More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0971 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0971  CinA domain protein  100 
 
 		 160 aa  322  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00476179  hitchhiker  0.00000668573 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  56.25 
 
 		 218 aa  151  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  50 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2477  CinA domain protein  51.97 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  51.9 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  51.59 
 
 		 169 aa  148  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3733  CinA domain-containing protein  51.97 
 
 		 166 aa  143  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000115453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  52.14 
 
 		 173 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  52.21 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  51.68 
 
 		 159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1628  CinA domain-containing protein  50.65 
 
 		 160 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3262  CinA-like  46.79 
 
 		 170 aa  137  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  45.45 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4089  CinA domain-containing protein  50.65 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  45.52 
 
 		 408 aa  135  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  48.99 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1656  CinA domain-containing protein  51.05 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1230  CinA domain-containing protein  51.3 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000125807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4031  CinA domain-containing protein  52.63 
 
 		 160 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306417  unclonable  0.0000000000000327829 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  44.83 
 
 		 408 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  52.05 
 
 		 168 aa  134  7.000000000000001e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  47.71 
 
 		 179 aa  133  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  46.36 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  46 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  47.68 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  47.68 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  47.68 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  47.68 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  47.68 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  47.68 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  47.68 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0781  CinA-like  47.89 
 
 		 362 aa  131  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00322218  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  47.68 
 
 		 165 aa  131  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03080  CinA-like protein  47.22 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  48 
 
 		 168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  48.03 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  48.03 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  48.03 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  50.34 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  41.78 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  48.97 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  46.36 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  48.97 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1522  hypothetical protein  50.68 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  47.37 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  41.45 
 
 		 415 aa  128  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  48.97 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  46.58 
 
 		 415 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1593  CinA-like  47.3 
 
 		 166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  47.37 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  46.67 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  45.07 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  46.21 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  44.59 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  44.59 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  44.59 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  44.59 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  46.98 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  43.92 
 
 		 184 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  44.65 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  45.33 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  45.33 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  45.33 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  45.33 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  45.33 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  45.33 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  45.33 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  45.4 
 
 		 166 aa  124  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1704  CinA domain protein  45.96 
 
 		 200 aa  123  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.28377  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17520  hypothetical protein  49.32 
 
 		 168 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  40.91 
 
 		 418 aa  123  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  43.92 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  46.95 
 
 		 196 aa  122  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  43.24 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3214  competence damage-inducible protein A  46.9 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  45.1 
 
 		 420 aa  122  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  42.86 
 
 		 166 aa  121  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0622  CinA-like protein  49.66 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.550403  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  47.13 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  47.52 
 
 		 437 aa  121  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  47.02 
 
 		 436 aa  121  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  44.97 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3194  CinA domain-containing protein  50 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000125042  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  44.37 
 
 		 430 aa  120  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1113  competence damage-inducible protein A  46.9 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383683  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  44.37 
 
 		 430 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  41.55 
 
 		 408 aa  120  7e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1377  CinA, C-terminal  50.38 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.368331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  43.26 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  46.62 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  44.29 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  43.4 
 
 		 172 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  44.93 
 
 		 401 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  44.22 
 
 		 416 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00153  competence/damage-inducible protein CinA domain protein  48.97 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  44.22 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  44.22 
 
 		 416 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4034  cinA domain protein  45.28 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.344001  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  46.85 
 
 		 162 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  43.15 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>