More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0212 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  100 
 
 		 168 aa  325  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  58.49 
 
 		 179 aa  170  9e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  59.09 
 
 		 173 aa  165  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  55.48 
 
 		 168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  60.29 
 
 		 175 aa  160  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  56.95 
 
 		 163 aa  158  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  59.06 
 
 		 156 aa  157  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  55.15 
 
 		 165 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  53.9 
 
 		 166 aa  154  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  54.55 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  53.25 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  53.25 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  54.55 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  52.6 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  51.23 
 
 		 184 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  52.6 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  51.95 
 
 		 166 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  51.95 
 
 		 166 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  51.95 
 
 		 166 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  51.95 
 
 		 166 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  51.95 
 
 		 166 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  55.41 
 
 		 176 aa  150  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  51.95 
 
 		 166 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  51.95 
 
 		 166 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  52.6 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  51.61 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  52.47 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  53.29 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  50.64 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  51.63 
 
 		 371 aa  148  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  147  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  51.63 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  51.61 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  52.9 
 
 		 162 aa  147  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  58.04 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  53.85 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  50.33 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  54.14 
 
 		 166 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  50.33 
 
 		 166 aa  143  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  53.5 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0483  CinA domain protein  60.43 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0076  CinA-like  58.04 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  52.53 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  52.53 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  53.74 
 
 		 203 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  52.53 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  52.2 
 
 		 211 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  52.53 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  52.53 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  52.53 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  52.53 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  60.27 
 
 		 436 aa  141  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  51.59 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  55.56 
 
 		 168 aa  140  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  51.28 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  58.28 
 
 		 166 aa  140  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  54.79 
 
 		 166 aa  140  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  51.27 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  51.27 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  51.27 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  54.42 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  50.63 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  51.27 
 
 		 165 aa  139  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1593  CinA-like  43.12 
 
 		 166 aa  137  4.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  49.69 
 
 		 208 aa  137  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  49.35 
 
 		 184 aa  137  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  50.94 
 
 		 206 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  49.35 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  50.63 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  49.35 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0525  CinA domain protein  59.21 
 
 		 163 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  54.97 
 
 		 414 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  57.62 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3214  competence damage-inducible protein A  50.96 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  46.45 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  48.97 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  49.69 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  50 
 
 		 208 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  46.45 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1113  competence damage-inducible protein A  50.32 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383683  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  52.38 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  48 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00153  competence/damage-inducible protein CinA domain protein  49.37 
 
 		 164 aa  135  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1473  CinA domain protein  50 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  51.43 
 
 		 414 aa  134  6.0000000000000005e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  47.59 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  49.35 
 
 		 162 aa  133  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  57.35 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  47.47 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0633  putative competence-damaged protein  45.73 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  52.05 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03080  CinA-like protein  46.26 
 
 		 179 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1522  hypothetical protein  50.32 
 
 		 168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  46.05 
 
 		 411 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0067  competence/damage inducible protein CinA  50 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  58.16 
 
 		 175 aa  130  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0343  CinA domain protein  59.13 
 
 		 189 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  53.64 
 
 		 414 aa  130  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  54.61 
 
 		 175 aa  130  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  45.16 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>