More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0712 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  100 
 
 
162 aa  317  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  64.74 
 
 
166 aa  192  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  55.35 
 
 
169 aa  180  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0069  CinA family protein  58.06 
 
 
168 aa  177  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  58.28 
 
 
160 aa  174  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  56.79 
 
 
165 aa  173  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  57.41 
 
 
165 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  56.17 
 
 
166 aa  173  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  57.41 
 
 
165 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  57.41 
 
 
165 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  56.79 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  56.79 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  56.79 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  56.79 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  57.79 
 
 
162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  56.79 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  56.79 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  56.79 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  56.79 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  56.79 
 
 
165 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  53.46 
 
 
184 aa  169  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  54.72 
 
 
165 aa  169  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  53.46 
 
 
162 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  53.46 
 
 
162 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  57.05 
 
 
159 aa  168  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  57.14 
 
 
160 aa  168  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  55.56 
 
 
165 aa  167  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00153  competence/damage-inducible protein CinA domain protein  59.35 
 
 
164 aa  167  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  55.84 
 
 
165 aa  166  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  52.47 
 
 
162 aa  165  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1473  CinA domain protein  57.05 
 
 
166 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  55.19 
 
 
165 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0055  CinA domain-containing protein  53.21 
 
 
162 aa  161  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  54.78 
 
 
166 aa  160  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  53.59 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  62.03 
 
 
165 aa  160  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  55.06 
 
 
166 aa  160  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  54.14 
 
 
166 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0067  competence/damage inducible protein CinA  52.56 
 
 
162 aa  159  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  56.85 
 
 
160 aa  159  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  55.06 
 
 
166 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  54.55 
 
 
166 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  54.43 
 
 
166 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  55.06 
 
 
166 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  55.35 
 
 
162 aa  158  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  54.43 
 
 
166 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  54.43 
 
 
166 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  54.43 
 
 
166 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  54.43 
 
 
166 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  54.43 
 
 
166 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  54.43 
 
 
166 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  53.5 
 
 
166 aa  158  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  54.43 
 
 
166 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  53.9 
 
 
166 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  54.43 
 
 
166 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  50.31 
 
 
165 aa  157  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1593  CinA-like  52.26 
 
 
166 aa  157  7e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  53.8 
 
 
184 aa  157  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  53.9 
 
 
166 aa  155  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3214  competence damage-inducible protein A  55.35 
 
 
164 aa  155  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  53.8 
 
 
166 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  53.16 
 
 
166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  50.31 
 
 
172 aa  150  8.999999999999999e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1113  competence damage-inducible protein A  53.46 
 
 
164 aa  148  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383683  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  52.23 
 
 
166 aa  147  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  52.9 
 
 
168 aa  147  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  59.31 
 
 
173 aa  147  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  52.29 
 
 
176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  56.58 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  56.08 
 
 
175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4089  CinA domain-containing protein  57.42 
 
 
160 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  52.53 
 
 
203 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  48.78 
 
 
208 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3733  CinA domain-containing protein  51.92 
 
 
166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000115453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4031  CinA domain-containing protein  56.13 
 
 
160 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306417  unclonable  0.0000000000000327829 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  48.7 
 
 
164 aa  143  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0633  putative competence-damaged protein  48.68 
 
 
165 aa  142  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  48.7 
 
 
164 aa  143  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0622  CinA-like protein  55.06 
 
 
174 aa  143  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.550403  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1628  CinA domain-containing protein  56.49 
 
 
160 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1377  CinA, C-terminal  52.47 
 
 
192 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.368331  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17520  hypothetical protein  55.35 
 
 
168 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1522  hypothetical protein  54.72 
 
 
168 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  50.62 
 
 
208 aa  141  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  50.62 
 
 
206 aa  141  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  52.23 
 
 
211 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  54.55 
 
 
414 aa  140  7e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  59.71 
 
 
163 aa  140  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  52.9 
 
 
169 aa  140  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  52.17 
 
 
202 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4034  cinA domain protein  54.49 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.344001  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1230  CinA domain-containing protein  54.84 
 
 
160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000000125807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1174  CinA-like  52.9 
 
 
177 aa  137  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  50 
 
 
208 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  51.9 
 
 
168 aa  137  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1808  CinA domain protein  58.7 
 
 
166 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101343 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  59.7 
 
 
156 aa  135  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  48.43 
 
 
161 aa  134  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1704  CinA domain protein  46.95 
 
 
200 aa  134  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.28377  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2130  competence-damage associated protein  52.32 
 
 
168 aa  133  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>