More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2233 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  100 
 
 
140 aa  278  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  70.07 
 
 
161 aa  184  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  69.34 
 
 
161 aa  181  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  62.04 
 
 
159 aa  167  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1482  CinA domain-containing protein  69.29 
 
 
157 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3665  CinA domain-containing protein  67.44 
 
 
139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  65.71 
 
 
175 aa  155  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1579  CinA-like protein  60.87 
 
 
160 aa  155  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0260319 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  60.58 
 
 
166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  63.64 
 
 
166 aa  151  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  65.25 
 
 
175 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  59.85 
 
 
165 aa  147  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  62.6 
 
 
166 aa  147  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  59.85 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  61.83 
 
 
166 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  61.07 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  61.31 
 
 
179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  61.07 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  61.07 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  61.07 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  61.07 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  61.07 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  61.07 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  58.33 
 
 
166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  57.55 
 
 
168 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  58.33 
 
 
166 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  55.71 
 
 
206 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  62.88 
 
 
173 aa  143  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  59.57 
 
 
166 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  58.33 
 
 
166 aa  142  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  57.58 
 
 
166 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  57.78 
 
 
208 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  59.56 
 
 
166 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  60.43 
 
 
162 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  59.12 
 
 
156 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  56.12 
 
 
211 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  61.07 
 
 
166 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  61.07 
 
 
166 aa  141  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  61.07 
 
 
166 aa  141  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  61.07 
 
 
166 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  58.33 
 
 
166 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  60.31 
 
 
184 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  55 
 
 
203 aa  140  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2068  CinA domain-containing protein  59.42 
 
 
163 aa  140  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  57.58 
 
 
166 aa  140  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  59.85 
 
 
175 aa  140  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  60.61 
 
 
163 aa  138  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  57.03 
 
 
165 aa  137  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  54.01 
 
 
208 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  54.68 
 
 
208 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  55.63 
 
 
160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  59.71 
 
 
175 aa  137  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1086  CinA domain-containing protein  59.71 
 
 
165 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1808  CinA domain protein  55.88 
 
 
166 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101343 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  56.74 
 
 
160 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1615  CinA domain protein  53.68 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  58.27 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1079  competence/damage-inducible protein CinA  58.27 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0607096  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1514  CinA domain-containing protein  57.55 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  56.06 
 
 
164 aa  131  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  56.06 
 
 
164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  56.72 
 
 
166 aa  130  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0483  CinA domain protein  63.97 
 
 
184 aa  129  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  51.8 
 
 
202 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  52.9 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2130  competence-damage associated protein  57.04 
 
 
168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  54.89 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  53.19 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  57.97 
 
 
168 aa  128  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  51.82 
 
 
165 aa  128  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0069  CinA family protein  52.63 
 
 
168 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  56.82 
 
 
169 aa  127  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  53.03 
 
 
169 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  52.21 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  63.21 
 
 
165 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  52.21 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  57.14 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  66.02 
 
 
162 aa  124  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  58.09 
 
 
203 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3134  CinA domain-containing protein  52.55 
 
 
164 aa  125  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.582332 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0633  putative competence-damaged protein  46.81 
 
 
165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1923  CinA-like  53.57 
 
 
167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.150163  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  55.32 
 
 
176 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.895217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  50.71 
 
 
165 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  50.71 
 
 
165 aa  124  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  50.71 
 
 
165 aa  124  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  50.71 
 
 
165 aa  124  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  50.71 
 
 
165 aa  124  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  50.71 
 
 
165 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  50.71 
 
 
165 aa  124  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  50.71 
 
 
165 aa  124  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0852  CinA domain protein  47.1 
 
 
275 aa  123  6e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.168381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  48.57 
 
 
411 aa  122  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  49.29 
 
 
165 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  49.29 
 
 
165 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  49.29 
 
 
165 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  54.07 
 
 
429 aa  122  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  48.57 
 
 
165 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  47.48 
 
 
413 aa  121  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0076  CinA-like  55.88 
 
 
167 aa  120  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>