More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0581 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  100 
 
 		 175 aa  353  7.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  70 
 
 		 179 aa  227  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  75.71 
 
 		 163 aa  208  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  70.2 
 
 		 156 aa  206  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  63.53 
 
 		 173 aa  202  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  67.36 
 
 		 168 aa  201  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  65.54 
 
 		 169 aa  184  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0076  CinA-like  60.59 
 
 		 167 aa  180  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  63.38 
 
 		 165 aa  180  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  57.23 
 
 		 166 aa  177  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  57.14 
 
 		 166 aa  177  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  63.04 
 
 		 166 aa  175  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  56.6 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0483  CinA domain protein  69.01 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  60.56 
 
 		 165 aa  175  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  63.5 
 
 		 166 aa  175  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  62.77 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  62.77 
 
 		 166 aa  174  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  62.77 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  62.77 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  62.04 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  58.62 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  63.43 
 
 		 166 aa  170  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  60.74 
 
 		 166 aa  170  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  62.69 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  62.69 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  62.69 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  62.69 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  62.69 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  62.69 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  62.69 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  60.87 
 
 		 166 aa  167  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  60.29 
 
 		 168 aa  160  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  56.46 
 
 		 166 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0343  CinA domain protein  70.83 
 
 		 189 aa  157  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251569  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  59.86 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  54.55 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  52.98 
 
 		 159 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  48.99 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  50.68 
 
 		 162 aa  149  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  52.9 
 
 		 164 aa  148  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  51.02 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  49.66 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  52.17 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  56.08 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  48.99 
 
 		 165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  48.99 
 
 		 165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  48.99 
 
 		 165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  51.45 
 
 		 164 aa  145  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  48 
 
 		 184 aa  145  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1656  CinA domain-containing protein  53.15 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  48 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  53.69 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  48 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  49.66 
 
 		 165 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  47.65 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  47.65 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  48.05 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  47.65 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  47.65 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  47.65 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  47.65 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  47.65 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  48.63 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  47.65 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  53.79 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  55.63 
 
 		 165 aa  142  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 162 aa  142  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1079  competence/damage-inducible protein CinA  55.63 
 
 		 165 aa  142  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0607096  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  52.11 
 
 		 203 aa  140  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  59.85 
 
 		 140 aa  140  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  46.31 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4031  CinA domain-containing protein  55.97 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306417  unclonable  0.0000000000000327829 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  46.79 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0633  putative competence-damaged protein  46.31 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1174  CinA-like  48.17 
 
 		 177 aa  137  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1911  CinA domain-containing protein  59.7 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.162967  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4089  CinA domain-containing protein  55.22 
 
 		 160 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  52.41 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1514  CinA domain-containing protein  52.23 
 
 		 167 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0069  CinA family protein  48.98 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1628  CinA domain-containing protein  55.22 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1377  CinA, C-terminal  47.93 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.368331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1593  CinA-like  43.64 
 
 		 166 aa  134  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  44.85 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  51.41 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  49.25 
 
 		 166 aa  134  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0971  CinA domain protein  46.36 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00476179  hitchhiker  0.00000668573 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2068  CinA domain-containing protein  52.11 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  50.69 
 
 		 218 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  50.68 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  50 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1230  CinA domain-containing protein  53.73 
 
 		 160 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000125807 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  48.89 
 
 		 414 aa  132  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  48.89 
 
 		 162 aa  132  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38570  CinA-related protein  47.77 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  42.86 
 
 		 169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1113  competence damage-inducible protein A  47.8 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383683  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17520  hypothetical protein  49.37 
 
 		 168 aa  131  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2477  CinA domain protein  42.57 
 
 		 156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>