 
244 aa  129  6e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0922  NAD+ synthetase  35.97 
 
 
246 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2846  NAD+ synthetase  37.93 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165139  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2526  NAD+ synthetase  35.04 
 
 
246 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0793  NAD synthetase  34.92 
 
 
276 aa  123  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1161  NAD synthetase  33.79 
 
 
277 aa  122  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  33.46 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2601  NAD+ synthetase  31.3 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0229  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  32.95 
 
 
258 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  31.92 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1437  NAD+ synthetase  34.47 
 
 
249 aa  119  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.541928  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0531  NH3-dependent NAD+ synthetase  33.33 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000693005  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1302  NAD synthetase  33.6 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.120392  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1657  NAD+ synthetase  33.07 
 
 
241 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251103  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  34.63 
 
 
285 aa  115  6e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1353  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  34.48 
 
 
251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000287377 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1324  NAD+ synthetase  32.17 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.873585  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0594  NAD+ synthetase  32.42 
 
 
258 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0895907  normal  0.216266 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0090  NAD synthetase  31.51 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.670089  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  32.16 
 
 
263 aa  108  6e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0716  NAD synthetase  31.89 
 
 
264 aa  108  9.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.866923 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1822  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  37.97 
 
 
514 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0926  NAD+ synthetase  35.66 
 
 
248 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.486288  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2475  NAD+ synthetase  31.47 
 
 
284 aa  106  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1078  NAD+ synthetase  28.79 
 
 
248 aa  107  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0248  NAD synthetase  34.13 
 
 
270 aa  104  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0125  NAD+ synthetase  31.8 
 
 
250 aa  104  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0470  NAD+ synthetase  37.59 
 
 
514 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1025  NAD+ synthetase  31.6 
 
 
247 aa  102  6e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0901  NAD synthetase  28.93 
 
 
246 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1454  NAD+ synthetase  34.36 
 
 
263 aa  101  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.770644 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0831  NAD synthetase  28.93 
 
 
246 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0228382  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1200  NAD synthetase  29.05 
 
 
246 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1348  NAD+ synthetase  30.84 
 
 
267 aa  99.8  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0247  NAD+ synthetase  32.23 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0851  NAD(+) synthase  31.02 
 
 
257 aa  99.8  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3754  NAD synthetase  31.28 
 
 
273 aa  99.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.583588  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1279  NAD synthetase  30.56 
 
 
276 aa  98.6  9e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.610842  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03120  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  32.03 
 
 
280 aa  98.2  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0526  NAD+ synthetase  36.08 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313435  normal  0.305949 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2901  NAD+ synthetase  33.65 
 
 
304 aa  97.1  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3513  NAD+ synthetase  34.43 
 
 
302 aa  95.9  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2228  NAD synthetase  30.74 
 
 
273 aa  96.3  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.529939  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4922  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  33.33 
 
 
275 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0594  NAD synthetase  33.33 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4289  NAD+ synthetase  30.8 
 
 
622 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967523  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1197  NAD+ synthetase  33.85 
 
 
238 aa  94  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2862  NAD synthetase  30.58 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158436  hitchhiker  0.000000740071 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2324  NAD+ synthetase  36.45 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3059  NAD+ synthetase  39.15 
 
 
514 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0652  NAD synthetase  31.68 
 
 
273 aa  92.8  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2658  NAD synthetase  29.89 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2581  NAD synthetase  29.89 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0153325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2543  NAD synthetase  29.89 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.680387  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1803  NAD synthetase  29.89 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00266158  hitchhiker  0.0000311933 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0810  NAD synthetase  29.61 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00066605  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1044  NAD+ synthetase  32.6 
 
 
268 aa  93.2  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0900  NAD synthetase  30.35 
 
 
246 aa  92.4  6e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.953423  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0564  NAD synthetase  31.86 
 
 
277 aa  92.4  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.514395  normal  0.335445 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0524  NAD synthetase  30.39 
 
 
283 aa  92.4  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00084684  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1444  NAD+ synthetase  35.58 
 
 
279 aa  92.4  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1813  NAD synthetase  31.55 
 
 
277 aa  91.3  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.501702  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0310  NAD synthetase  33.07 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.737359  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0966  NAD+ synthetase  30.85 
 
 
237 aa  90.1  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0240319 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0284  NAD+ synthetase  29.2 
 
 
281 aa  89.7  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1542  NAD synthetase  30.27 
 
 
276 aa  89.7  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.496259  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3421  NAD synthetase  32.63 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2438  NAD synthetase  28.79 
 
 
296 aa  88.6  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147914  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1544  NAD+ synthetase  30.08 
 
 
332 aa  88.6  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1410  NAD synthetase  30.56 
 
 
275 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0651  NAD synthetase  30.62 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2246  NAD synthetase  28.79 
 
 
296 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000924504  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2318  NAD synthetase  28.79 
 
 
296 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000738561  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2118  NAD+ synthetase  35.98 
 
 
283 aa  87  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3482  NAD synthetase  29.8 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000292303 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0494  NAD synthetase  30.73 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2021  NAD synthetase  28.3 
 
 
276 aa  86.3  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0701  NAD synthetase  31.4 
 
 
278 aa  85.9  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000652237  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0504  NAD+ synthetase  26.84 
 
 
255 aa  85.9  6e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4778  NAD synthetase  28.51 
 
 
288 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2294  NAD synthetase  29.92 
 
 
276 aa  85.5  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206886  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0957  NAD synthetase  29.01 
 
 
277 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0547  NAD synthetase  29.34 
 
 
275 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269229  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0283  NAD+ synthetase  28.21 
 
 
281 aa  85.5  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000382877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>