More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1542 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1542  NAD synthetase  100 
 
 		 276 aa  569  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.496259  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1432  NAD synthetase  85.14 
 
 		 275 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0922379  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2294  NAD synthetase  79.71 
 
 		 276 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206886  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2021  NAD synthetase  79.35 
 
 		 276 aa  454  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2658  NAD synthetase  79.71 
 
 		 276 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1803  NAD synthetase  79.71 
 
 		 276 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00266158  hitchhiker  0.0000311933 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2543  NAD synthetase  79.71 
 
 		 276 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.680387  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2581  NAD synthetase  79.35 
 
 		 276 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0153325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2791  NAD synthetase  77.17 
 
 		 276 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1552  NAD synthetase  78.62 
 
 		 276 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.022001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1802  NAD synthetase  76.09 
 
 		 276 aa  441  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2438  NAD synthetase  76.45 
 
 		 296 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2246  NAD synthetase  76.09 
 
 		 296 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000924504  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2318  NAD synthetase  76.09 
 
 		 296 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000738561  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1758  NAD synthetase  76.09 
 
 		 276 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493313  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1464  NAD synthetase  74.37 
 
 		 288 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00984528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3205  NAD synthetase  68.84 
 
 		 276 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001341  NAD synthetase  69.2 
 
 		 276 aa  384  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1021  NAD synthetase  66.67 
 
 		 276 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0607  NAD synthetase  64.49 
 
 		 276 aa  370  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05230  NAD synthetase  66.3 
 
 		 276 aa  373  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3163  NAD synthetase  62.18 
 
 		 276 aa  346  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000184927  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03015  NAD synthetase  61.45 
 
 		 278 aa  344  7e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00527093  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3918  NAD synthetase  60.36 
 
 		 281 aa  333  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0524773  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01709  NAD synthetase  51.99 
 
 		 275 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01697  hypothetical protein  51.99 
 
 		 275 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1451  NAD synthetase  51.62 
 
 		 275 aa  276  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.436371 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1984  NAD synthetase  51.26 
 
 		 275 aa  275  5e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0559818  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1961  NAD synthetase  51.99 
 
 		 275 aa  275  7e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2458  NAD synthetase  51.62 
 
 		 275 aa  275  8e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.36624  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1902  NAD+ synthetase  51.26 
 
 		 275 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0140944  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1892  NAD synthetase  51.26 
 
 		 275 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1822  NAD synthetase  51.26 
 
 		 275 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0494  NAD synthetase  51.09 
 
 		 273 aa  266  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1527  NAD synthetase  50.18 
 
 		 277 aa  265  7e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.423964 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1704  NAD synthetase  50.18 
 
 		 275 aa  265  8e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4602  NAD+ synthetase  51.47 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3609  NAD synthetase  50.94 
 
 		 276 aa  261  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0285  NAD synthetase  51.88 
 
 		 275 aa  261  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.458253  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1960  NAD synthetase  50 
 
 		 274 aa  259  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0420468  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2044  NAD synthetase  49.82 
 
 		 273 aa  258  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00162701  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1898  NAD synthetase  49.28 
 
 		 274 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0274  NAD synthetase  49.82 
 
 		 273 aa  258  6e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.652864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2191  NAD synthetase  48.56 
 
 		 274 aa  258  9e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1449  NAD synthetase  52.21 
 
 		 275 aa  257  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.220905  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0957  NAD synthetase  51.31 
 
 		 277 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64980  NAD synthetase  51.46 
 
 		 275 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0296  NAD synthetase  50.18 
 
 		 273 aa  256  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1407  NAD synthetase  49.46 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.107473 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2034  NAD synthetase  49.46 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.345361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1439  NAD synthetase  49.46 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1424  NAD synthetase  49.46 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.979125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0837  NAD synthetase  50.56 
 
 		 277 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5646  NAD synthetase  50.73 
 
 		 275 aa  255  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.899788  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1510  NAD synthetase  50 
 
 		 272 aa  255  5e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1204  NAD synthetase  48.38 
 
 		 274 aa  254  7e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1861  NAD synthetase  49.1 
 
 		 275 aa  254  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.299606  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1861  NAD synthetase  50 
 
 		 272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1327  NAD synthetase  48.76 
 
 		 288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1410  NAD synthetase  51.2 
 
 		 275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0651  NAD synthetase  48.91 
 
 		 277 aa  253  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1855  NAD synthetase  49.28 
 
 		 272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1810  NAD synthetase  49.28 
 
 		 272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.186711  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0594  NAD synthetase  53.2 
 
 		 275 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1998  NAD synthetase  49.28 
 
 		 272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0298408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2031  NAD synthetase  49.28 
 
 		 272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0182600000000003e-40 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2000  NAD synthetase  49.28 
 
 		 272 aa  251  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0019517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4922  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  51.98 
 
 		 275 aa  251  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4869  NAD synthetase  52.38 
 
 		 275 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772089 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2095  NAD synthetase  49.28 
 
 		 272 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1968  NAD synthetase  52.38 
 
 		 273 aa  250  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306436  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2002  NAD synthetase  52.38 
 
 		 273 aa  250  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3329  NAD synthetase  48.91 
 
 		 272 aa  250  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000156548  unclonable  3.14832e-25 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0547  NAD synthetase  52.19 
 
 		 275 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269229  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4747  NAD synthetase  52.38 
 
 		 275 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000246424 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0288  NAD synthetase  49.27 
 
 		 284 aa  249  2e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4661  NAD synthetase  52.36 
 
 		 275 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2075  NAD synthetase  48.91 
 
 		 272 aa  248  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000520517  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1989  NAD synthetase  47.64 
 
 		 286 aa  248  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1826  NAD synthetase  48.91 
 
 		 272 aa  248  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000200319  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4925  NAD synthetase  51.59 
 
 		 275 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0372  NAD synthetase  47.81 
 
 		 282 aa  248  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.299221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01960  NAD synthetase  44.88 
 
 		 302 aa  247  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4778  NAD synthetase  50.57 
 
 		 288 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4784  NAD synthetase  46.55 
 
 		 286 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391327  hitchhiker  0.000536951 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0886  NAD synthetase  49.07 
 
 		 284 aa  241  9e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4990  NAD synthetase  47.81 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3089  NAD synthetase  47.81 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5278  NAD synthetase  47.81 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.471439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3443  NAD synthetase  48.16 
 
 		 325 aa  240  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0163  NAD synthetase  48.3 
 
 		 284 aa  239  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4638  NAD synthetase  47.79 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5167  NAD synthetase  46.69 
 
 		 282 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0848022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0718  NAD synthetase  48.68 
 
 		 282 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.451004  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0008  NAD synthetase  44.04 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1541  NAD synthetase  44.57 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03120  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  47.43 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0515  NAD synthetase  48.7 
 
 		 284 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.192962  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2101  NAD synthetase  48.7 
 
 		 340 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0241675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2006  NAD synthetase  48.7 
 
 		 284 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>