More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0354 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  100 
 
 		 179 aa  353  6.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0343  CinA domain protein  96 
 
 		 189 aa  233  9e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251569  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  70 
 
 		 175 aa  227  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  72.26 
 
 		 156 aa  220  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  68.02 
 
 		 173 aa  218  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  77.24 
 
 		 163 aa  218  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  67.27 
 
 		 168 aa  217  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  64.02 
 
 		 169 aa  198  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0483  CinA domain protein  77.93 
 
 		 184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  63.33 
 
 		 165 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  63.51 
 
 		 166 aa  183  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0076  CinA-like  63.91 
 
 		 167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  65.25 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  56.47 
 
 		 165 aa  182  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  65.71 
 
 		 166 aa  182  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  65.47 
 
 		 184 aa  181  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  65.47 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  65.47 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  65.47 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  64.75 
 
 		 166 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  65.47 
 
 		 166 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  61.49 
 
 		 166 aa  178  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  59.21 
 
 		 166 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  59.87 
 
 		 166 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  59.87 
 
 		 166 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  59.87 
 
 		 166 aa  177  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  59.87 
 
 		 166 aa  177  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  59.87 
 
 		 166 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  59.87 
 
 		 166 aa  177  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  59.87 
 
 		 166 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  60.53 
 
 		 166 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  57.89 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  58.55 
 
 		 166 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  58.49 
 
 		 168 aa  170  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  52.56 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  53.64 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  57.55 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  53.33 
 
 		 203 aa  151  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  55.21 
 
 		 218 aa  151  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  150  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  53.12 
 
 		 168 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  53.85 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  54.14 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  53.74 
 
 		 160 aa  148  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  60.81 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  58.04 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  64.23 
 
 		 165 aa  147  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1377  CinA, C-terminal  58.82 
 
 		 192 aa  147  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.368331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  51.32 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  50.66 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  53.62 
 
 		 162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  54.49 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  59.46 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  61.31 
 
 		 140 aa  145  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  50.66 
 
 		 165 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  50.66 
 
 		 165 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  50.66 
 
 		 165 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  50.65 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  50.65 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  50.65 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  50.65 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  50.65 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  53.74 
 
 		 160 aa  144  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  54.79 
 
 		 166 aa  144  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  50.65 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  50.65 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  54.48 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03080  CinA-like protein  46.2 
 
 		 179 aa  144  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  54.23 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  60.63 
 
 		 426 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 165 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  50.98 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  49.04 
 
 		 162 aa  142  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  51.53 
 
 		 166 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  49.35 
 
 		 165 aa  141  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1514  CinA domain-containing protein  56.94 
 
 		 167 aa  141  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  50.32 
 
 		 166 aa  141  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17520  hypothetical protein  51.27 
 
 		 168 aa  140  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  54.41 
 
 		 162 aa  140  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4034  cinA domain protein  57.66 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.344001  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2602  CinA domain-containing protein  55.94 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  57.89 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  53.85 
 
 		 414 aa  139  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1628  CinA domain-containing protein  56.43 
 
 		 160 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  53.16 
 
 		 175 aa  138  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1656  CinA domain-containing protein  51.97 
 
 		 165 aa  139  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  56.64 
 
 		 162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4031  CinA domain-containing protein  56.43 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306417  unclonable  0.0000000000000327829 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3733  CinA domain-containing protein  49.33 
 
 		 166 aa  138  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000115453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1174  CinA-like  53.24 
 
 		 177 aa  137  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  61.59 
 
 		 175 aa  137  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1911  CinA domain-containing protein  63.64 
 
 		 157 aa  137  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.162967  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1230  CinA domain-containing protein  55.71 
 
 		 160 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000125807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1522  hypothetical protein  50.32 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4089  CinA domain-containing protein  55.71 
 
 		 160 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38570  CinA-related protein  49.67 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1593  CinA-like  44.72 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  53.42 
 
 		 164 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  52.08 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00153  competence/damage-inducible protein CinA domain protein  55.17 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>