More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2068 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2068  CinA domain-containing protein  100 
 
 
163 aa  323  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  78.4 
 
 
165 aa  247  4e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1079  competence/damage-inducible protein CinA  78.4 
 
 
165 aa  247  4e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0607096  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2130  competence-damage associated protein  59.24 
 
 
168 aa  171  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1514  CinA domain-containing protein  59.21 
 
 
167 aa  168  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1808  CinA domain protein  60.43 
 
 
166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101343 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  57.89 
 
 
162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  64.03 
 
 
175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1615  CinA domain protein  53.46 
 
 
166 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  64.75 
 
 
175 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  54.55 
 
 
203 aa  159  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  56.29 
 
 
203 aa  158  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  64.75 
 
 
175 aa  158  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  53.25 
 
 
211 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  53.46 
 
 
208 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  55.63 
 
 
166 aa  155  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1086  CinA domain-containing protein  56.58 
 
 
165 aa  154  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  50.92 
 
 
206 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  53.9 
 
 
202 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  53.02 
 
 
208 aa  153  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  59.86 
 
 
161 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  59.15 
 
 
161 aa  150  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  50.66 
 
 
208 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1923  CinA-like  52.32 
 
 
167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.150163  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  50.97 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3134  CinA domain-containing protein  52.38 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.582332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  50 
 
 
166 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1482  CinA domain-containing protein  59.7 
 
 
157 aa  144  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0243  CinA domain-containing protein  54.67 
 
 
178 aa  143  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.912222  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  53.5 
 
 
166 aa  143  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2602  CinA domain-containing protein  50 
 
 
163 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471357  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  50 
 
 
166 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  52.23 
 
 
166 aa  140  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  59.42 
 
 
140 aa  140  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  53.79 
 
 
166 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  51.63 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  50.65 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  51.63 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  51.63 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  51.77 
 
 
166 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  51.7 
 
 
165 aa  138  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  50.98 
 
 
184 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  50.98 
 
 
166 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  50.99 
 
 
164 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  50.33 
 
 
166 aa  133  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  53.06 
 
 
164 aa  133  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  52.11 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  50 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  58.33 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  51.39 
 
 
160 aa  131  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0525  CinA domain protein  55.33 
 
 
163 aa  132  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  54.48 
 
 
173 aa  131  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  52.21 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  57.5 
 
 
166 aa  131  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  57.5 
 
 
166 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  57.5 
 
 
166 aa  131  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  57.5 
 
 
166 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  57.5 
 
 
166 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  57.5 
 
 
166 aa  131  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  57.5 
 
 
166 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  48.32 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  48.2 
 
 
411 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  48.32 
 
 
166 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  48.32 
 
 
166 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2173  CinA domain-containing protein  60.87 
 
 
165 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19979  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1473  CinA domain protein  47.62 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1279  CinA-like protein  50.93 
 
 
185 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270963  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  51.43 
 
 
168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  47.97 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  52.38 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  56.2 
 
 
179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  47.97 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  47.97 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  47.97 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  47.65 
 
 
165 aa  125  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  47.65 
 
 
165 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  47.65 
 
 
165 aa  125  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  47.65 
 
 
165 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  47.65 
 
 
165 aa  125  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  47.65 
 
 
165 aa  125  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  47.65 
 
 
165 aa  125  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  54.41 
 
 
163 aa  125  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  49.37 
 
 
166 aa  124  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  51.43 
 
 
165 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  53.57 
 
 
156 aa  124  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  54.95 
 
 
165 aa  123  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  45.77 
 
 
160 aa  123  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  47.3 
 
 
165 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  48.67 
 
 
165 aa  123  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  48.97 
 
 
164 aa  123  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  49.28 
 
 
413 aa  123  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1422  CinA domain-containing protein  44.87 
 
 
171 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  51.91 
 
 
414 aa  122  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  51.45 
 
 
168 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  47.89 
 
 
165 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  47.22 
 
 
160 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3665  CinA domain-containing protein  59.69 
 
 
139 aa  121  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  43.57 
 
 
159 aa  121  5e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  46.31 
 
 
165 aa  120  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  47.1 
 
 
413 aa  120  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>