More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0633 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0633  putative competence-damaged protein  100 
 
 		 165 aa  340  5e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0069  CinA family protein  56.21 
 
 		 168 aa  178  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  53.75 
 
 		 160 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  52.5 
 
 		 160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  50.96 
 
 		 160 aa  160  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  53.85 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  53.85 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  53.85 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  53.85 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  53.21 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  53.85 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  53.85 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  53.85 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  53.33 
 
 		 165 aa  157  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  54.67 
 
 		 184 aa  156  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  53.55 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  53.21 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  53.55 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  52.56 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  51.92 
 
 		 165 aa  154  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  52.56 
 
 		 165 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  51.92 
 
 		 165 aa  154  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  51.92 
 
 		 165 aa  154  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  50.97 
 
 		 162 aa  154  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  50.65 
 
 		 166 aa  154  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  51.28 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  50.64 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  52.38 
 
 		 166 aa  148  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  51.33 
 
 		 165 aa  148  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  51.7 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  50.99 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  51.35 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  51.02 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  50.99 
 
 		 166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  48.08 
 
 		 163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1113  competence damage-inducible protein A  50.64 
 
 		 164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383683  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  51.68 
 
 		 162 aa  144  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3214  competence damage-inducible protein A  50.64 
 
 		 164 aa  143  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  48.72 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  48.68 
 
 		 162 aa  142  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  47.44 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  47.44 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3262  CinA-like  49.68 
 
 		 170 aa  141  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  48.65 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  46.79 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  47.44 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  47.44 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  47.44 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  46.15 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  46.15 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  50 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  46.15 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  46.15 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  46.15 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  46.15 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  46.15 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  46.31 
 
 		 175 aa  137  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  46.79 
 
 		 166 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  46.79 
 
 		 184 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  47.44 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  48.34 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  48.19 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  42.86 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03080  CinA-like protein  47.24 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  48.39 
 
 		 164 aa  134  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  50.7 
 
 		 164 aa  135  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  45.45 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  44.97 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  50 
 
 		 173 aa  134  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  47.4 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  45.73 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  47.59 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  47.4 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  46.15 
 
 		 165 aa  131  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  46.75 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  44.23 
 
 		 176 aa  130  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0622  CinA-like protein  46.41 
 
 		 174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.550403  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  47.65 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  46.26 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  49.65 
 
 		 161 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  50 
 
 		 175 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  49.29 
 
 		 175 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  48.91 
 
 		 418 aa  127  8.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3733  CinA domain-containing protein  45.28 
 
 		 166 aa  127  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000115453 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  49.65 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1593  CinA-like  48.92 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  48.34 
 
 		 211 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  45.39 
 
 		 403 aa  125  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1704  CinA domain protein  46.79 
 
 		 200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.28377  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  50.35 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  46.81 
 
 		 140 aa  124  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1514  CinA domain-containing protein  49.32 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  44.52 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38570  CinA-related protein  45.28 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  45.16 
 
 		 422 aa  123  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00153  competence/damage-inducible protein CinA domain protein  42.21 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  47.68 
 
 		 206 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  47.02 
 
 		 208 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  44.3 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  43.4 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>