More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06585 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_06585  NH(3)-dependent NAD synthetase  100 
 
 
263 aa  550  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.878387  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1792  NAD+ synthetase  66.79 
 
 
268 aa  383  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0918  NAD+ synthetase  62.2 
 
 
256 aa  340  1e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.942289  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0568  NAD+ synthetase  58.02 
 
 
259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1366  NAD+ synthetase  40.24 
 
 
241 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19030  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  39.43 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1635  NAD+ synthetase  38.6 
 
 
243 aa  145  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.35662  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  36 
 
 
246 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0531  NH3-dependent NAD+ synthetase  40 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000693005  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl521  NH3-dependent NAD+ synthetase  35.51 
 
 
244 aa  139  3e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1801  NAD+ synthetase  36.72 
 
 
250 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1657  NAD+ synthetase  37.91 
 
 
241 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251103  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  35.46 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  32.81 
 
 
265 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0798  NAD+ synthetase  37.98 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0922  NAD+ synthetase  38.43 
 
 
246 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2526  NAD+ synthetase  36.15 
 
 
246 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0662  NAD+ synthetase  31.68 
 
 
254 aa  120  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0164353  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  34.47 
 
 
285 aa  120  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1353  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  34.51 
 
 
251 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000287377 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf282  NH(3)-dependent NAD+ synthetase  32.41 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000329858  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0229  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  32.17 
 
 
258 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1302  NAD synthetase  30.68 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.120392  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0594  NAD+ synthetase  32.68 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0895907  normal  0.216266 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1437  NAD+ synthetase  32.45 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.541928  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0716  NAD synthetase  33.72 
 
 
264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.866923 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1324  NAD+ synthetase  32.17 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.873585  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0851  NAD(+) synthase  35.78 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0966  NAD+ synthetase  31.33 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0240319 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  30.74 
 
 
263 aa  108  8.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1552  NAD synthetase  32.33 
 
 
276 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.022001  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0793  NAD synthetase  33.2 
 
 
276 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0926  NAD+ synthetase  37.07 
 
 
248 aa  106  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.486288  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2601  NAD+ synthetase  32.86 
 
 
245 aa  105  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2581  NAD synthetase  30.08 
 
 
276 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0153325  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2658  NAD synthetase  30.08 
 
 
276 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2543  NAD synthetase  30.08 
 
 
276 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.680387  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1803  NAD synthetase  30.08 
 
 
276 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00266158  hitchhiker  0.0000311933 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  29.66 
 
 
258 aa  103  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  30.5 
 
 
281 aa  103  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1544  NAD+ synthetase  31.43 
 
 
332 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2438  NAD synthetase  29.43 
 
 
296 aa  102  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147914  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1352  NAD synthetase  31.25 
 
 
275 aa  102  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280388  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0837  NAD synthetase  28.9 
 
 
277 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1432  NAD synthetase  30.42 
 
 
275 aa  102  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0922379  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3513  NAD+ synthetase  33.03 
 
 
302 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2475  NAD+ synthetase  28.84 
 
 
284 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1758  NAD synthetase  28.96 
 
 
276 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493313  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0901  NAD synthetase  30.18 
 
 
246 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0900  NAD synthetase  27.34 
 
 
246 aa  100  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.953423  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0831  NAD synthetase  30.18 
 
 
246 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0228382  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0957  NAD synthetase  28.73 
 
 
277 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0125  NAD+ synthetase  32.43 
 
 
250 aa  99.8  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0248  NAD synthetase  32.56 
 
 
270 aa  99.8  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1464  NAD synthetase  30.08 
 
 
288 aa  99.4  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00984528  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2021  NAD synthetase  30.53 
 
 
276 aa  99  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0476  NAD+ synthetase  31.27 
 
 
264 aa  99  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1822  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  37.85 
 
 
514 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3059  NAD+ synthetase  36.45 
 
 
514 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2246  NAD synthetase  30.22 
 
 
296 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000924504  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2318  NAD synthetase  30.22 
 
 
296 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000738561  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0310  NAD synthetase  33.19 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.737359  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2294  NAD synthetase  29.55 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206886  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1200  NAD synthetase  29.09 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1802  NAD synthetase  32.4 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0470  NAD+ synthetase  38.03 
 
 
514 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4922  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  31.42 
 
 
275 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0594  NAD synthetase  31.51 
 
 
275 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4778  NAD synthetase  29.92 
 
 
288 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1542  NAD synthetase  31.58 
 
 
276 aa  95.9  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.496259  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2901  NAD+ synthetase  31.13 
 
 
304 aa  95.5  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2846  NAD+ synthetase  34.63 
 
 
264 aa  95.5  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165139  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1197  NAD+ synthetase  33.33 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3163  NAD synthetase  29.32 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000184927  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2791  NAD synthetase  30.8 
 
 
276 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0247  NAD+ synthetase  28.79 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03015  NAD synthetase  28.37 
 
 
278 aa  94  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00527093  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1078  NAD+ synthetase  28.08 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03120  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.14 
 
 
280 aa  93.2  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4661  NAD synthetase  30.59 
 
 
275 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1161  NAD synthetase  31.84 
 
 
277 aa  92.4  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1454  NAD+ synthetase  32.68 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.770644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0651  NAD synthetase  28.57 
 
 
277 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1348  NAD+ synthetase  28.8 
 
 
267 aa  91.3  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0494  NAD synthetase  29.77 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1861  NAD synthetase  30 
 
 
272 aa  89.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5167  NAD synthetase  28.85 
 
 
282 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0848022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2075  NAD synthetase  30.45 
 
 
272 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000520517  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0163  NAD synthetase  30.2 
 
 
284 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1855  NAD synthetase  29.25 
 
 
272 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1810  NAD synthetase  29.25 
 
 
272 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.186711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1998  NAD synthetase  29.25 
 
 
272 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0298408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2031  NAD synthetase  29.25 
 
 
272 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0182600000000003e-40 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2095  NAD synthetase  30.45 
 
 
272 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1327  NAD synthetase  29.18 
 
 
288 aa  89.7  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168504  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1826  NAD synthetase  29.25 
 
 
272 aa  89.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000200319  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2228  NAD synthetase  30.04 
 
 
273 aa  89.4  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.529939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2000  NAD synthetase  30.45 
 
 
272 aa  89  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0019517  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2324  NAD+ synthetase  34.18 
 
 
248 aa  89  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3443  NAD synthetase  27.65 
 
 
325 aa  89  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>