More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2044 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2044  NAD synthetase  100 
 
 
273 aa  565  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00162701  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1960  NAD synthetase  91.97 
 
 
274 aa  522  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0420468  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1898  NAD synthetase  87.59 
 
 
274 aa  503  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2191  NAD synthetase  86.13 
 
 
274 aa  497  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1704  NAD synthetase  79.93 
 
 
275 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01709  NAD synthetase  78.47 
 
 
275 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1451  NAD synthetase  78.83 
 
 
275 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.436371 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01697  hypothetical protein  78.47 
 
 
275 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2458  NAD synthetase  78.1 
 
 
275 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.36624  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2034  NAD synthetase  78.83 
 
 
275 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.345361  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1424  NAD synthetase  78.83 
 
 
275 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.979125  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1961  NAD synthetase  77.74 
 
 
275 aa  442  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1407  NAD synthetase  78.83 
 
 
275 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.107473 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1902  NAD+ synthetase  77.74 
 
 
275 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0140944  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1984  NAD synthetase  77.74 
 
 
275 aa  440  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0559818  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1439  NAD synthetase  78.47 
 
 
275 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1822  NAD synthetase  77.74 
 
 
275 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1892  NAD synthetase  77.74 
 
 
275 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1861  NAD synthetase  78.1 
 
 
275 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.299606  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0288  NAD synthetase  69.63 
 
 
284 aa  394  1e-109  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0274  NAD synthetase  62.27 
 
 
273 aa  362  4e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.652864  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1204  NAD synthetase  62.41 
 
 
274 aa  357  9e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0296  NAD synthetase  60.44 
 
 
273 aa  355  3.9999999999999996e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1527  NAD synthetase  63.97 
 
 
277 aa  348  8e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.423964 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0285  NAD synthetase  59.93 
 
 
275 aa  331  8e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.458253  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2002  NAD synthetase  59.4 
 
 
273 aa  317  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1968  NAD synthetase  59.4 
 
 
273 aa  317  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306436  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1449  NAD synthetase  58.27 
 
 
275 aa  316  2e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.220905  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0008  NAD synthetase  55.35 
 
 
275 aa  308  6.999999999999999e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1541  NAD synthetase  55.19 
 
 
273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1327  NAD synthetase  55.56 
 
 
288 aa  301  6.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168504  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0651  NAD synthetase  57.35 
 
 
277 aa  297  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1510  NAD synthetase  55.47 
 
 
272 aa  294  9e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2075  NAD synthetase  55.84 
 
 
272 aa  294  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000520517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2095  NAD synthetase  55.84 
 
 
272 aa  293  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0494  NAD synthetase  55.88 
 
 
273 aa  293  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2000  NAD synthetase  55.47 
 
 
272 aa  290  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0019517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3329  NAD synthetase  55.47 
 
 
272 aa  289  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000156548  unclonable  3.14832e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1855  NAD synthetase  55.11 
 
 
272 aa  288  6e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1810  NAD synthetase  55.11 
 
 
272 aa  288  6e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.186711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1998  NAD synthetase  55.11 
 
 
272 aa  288  6e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0298408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2031  NAD synthetase  55.11 
 
 
272 aa  288  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0182600000000003e-40 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1861  NAD synthetase  54.38 
 
 
272 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1826  NAD synthetase  54.74 
 
 
272 aa  285  7e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000200319  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1758  NAD synthetase  51.99 
 
 
276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493313  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03120  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  52.21 
 
 
280 aa  268  5e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1802  NAD synthetase  50 
 
 
276 aa  266  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2791  NAD synthetase  50.18 
 
 
276 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3609  NAD synthetase  52.96 
 
 
276 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3205  NAD synthetase  50.72 
 
 
276 aa  264  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2294  NAD synthetase  50.72 
 
 
276 aa  263  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206886  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2438  NAD synthetase  50 
 
 
296 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147914  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1432  NAD synthetase  50.18 
 
 
275 aa  260  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0922379  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3163  NAD synthetase  50.36 
 
 
276 aa  260  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000184927  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1552  NAD synthetase  49.46 
 
 
276 aa  260  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.022001  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2021  NAD synthetase  50.18 
 
 
276 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1542  NAD synthetase  49.82 
 
 
276 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.496259  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2246  NAD synthetase  49.1 
 
 
296 aa  258  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000924504  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2318  NAD synthetase  49.1 
 
 
296 aa  258  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000738561  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1464  NAD synthetase  50.89 
 
 
288 aa  258  8e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00984528  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2581  NAD synthetase  50 
 
 
276 aa  258  8e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0153325  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2658  NAD synthetase  50 
 
 
276 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2543  NAD synthetase  50 
 
 
276 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.680387  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1803  NAD synthetase  50 
 
 
276 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00266158  hitchhiker  0.0000311933 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03015  NAD synthetase  49.1 
 
 
278 aa  254  9e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00527093  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0607  NAD synthetase  48.38 
 
 
276 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0718  NAD synthetase  49.81 
 
 
282 aa  252  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.451004  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1021  NAD synthetase  50.9 
 
 
276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3443  NAD synthetase  49.45 
 
 
325 aa  249  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01960  NAD synthetase  46.67 
 
 
302 aa  248  8e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001341  NAD synthetase  49.46 
 
 
276 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3918  NAD synthetase  49.82 
 
 
281 aa  246  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0524773  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5167  NAD synthetase  47.25 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0848022 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4990  NAD synthetase  47.25 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3089  NAD synthetase  47.25 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5278  NAD synthetase  47.25 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.471439  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0837  NAD synthetase  51.3 
 
 
277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0957  NAD synthetase  51.3 
 
 
277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1989  NAD synthetase  50.55 
 
 
286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05230  NAD synthetase  49.1 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4747  NAD synthetase  51.29 
 
 
275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000246424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4869  NAD synthetase  51.29 
 
 
275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772089 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4638  NAD synthetase  47.62 
 
 
295 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0372  NAD synthetase  47.1 
 
 
282 aa  241  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.299221  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4925  NAD synthetase  51.29 
 
 
275 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7117  NAD synthetase  47.99 
 
 
277 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46548  normal  0.0526017 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4778  NAD synthetase  48.13 
 
 
288 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4661  NAD synthetase  50.92 
 
 
275 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0163  NAD synthetase  48.33 
 
 
284 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64980  NAD synthetase  50 
 
 
275 aa  234  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5646  NAD synthetase  49.63 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.899788  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0886  NAD synthetase  48.85 
 
 
284 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0547  NAD synthetase  49.63 
 
 
275 aa  232  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269229  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4602  NAD+ synthetase  49.06 
 
 
276 aa  231  8.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4784  NAD synthetase  48.54 
 
 
286 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391327  hitchhiker  0.000536951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1410  NAD synthetase  48.89 
 
 
275 aa  229  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0760  NAD synthetase  48.48 
 
 
284 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750194  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1653  NAD synthetase  48.48 
 
 
284 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0698  NAD synthetase  48.48 
 
 
284 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0683649  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0588  NAD synthetase  48.48 
 
 
284 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.153479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>