More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0221 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  100 
 
 		 164 aa  333  9e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  54.9 
 
 		 166 aa  173  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  56.77 
 
 		 164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  56.77 
 
 		 164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  54.25 
 
 		 184 aa  171  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  54.25 
 
 		 166 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  54.25 
 
 		 166 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  54.25 
 
 		 166 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  53.59 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  53.59 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  56.16 
 
 		 165 aa  168  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  53.85 
 
 		 166 aa  168  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  53.21 
 
 		 166 aa  167  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  52.35 
 
 		 165 aa  166  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  53.95 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  57.52 
 
 		 173 aa  164  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  50 
 
 		 166 aa  164  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  51.63 
 
 		 166 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  50.98 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  50.98 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  50.98 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  50.98 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  50.98 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  50.98 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  52.2 
 
 		 168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  50.98 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  52.56 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  50 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  53.75 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  54.67 
 
 		 169 aa  158  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  51.63 
 
 		 166 aa  157  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  50.31 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  55.41 
 
 		 166 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  50.93 
 
 		 168 aa  155  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  53.29 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  48.75 
 
 		 160 aa  147  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  49.03 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  46.45 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  48.37 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  51.45 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  49.34 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2530  competence/damage-inducible protein CinA  54.3 
 
 		 424 aa  144  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  50.32 
 
 		 176 aa  143  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  49.06 
 
 		 418 aa  143  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0483  CinA domain protein  58.22 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  53.79 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  53.79 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  53.79 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  53.79 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  53.79 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  53.79 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  53.79 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  45.51 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  50.33 
 
 		 203 aa  140  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0076  CinA-like  49.02 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  52.29 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1514  CinA domain-containing protein  52.35 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0069  CinA family protein  49.02 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  47.4 
 
 		 162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  53.1 
 
 		 165 aa  137  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  48.28 
 
 		 414 aa  137  6e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1377  CinA, C-terminal  47.71 
 
 		 192 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.368331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  52.41 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  51.72 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  51.72 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  47.53 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  51.72 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  47.97 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  47.2 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  51.03 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  52.29 
 
 		 414 aa  135  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0633  putative competence-damaged protein  50.7 
 
 		 165 aa  135  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  49.31 
 
 		 421 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  53.52 
 
 		 175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  51.03 
 
 		 165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03080  CinA-like protein  41.61 
 
 		 179 aa  134  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  56.8 
 
 		 165 aa  134  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2602  CinA domain-containing protein  50.32 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  48.61 
 
 		 421 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  48.61 
 
 		 421 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38570  CinA-related protein  47.1 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  52.29 
 
 		 414 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  51.75 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3134  CinA domain-containing protein  45.58 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  49.03 
 
 		 166 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1704  CinA domain protein  48.34 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.28377  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  47.65 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  44.08 
 
 		 411 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  48.7 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  48.95 
 
 		 430 aa  131  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  48.99 
 
 		 175 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  49.63 
 
 		 184 aa  130  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  47.71 
 
 		 422 aa  130  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  49.63 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4089  CinA domain-containing protein  47.37 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  43.04 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  41.1 
 
 		 169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  49.63 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  53.91 
 
 		 426 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17520  hypothetical protein  50 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>