More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0525 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0525  CinA domain protein  100 
 
 		 163 aa  314  3e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1514  CinA domain-containing protein  61.78 
 
 		 167 aa  180  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  58.64 
 
 		 166 aa  167  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  58.64 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  55.84 
 
 		 211 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  55.84 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  61.9 
 
 		 175 aa  159  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  58.87 
 
 		 165 aa  155  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1079  competence/damage-inducible protein CinA  58.87 
 
 		 165 aa  155  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0607096  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  61.9 
 
 		 175 aa  154  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  59.21 
 
 		 168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  55.41 
 
 		 208 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  54.55 
 
 		 206 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  55.06 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  57.24 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  53.9 
 
 		 203 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2068  CinA domain-containing protein  58.16 
 
 		 163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  52.15 
 
 		 208 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  54.35 
 
 		 165 aa  150  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  54.04 
 
 		 202 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3134  CinA domain-containing protein  57.14 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582332 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  54.79 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  52.2 
 
 		 168 aa  147  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0243  CinA domain-containing protein  55.03 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.912222  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2173  CinA domain-containing protein  62.18 
 
 		 165 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19979  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1808  CinA domain protein  46.25 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1086  CinA domain-containing protein  48.1 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  51.39 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  61.11 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  56.92 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  55.56 
 
 		 173 aa  134  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  64.55 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  64.55 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  134  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1615  CinA domain protein  45 
 
 		 166 aa  133  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  57.69 
 
 		 165 aa  133  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  63.64 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2130  competence-damage associated protein  46.54 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  58.27 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  54.09 
 
 		 169 aa  131  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  64.55 
 
 		 166 aa  131  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1923  CinA-like  54.29 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.150163  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1482  CinA domain-containing protein  58.16 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  53.73 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  63.64 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  52.17 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  52.17 
 
 		 166 aa  130  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  49.04 
 
 		 203 aa  130  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  52.7 
 
 		 168 aa  130  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  52.17 
 
 		 166 aa  130  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  63.64 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  62.73 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  62.73 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  62.73 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  62.73 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1422  CinA domain-containing protein  49.68 
 
 		 171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  62.73 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  52.99 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  62.73 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  60 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  62.73 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  62.73 
 
 		 184 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  62.73 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  55.97 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2602  CinA domain-containing protein  50.34 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  55.97 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  47.37 
 
 		 166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  47.37 
 
 		 166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  53.24 
 
 		 176 aa  127  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  51.61 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  55.47 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  53.91 
 
 		 411 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  51.45 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  48.23 
 
 		 413 aa  124  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  58.27 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  57.81 
 
 		 179 aa  124  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  56.14 
 
 		 414 aa  122  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  52.38 
 
 		 414 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1911  CinA domain-containing protein  53.85 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.162967  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  54.55 
 
 		 418 aa  122  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  55.07 
 
 		 161 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  50.68 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  50.34 
 
 		 413 aa  121  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0076  CinA-like  56.74 
 
 		 167 aa  120  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  47.62 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  48.59 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  47.26 
 
 		 420 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  53.62 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  58.12 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  51.59 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  47.2 
 
 		 168 aa  118  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  47.18 
 
 		 415 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  50.34 
 
 		 414 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  51.75 
 
 		 413 aa  117  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  47.59 
 
 		 165 aa  117  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  45.33 
 
 		 412 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  54.87 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  53.68 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  47.17 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  48.59 
 
 		 431 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>