More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1389 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  100 
 
 
403 aa  820    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  42.96 
 
 
408 aa  296  3e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  40.44 
 
 
408 aa  281  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  40.68 
 
 
408 aa  280  4e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  40.45 
 
 
401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  36.78 
 
 
413 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  36.41 
 
 
412 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  35.14 
 
 
411 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  35.57 
 
 
413 aa  229  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  33.57 
 
 
415 aa  229  6e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.46 
 
 
424 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  36.17 
 
 
412 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.5 
 
 
433 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  33.76 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  32.03 
 
 
420 aa  219  7e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  33.25 
 
 
415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  31.25 
 
 
415 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.11 
 
 
431 aa  215  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  33.17 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  31.58 
 
 
420 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  33.89 
 
 
418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  31.51 
 
 
420 aa  209  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  31.07 
 
 
419 aa  208  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  32.04 
 
 
413 aa  208  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  34.61 
 
 
424 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  32.37 
 
 
412 aa  205  9e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  32.52 
 
 
412 aa  206  9e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  32.13 
 
 
412 aa  205  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  32.37 
 
 
412 aa  205  9e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  32.13 
 
 
412 aa  206  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  32.37 
 
 
412 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  32.37 
 
 
412 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  32.93 
 
 
413 aa  203  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  32.13 
 
 
412 aa  202  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  31.64 
 
 
412 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  31.33 
 
 
412 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  32.13 
 
 
415 aa  200  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  32.85 
 
 
417 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  31.28 
 
 
413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  32.31 
 
 
416 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  29.22 
 
 
413 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  33.49 
 
 
425 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  33.51 
 
 
416 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  29.47 
 
 
414 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  34.96 
 
 
416 aa  195  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  31.71 
 
 
421 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  28.78 
 
 
432 aa  195  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  31.64 
 
 
418 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  31.46 
 
 
421 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  30.77 
 
 
429 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  31.46 
 
 
421 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  31.89 
 
 
419 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  30.9 
 
 
414 aa  193  5e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.69 
 
 
424 aa  193  5e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  31.41 
 
 
411 aa  193  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  28.21 
 
 
423 aa  192  6e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  30.71 
 
 
415 aa  191  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  29.84 
 
 
423 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  30.86 
 
 
408 aa  190  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  28.71 
 
 
408 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  31.81 
 
 
420 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  30.99 
 
 
420 aa  189  8e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  30.79 
 
 
416 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  30.79 
 
 
416 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  29.02 
 
 
430 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  29.65 
 
 
417 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  31.53 
 
 
418 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  30.41 
 
 
424 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  28.71 
 
 
414 aa  187  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  29.16 
 
 
437 aa  186  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  30.86 
 
 
414 aa  186  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  32.08 
 
 
432 aa  185  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  29.61 
 
 
414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  31.19 
 
 
424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  30.02 
 
 
412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  30.53 
 
 
415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  31.25 
 
 
423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  28.96 
 
 
408 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  31.63 
 
 
400 aa  184  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  31.07 
 
 
424 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  27.75 
 
 
418 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1729  competence/damage-inducible protein CinA  32.04 
 
 
401 aa  183  6e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  32.24 
 
 
419 aa  183  6e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  25.6 
 
 
425 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  29.18 
 
 
417 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.4 
 
 
430 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  27.47 
 
 
423 aa  179  7e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  29.02 
 
 
430 aa  179  7e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  28.47 
 
 
408 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  34.77 
 
 
424 aa  179  9e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  31.16 
 
 
430 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  30.82 
 
 
425 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  30.82 
 
 
425 aa  179  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  31.43 
 
 
424 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  30.44 
 
 
425 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  32.39 
 
 
424 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  30.94 
 
 
424 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  29.22 
 
 
433 aa  176  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  30.16 
 
 
447 aa  176  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  29.67 
 
 
426 aa  176  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>