More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3170 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3170  CinA domain-containing protein  100 
 
 		 172 aa  340  8e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36880  putative ompetence-damaged protein  88.37 
 
 		 172 aa  300  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.217311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2789  CinA-like  51.19 
 
 		 171 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3298  CinA domain-containing protein  47.27 
 
 		 167 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3003  CinA domain-containing protein  47.8 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.500427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2431  CinA domain-containing protein  47.17 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.197767  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2276  CinA domain-containing protein  43.67 
 
 		 160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0906635  hitchhiker  0.00967543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47070  CinA-related protein  42.86 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.797955  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4777  CinA domain-containing protein  41.14 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0608  CinA, C-terminal  41.06 
 
 		 259 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0164  competence/damage-inducible protein CinA  40 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  43.71 
 
 		 422 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  41.67 
 
 		 166 aa  91.7  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  41.67 
 
 		 184 aa  91.7  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  37.42 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  40.28 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  41.67 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3059  NAD+ synthetase  45.9 
 
 		 514 aa  87.4  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1706  competence/damage-inducible protein CinA  30.06 
 
 		 192 aa  87  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.174221  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  39.46 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  38.89 
 
 		 166 aa  86.3  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  38.31 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  39.46 
 
 		 164 aa  85.9  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  38.31 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  38.78 
 
 		 165 aa  85.5  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  40.26 
 
 		 165 aa  85.9  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  38.31 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  39.58 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  38.93 
 
 		 165 aa  85.5  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  39.58 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  39.58 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  38.31 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  38.31 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  38.31 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  38.31 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  49.06 
 
 		 161 aa  85.1  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  49.06 
 
 		 161 aa  85.5  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1482  CinA domain-containing protein  46.96 
 
 		 157 aa  84.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  41.83 
 
 		 173 aa  84.3  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  40.67 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0470  NAD+ synthetase  40.52 
 
 		 514 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1822  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.52 
 
 		 514 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  40.4 
 
 		 422 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  38.41 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  41.43 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  37.89 
 
 		 431 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0852  CinA domain protein  36.73 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.168381  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  35.81 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38570  CinA-related protein  39.22 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  40.43 
 
 		 421 aa  80.9  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  40.43 
 
 		 421 aa  80.9  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  40.43 
 
 		 421 aa  80.9  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  41.5 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  39.07 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1911  CinA domain-containing protein  42.55 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.162967  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  41.67 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  41.5 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  37.75 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  35.76 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  37.33 
 
 		 203 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1514  CinA domain-containing protein  39.46 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  34.64 
 
 		 429 aa  77.4  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  39.46 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  35.42 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  40.49 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  37.2 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  36.11 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  46 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  38.51 
 
 		 430 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  36.11 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  41.06 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  34.9 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  36.11 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1627  competence damage-inducible protein A  36.3 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000853954  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  38.31 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1923  CinA-like  38.03 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.150163  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  36.59 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  40.82 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  35.53 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  40.59 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  35.42 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  35.42 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  35.42 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  35.42 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  35.42 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  35.42 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  35.42 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  35.42 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4089  CinA domain-containing protein  37.09 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  35.42 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  37.75 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  41.26 
 
 		 179 aa  73.9  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  34.64 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0243  CinA domain-containing protein  37.14 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.912222  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0492  competence/damage-inducible protein cinA  39.04 
 
 		 382 aa  73.9  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  35.42 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  34.9 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  35.42 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2153  competence damage-inducible protein A  36.59 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0198899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  33.77 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>