More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3059 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1822  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  81.05 
 
 		 514 aa  835    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3059  NAD+ synthetase  100 
 
 		 514 aa  1026    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0470  NAD+ synthetase  81.25 
 
 		 514 aa  839    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0922  NAD+ synthetase  39.22 
 
 		 246 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0678  NAD+ synthetase  39.13 
 
 		 300 aa  114  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00181031  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2526  NAD+ synthetase  35.82 
 
 		 246 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0798  NAD+ synthetase  37.8 
 
 		 255 aa  110  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  32.22 
 
 		 263 aa  110  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19030  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  37.26 
 
 		 247 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1792  NAD+ synthetase  34.4 
 
 		 268 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  32.71 
 
 		 265 aa  105  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0918  NAD+ synthetase  32.43 
 
 		 256 aa  102  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.942289  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  36.19 
 
 		 281 aa  100  8e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1801  NAD+ synthetase  36.17 
 
 		 250 aa  99.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1657  NAD+ synthetase  34.78 
 
 		 241 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251103  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06585  NH(3)-dependent NAD synthetase  36.45 
 
 		 263 aa  97.8  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.878387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36880  putative ompetence-damaged protein  47.15 
 
 		 172 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.217311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  43.51 
 
 		 175 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  41.3 
 
 		 168 aa  95.9  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  45.86 
 
 		 161 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  45.86 
 
 		 161 aa  93.6  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0568  NAD+ synthetase  39.15 
 
 		 259 aa  93.2  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2862  NAD synthetase  31.85 
 
 		 271 aa  92.8  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158436  hitchhiker  0.000000740071 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  43.33 
 
 		 159 aa  93.2  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  43.05 
 
 		 168 aa  92.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0125  NAD+ synthetase  28.89 
 
 		 250 aa  91.7  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  35.68 
 
 		 246 aa  91.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0564  NAD synthetase  34.21 
 
 		 277 aa  91.7  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.514395  normal  0.335445 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  35.79 
 
 		 258 aa  91.7  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  46.34 
 
 		 175 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2118  NAD+ synthetase  31.23 
 
 		 283 aa  90.1  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0531  NH3-dependent NAD+ synthetase  32.73 
 
 		 253 aa  90.1  1e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000693005  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1366  NAD+ synthetase  38.95 
 
 		 241 aa  89.7  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1348  NAD+ synthetase  32.86 
 
 		 267 aa  88.6  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0247  NAD+ synthetase  28.16 
 
 		 261 aa  89  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  40.54 
 
 		 176 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3134  CinA domain-containing protein  45.83 
 
 		 164 aa  88.6  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582332 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0652  NAD synthetase  33.96 
 
 		 273 aa  88.6  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0594  NAD+ synthetase  35.79 
 
 		 258 aa  88.2  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0895907  normal  0.216266 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  46.96 
 
 		 175 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0852  CinA domain protein  38.21 
 
 		 275 aa  87.4  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.168381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3170  CinA domain-containing protein  45.9 
 
 		 172 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1324  NAD+ synthetase  35.94 
 
 		 258 aa  87.4  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.873585  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2602  CinA domain-containing protein  41.29 
 
 		 163 aa  87  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1078  NAD+ synthetase  29.77 
 
 		 248 aa  87.4  6e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1482  CinA domain-containing protein  42.66 
 
 		 157 aa  87  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  33.73 
 
 		 415 aa  87  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0283  NAD+ synthetase  28.62 
 
 		 281 aa  86.7  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000382877  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  37.4 
 
 		 166 aa  86.7  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  36.02 
 
 		 164 aa  86.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  39.47 
 
 		 170 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4777  CinA domain-containing protein  44.53 
 
 		 167 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4661  NAD synthetase  30.82 
 
 		 275 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0926  NAD+ synthetase  37.57 
 
 		 248 aa  85.9  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.486288  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  38 
 
 		 169 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1353  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  34.21 
 
 		 251 aa  85.5  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000287377 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0524  NAD synthetase  29.93 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00084684  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  30.33 
 
 		 263 aa  85.5  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1302  NAD synthetase  29.64 
 
 		 269 aa  85.9  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.120392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1635  NAD+ synthetase  33.69 
 
 		 243 aa  85.9  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.35662  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0901  NAD synthetase  32.02 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  44.64 
 
 		 166 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  44.64 
 
 		 166 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  36.48 
 
 		 164 aa  85.1  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  44.64 
 
 		 166 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  44.64 
 
 		 166 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  39.34 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0900  NAD synthetase  33.17 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.953423  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  44.64 
 
 		 166 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  44.64 
 
 		 166 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0831  NAD synthetase  32.02 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0228382  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  44.64 
 
 		 166 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  41.18 
 
 		 166 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0662  NAD+ synthetase  33.67 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0164353  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1200  NAD synthetase  31.53 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl521  NH3-dependent NAD+ synthetase  31.8 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  42 
 
 		 162 aa  84.3  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  43.22 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  41.67 
 
 		 165 aa  84.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4869  NAD synthetase  32.89 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772089 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  36.48 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3754  NAD synthetase  34.72 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.583588  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0284  NAD+ synthetase  27.84 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  40.82 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  46.77 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1706  competence/damage-inducible protein CinA  37.6 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.174221  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  38.31 
 
 		 436 aa  83.2  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  27.6 
 
 		 285 aa  83.2  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  42.28 
 
 		 166 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4747  NAD synthetase  32.46 
 
 		 275 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000246424 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  37.65 
 
 		 166 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  43.75 
 
 		 166 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  38.27 
 
 		 166 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  34.46 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3421  NAD synthetase  35.6 
 
 		 273 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  38.27 
 
 		 184 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  41.61 
 
 		 162 aa  82.8  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0594  NAD synthetase  31.08 
 
 		 275 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0608  CinA, C-terminal  41.67 
 
 		 259 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  42.37 
 
 		 166 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>