More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03080 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03080  CinA-like protein  100 
 
 		 179 aa  364  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3262  CinA-like  57.82 
 
 		 170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  52.7 
 
 		 162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0622  CinA-like protein  52.53 
 
 		 174 aa  154  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.550403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  48.77 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  49.69 
 
 		 165 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  49.69 
 
 		 165 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  49.69 
 
 		 165 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  49.69 
 
 		 165 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  49.69 
 
 		 165 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  49.69 
 
 		 165 aa  153  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  49.69 
 
 		 165 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  49.69 
 
 		 165 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1522  hypothetical protein  50.32 
 
 		 168 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38570  CinA-related protein  49.01 
 
 		 164 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  53.52 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  49.08 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17520  hypothetical protein  48.73 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  49.08 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  49.08 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  49.08 
 
 		 165 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  48.47 
 
 		 165 aa  148  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  53.1 
 
 		 184 aa  149  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  48.12 
 
 		 166 aa  148  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  53.1 
 
 		 162 aa  147  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  53.1 
 
 		 162 aa  147  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  47.97 
 
 		 403 aa  144  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  49.67 
 
 		 165 aa  144  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  46.2 
 
 		 179 aa  144  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  48.39 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0069  CinA family protein  50.66 
 
 		 168 aa  143  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  44.51 
 
 		 168 aa  142  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  44.57 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  44.57 
 
 		 166 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  44.85 
 
 		 166 aa  141  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  44 
 
 		 166 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  44 
 
 		 166 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  44 
 
 		 166 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  46.79 
 
 		 218 aa  141  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  44 
 
 		 184 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  49.66 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  44 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  43.43 
 
 		 166 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  42.94 
 
 		 168 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  44 
 
 		 166 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  44 
 
 		 166 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  44 
 
 		 166 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  44 
 
 		 166 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  44 
 
 		 166 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  44 
 
 		 166 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  44 
 
 		 166 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4031  CinA domain-containing protein  48 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306417  unclonable  0.0000000000000327829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4034  cinA domain protein  48.98 
 
 		 166 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.344001  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1628  CinA domain-containing protein  47.33 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  46.75 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  48.68 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0633  putative competence-damaged protein  47.24 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  48.68 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1377  CinA, C-terminal  47.17 
 
 		 192 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.368331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3214  competence damage-inducible protein A  50.34 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  49.01 
 
 		 162 aa  135  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4089  CinA domain-containing protein  47.33 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  41.61 
 
 		 164 aa  134  9e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  45.16 
 
 		 169 aa  134  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00153  competence/damage-inducible protein CinA domain protein  49.69 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  47.68 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  47.83 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  46.05 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  46.26 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  41.14 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1113  competence damage-inducible protein A  48.3 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383683  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0971  CinA domain protein  47.22 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00476179  hitchhiker  0.00000668573 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  42.42 
 
 		 203 aa  131  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  40.57 
 
 		 166 aa  131  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  45.58 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1230  CinA domain-containing protein  47.33 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000125807 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  45.64 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1174  CinA-like  45.58 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  40.57 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2530  competence/damage-inducible protein CinA  44.12 
 
 		 424 aa  127  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  48.32 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  45 
 
 		 412 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  43.71 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0781  CinA-like  41.83 
 
 		 362 aa  125  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00322218  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  44.81 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  43.86 
 
 		 176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  44.29 
 
 		 412 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  44.16 
 
 		 166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1593  CinA-like  42.24 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  43.54 
 
 		 165 aa  124  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1473  CinA domain protein  45.51 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  46.15 
 
 		 166 aa  124  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  43.75 
 
 		 413 aa  123  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  43.66 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  46.9 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  47.33 
 
 		 159 aa  123  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  45.77 
 
 		 411 aa  122  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  42.31 
 
 		 166 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  52.99 
 
 		 413 aa  123  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>