More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3402 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  100 
 
 
166 aa  338  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  95.18 
 
 
166 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  89.09 
 
 
166 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  85.45 
 
 
166 aa  294  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  85.45 
 
 
166 aa  294  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  85.45 
 
 
166 aa  293  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  85.45 
 
 
166 aa  293  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  85.45 
 
 
166 aa  293  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  85.45 
 
 
166 aa  293  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  85.45 
 
 
166 aa  293  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  85.45 
 
 
166 aa  293  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  85.45 
 
 
166 aa  293  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  84.85 
 
 
166 aa  293  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  83.64 
 
 
166 aa  290  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  84.24 
 
 
166 aa  289  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  83.64 
 
 
166 aa  289  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  83.64 
 
 
166 aa  288  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  83.03 
 
 
184 aa  286  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  70.81 
 
 
165 aa  234  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  70.19 
 
 
165 aa  230  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  66.67 
 
 
166 aa  225  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  66.06 
 
 
166 aa  224  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  66.67 
 
 
166 aa  222  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  52.5 
 
 
165 aa  176  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  64.49 
 
 
156 aa  175  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  57.89 
 
 
179 aa  173  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  58.62 
 
 
175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  55.78 
 
 
173 aa  169  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  60.28 
 
 
163 aa  169  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  56.67 
 
 
176 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  55.41 
 
 
168 aa  168  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  54.25 
 
 
164 aa  167  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  50.31 
 
 
169 aa  166  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  55.33 
 
 
169 aa  164  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  52.29 
 
 
164 aa  160  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  55.1 
 
 
160 aa  159  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  50.92 
 
 
165 aa  160  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  53.5 
 
 
162 aa  158  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  51.63 
 
 
164 aa  157  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  53.25 
 
 
165 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  53.25 
 
 
165 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  53.25 
 
 
165 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  51.95 
 
 
162 aa  155  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  53.25 
 
 
165 aa  156  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  53.25 
 
 
165 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  53.25 
 
 
165 aa  156  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  52.6 
 
 
165 aa  155  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  53.25 
 
 
165 aa  156  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  59.09 
 
 
160 aa  154  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  52.47 
 
 
165 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  50.64 
 
 
166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  50.64 
 
 
166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  51.95 
 
 
165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  51.95 
 
 
165 aa  151  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  51.3 
 
 
165 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  51.3 
 
 
165 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  51.3 
 
 
165 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1593  CinA-like  44.24 
 
 
166 aa  150  7e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  50.33 
 
 
159 aa  150  8e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  45.4 
 
 
166 aa  149  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2602  CinA domain-containing protein  56.29 
 
 
163 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471357  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0069  CinA family protein  48.37 
 
 
168 aa  148  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  50.65 
 
 
165 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  49.02 
 
 
184 aa  148  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  49.02 
 
 
162 aa  147  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  49.02 
 
 
162 aa  147  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  47.77 
 
 
162 aa  147  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  50.34 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0076  CinA-like  52.7 
 
 
167 aa  145  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0633  putative competence-damaged protein  51.02 
 
 
165 aa  145  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  50.33 
 
 
168 aa  145  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00153  competence/damage-inducible protein CinA domain protein  46.3 
 
 
164 aa  144  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2068  CinA domain-containing protein  50 
 
 
163 aa  144  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  48.15 
 
 
172 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1473  CinA domain protein  46.3 
 
 
166 aa  143  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1079  competence/damage-inducible protein CinA  49.35 
 
 
165 aa  142  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0607096  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  49.35 
 
 
165 aa  142  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1514  CinA domain-containing protein  53.33 
 
 
167 aa  143  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  55.07 
 
 
166 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  48.98 
 
 
203 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  57.58 
 
 
140 aa  142  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  47.5 
 
 
168 aa  142  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  46.72 
 
 
411 aa  142  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  45.22 
 
 
162 aa  142  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  50.64 
 
 
166 aa  142  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  49.66 
 
 
418 aa  141  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  55.32 
 
 
175 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0483  CinA domain protein  56.52 
 
 
184 aa  140  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  56.06 
 
 
175 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4031  CinA domain-containing protein  47.68 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306417  unclonable  0.0000000000000327829 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1656  CinA domain-containing protein  47.74 
 
 
165 aa  138  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  48.68 
 
 
414 aa  138  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1808  CinA domain protein  51.06 
 
 
166 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101343 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0343  CinA domain protein  67 
 
 
189 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251569  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1113  competence damage-inducible protein A  48.41 
 
 
164 aa  137  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383683  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3134  CinA domain-containing protein  51.49 
 
 
164 aa  137  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.582332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  56.06 
 
 
175 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  47.8 
 
 
166 aa  136  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  49.04 
 
 
168 aa  136  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2530  competence/damage-inducible protein CinA  51.88 
 
 
424 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>