More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0918 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0918  NAD+ synthetase  100 
 
 
256 aa  538  9.999999999999999e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.942289  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1792  NAD+ synthetase  64.45 
 
 
268 aa  370  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06585  NH(3)-dependent NAD synthetase  62.2 
 
 
263 aa  340  9e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.878387  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0568  NAD+ synthetase  50.59 
 
 
259 aa  270  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19030  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  38.8 
 
 
247 aa  168  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1801  NAD+ synthetase  40.55 
 
 
250 aa  159  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431835 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  35.55 
 
 
246 aa  152  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1366  NAD+ synthetase  35.69 
 
 
241 aa  143  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0531  NH3-dependent NAD+ synthetase  35.78 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000693005  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  36.73 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2526  NAD+ synthetase  34.38 
 
 
246 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1657  NAD+ synthetase  38.53 
 
 
241 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251103  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0922  NAD+ synthetase  34.77 
 
 
246 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl521  NH3-dependent NAD+ synthetase  36.76 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0662  NAD+ synthetase  34.39 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0164353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1635  NAD+ synthetase  36.12 
 
 
243 aa  135  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.35662  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  33.63 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  36.14 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0798  NAD+ synthetase  33.98 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  35.16 
 
 
258 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1324  NAD+ synthetase  33.86 
 
 
258 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.873585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0229  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  34.12 
 
 
258 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0594  NAD+ synthetase  33.33 
 
 
258 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0895907  normal  0.216266 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0966  NAD+ synthetase  31.95 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0240319 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2601  NAD+ synthetase  33.06 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1353  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  36.63 
 
 
251 aa  118  7e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000287377 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  31.62 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0926  NAD+ synthetase  36.79 
 
 
248 aa  116  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.486288  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0851  NAD(+) synthase  33.74 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3513  NAD+ synthetase  34.23 
 
 
302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1078  NAD+ synthetase  29.41 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1352  NAD synthetase  33.2 
 
 
275 aa  113  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280388  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1302  NAD synthetase  31.91 
 
 
269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.120392  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0793  NAD synthetase  32.81 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0901  NAD synthetase  29.69 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf282  NH(3)-dependent NAD+ synthetase  30.42 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000329858  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0831  NAD synthetase  29.69 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0228382  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1437  NAD+ synthetase  33.02 
 
 
249 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.541928  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2658  NAD synthetase  30.65 
 
 
276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2543  NAD synthetase  30.65 
 
 
276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.680387  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2581  NAD synthetase  30.65 
 
 
276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0153325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1803  NAD synthetase  30.65 
 
 
276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00266158  hitchhiker  0.0000311933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2438  NAD synthetase  30 
 
 
296 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147914  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2021  NAD synthetase  29.89 
 
 
276 aa  106  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1200  NAD synthetase  28.52 
 
 
246 aa  105  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1544  NAD+ synthetase  30.77 
 
 
332 aa  105  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0310  NAD synthetase  35.83 
 
 
267 aa  105  9e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.737359  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2901  NAD+ synthetase  34.92 
 
 
304 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0248  NAD synthetase  32.68 
 
 
270 aa  104  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2294  NAD synthetase  30.15 
 
 
276 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2246  NAD synthetase  28.85 
 
 
296 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000924504  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2318  NAD synthetase  28.85 
 
 
296 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000738561  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1822  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  32.88 
 
 
514 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0716  NAD synthetase  32.4 
 
 
264 aa  102  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.866923 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3059  NAD+ synthetase  32.43 
 
 
514 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2846  NAD+ synthetase  28.17 
 
 
264 aa  102  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165139  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  31.64 
 
 
263 aa  102  8e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0652  NAD synthetase  30.26 
 
 
273 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0125  NAD+ synthetase  31.62 
 
 
250 aa  101  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0594  NAD synthetase  29.5 
 
 
275 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0476  NAD+ synthetase  28.74 
 
 
264 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2862  NAD synthetase  30.57 
 
 
271 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158436  hitchhiker  0.000000740071 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4922  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.68 
 
 
275 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0857  NAD synthetase  33.19 
 
 
277 aa  99.8  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1197  NAD+ synthetase  34.34 
 
 
238 aa  99.4  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0470  NAD+ synthetase  32.43 
 
 
514 aa  99.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1542  NAD synthetase  30.12 
 
 
276 aa  99.4  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.496259  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0900  NAD synthetase  30.14 
 
 
246 aa  99  6e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.953423  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1044  NAD+ synthetase  35.24 
 
 
268 aa  99  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1279  NAD synthetase  32.35 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.610842  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1552  NAD synthetase  30.65 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.022001  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2475  NAD+ synthetase  27.63 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001341  NAD synthetase  30 
 
 
276 aa  96.7  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0564  NAD synthetase  30.25 
 
 
277 aa  96.7  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.514395  normal  0.335445 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05230  NAD synthetase  27.65 
 
 
276 aa  97.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2228  NAD synthetase  31.36 
 
 
273 aa  96.3  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.529939  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0524  NAD synthetase  28.35 
 
 
283 aa  96.3  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00084684  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2324  NAD+ synthetase  32.58 
 
 
248 aa  96.7  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1161  NAD synthetase  30.62 
 
 
277 aa  96.3  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0283  NAD+ synthetase  30.43 
 
 
281 aa  96.3  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000382877  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3650  NAD synthetase  28.93 
 
 
345 aa  95.9  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1454  NAD+ synthetase  35.84 
 
 
263 aa  95.9  6e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.770644 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0810  NAD synthetase  30.71 
 
 
277 aa  95.1  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00066605  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0247  NAD+ synthetase  28.64 
 
 
261 aa  94.4  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0090  NAD synthetase  26.92 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.670089  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  29.53 
 
 
543 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3163  NAD synthetase  27 
 
 
276 aa  94  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000184927  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0607  NAD synthetase  28.41 
 
 
276 aa  94.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2791  NAD synthetase  27.69 
 
 
276 aa  93.6  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3754  NAD synthetase  30.92 
 
 
273 aa  93.2  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.583588  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1021  NAD synthetase  28.03 
 
 
276 aa  92.8  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4661  NAD synthetase  26.67 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1802  NAD synthetase  28.68 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4869  NAD synthetase  26.12 
 
 
275 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772089 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1464  NAD synthetase  28.35 
 
 
288 aa  92.4  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00984528  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1432  NAD synthetase  28.57 
 
 
275 aa  92  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0922379  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1813  NAD synthetase  31.09 
 
 
277 aa  92  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.501702  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0284  NAD+ synthetase  27.71 
 
 
281 aa  91.3  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1510  NAD synthetase  30 
 
 
272 aa  91.3  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1025  NAD+ synthetase  31.94 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>