More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4477 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4477  NAD synthetase  100 
 
 
328 aa  664    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4337  NAD synthetase  57.59 
 
 
335 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0886031  normal  0.014304 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3178  NAD synthetase  59.38 
 
 
328 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1083  NAD synthetase  59.38 
 
 
328 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.402992  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2865  NAD synthetase  58.18 
 
 
323 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2957  NAD synthetase  57.86 
 
 
323 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2788  NAD synthetase  56.83 
 
 
323 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1248  NAD synthetase  57.28 
 
 
324 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2881  NAD synthetase  55.83 
 
 
330 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2382  NAD synthetase  53.48 
 
 
334 aa  353  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.846278  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2868  NAD synthetase  55.99 
 
 
332 aa  352  5e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3650  NAD synthetase  49.05 
 
 
345 aa  311  6.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0488  NAD synthetase  49.83 
 
 
342 aa  305  8.000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5317  NAD+ synthetase  48.1 
 
 
325 aa  259  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288579  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0269  NAD synthetase  32.78 
 
 
330 aa  193  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0283  NAD+ synthetase  35 
 
 
281 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000382877  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0284  NAD+ synthetase  33.86 
 
 
281 aa  143  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0878  NAD+ synthetase  32.96 
 
 
294 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  28.57 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0086  NAD+ synthetase  28.27 
 
 
279 aa  120  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.485052  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0229  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.84 
 
 
258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1324  NAD+ synthetase  29.45 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.873585  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  28.27 
 
 
281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0594  NAD+ synthetase  28.72 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0895907  normal  0.216266 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  29.68 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1544  NAD+ synthetase  33.96 
 
 
332 aa  112  8.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  28.2 
 
 
285 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1302  NAD synthetase  30.53 
 
 
269 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.120392  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1197  NAD+ synthetase  30.43 
 
 
238 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3513  NAD+ synthetase  29.62 
 
 
302 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  27.71 
 
 
263 aa  102  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0476  NAD+ synthetase  30.57 
 
 
264 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0248  NAD synthetase  30.49 
 
 
270 aa  99.4  7e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1353  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.52 
 
 
251 aa  98.2  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000287377 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2601  NAD+ synthetase  28.4 
 
 
245 aa  95.5  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2324  NAD+ synthetase  29.82 
 
 
248 aa  95.1  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19030  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.92 
 
 
247 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0701  NAD synthetase  28.95 
 
 
278 aa  94.4  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000652237  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0090  NAD synthetase  29 
 
 
277 aa  94.4  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.670089  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0310  NAD synthetase  29.01 
 
 
267 aa  92  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.737359  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2118  NAD+ synthetase  29.11 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3754  NAD synthetase  26.86 
 
 
273 aa  90.5  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.583588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1657  NAD+ synthetase  28.09 
 
 
241 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251103  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0793  NAD synthetase  30.45 
 
 
276 aa  90.5  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0966  NAD+ synthetase  27.08 
 
 
237 aa  90.1  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0240319 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1635  NAD+ synthetase  30.52 
 
 
243 aa  89.7  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.35662  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0857  NAD synthetase  27.82 
 
 
277 aa  89.4  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0526  NAD+ synthetase  27.95 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313435  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1454  NAD+ synthetase  27.56 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.770644 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  30.04 
 
 
246 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2475  NAD+ synthetase  25 
 
 
284 aa  87.8  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1279  NAD synthetase  28.15 
 
 
276 aa  87  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.610842  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2846  NAD+ synthetase  36.55 
 
 
264 aa  85.9  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165139  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl521  NH3-dependent NAD+ synthetase  28.32 
 
 
244 aa  85.9  0.000000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0564  NAD synthetase  29.32 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.514395  normal  0.335445 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0662  NAD+ synthetase  24.83 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0164353  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1366  NAD+ synthetase  27.76 
 
 
241 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1813  NAD synthetase  26.42 
 
 
277 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.501702  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0810  NAD synthetase  26.87 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00066605  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2901  NAD+ synthetase  29.81 
 
 
304 aa  82  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0798  NAD+ synthetase  26.77 
 
 
255 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1352  NAD synthetase  35.1 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280388  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0247  NAD+ synthetase  29.59 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3421  NAD synthetase  28.32 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1801  NAD+ synthetase  30.17 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431835 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0901  NAD synthetase  26.59 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0831  NAD synthetase  26.59 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0228382  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0531  NH3-dependent NAD+ synthetase  27.94 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000693005  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  24.25 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0926  NAD+ synthetase  27.84 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.486288  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1802  NAD synthetase  27.11 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2526  NAD+ synthetase  25.09 
 
 
246 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1542  NAD synthetase  27.67 
 
 
276 aa  77  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.496259  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1200  NAD synthetase  26.19 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1464  NAD synthetase  27.64 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00984528  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0652  NAD+ synthetase  25.19 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0918  NAD+ synthetase  28.57 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.942289  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0957  NAD synthetase  29.03 
 
 
277 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0652  NAD synthetase  26.58 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4289  NAD+ synthetase  25.76 
 
 
622 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967523  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0716  NAD synthetase  28.38 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.866923 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2791  NAD synthetase  27.82 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1444  NAD+ synthetase  26.84 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1161  NAD synthetase  33.57 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2228  NAD synthetase  26.64 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.529939  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  25.98 
 
 
543 aa  73.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0182  NAD+ synthetase  23.2 
 
 
526 aa  73.6  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0922  NAD+ synthetase  25.74 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03015  NAD synthetase  39.25 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00527093  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  23.84 
 
 
576 aa  73.2  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  24.91 
 
 
546 aa  73.2  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1044  NAD+ synthetase  33.57 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3482  NAD synthetase  27.43 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000292303 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1792  NAD+ synthetase  25.69 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0900  NAD synthetase  27.38 
 
 
246 aa  72  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.953423  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  26.14 
 
 
540 aa  72  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19800  NAD+ synthetase  23.69 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.497011  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1758  NAD synthetase  26.64 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493313  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1432  NAD synthetase  26.39 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0922379  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0837  NAD synthetase  28.67 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>