More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1570 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  100 
 
 
413 aa  840    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  42.75 
 
 
424 aa  299  6e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  41.55 
 
 
425 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  41.3 
 
 
425 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  41.3 
 
 
425 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  41.3 
 
 
424 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  39.47 
 
 
415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  40.72 
 
 
412 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  41.06 
 
 
424 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  38.89 
 
 
413 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  40.34 
 
 
424 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  40.71 
 
 
424 aa  282  9e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  40.58 
 
 
424 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  41.79 
 
 
424 aa  280  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  40.48 
 
 
424 aa  277  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  39.86 
 
 
424 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  39.86 
 
 
424 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  39.61 
 
 
424 aa  276  6e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  41.34 
 
 
415 aa  275  8e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  40.82 
 
 
413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  40.38 
 
 
414 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  39.9 
 
 
424 aa  271  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  41.79 
 
 
417 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  37.25 
 
 
420 aa  266  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  39.71 
 
 
413 aa  266  7e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  38.95 
 
 
420 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  40.29 
 
 
414 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  39.42 
 
 
408 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  38.57 
 
 
415 aa  260  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  39.9 
 
 
410 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  36.32 
 
 
411 aa  259  7e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  38.01 
 
 
437 aa  259  8e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  37.86 
 
 
423 aa  256  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  38.98 
 
 
424 aa  256  5e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  38.15 
 
 
416 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  36.43 
 
 
425 aa  254  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  38.52 
 
 
408 aa  252  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  38.57 
 
 
408 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  38.5 
 
 
418 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  38.62 
 
 
432 aa  248  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  36.8 
 
 
417 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  37.26 
 
 
416 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  37.26 
 
 
416 aa  248  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  37.32 
 
 
429 aa  246  4e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  34.37 
 
 
415 aa  245  9.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  37.02 
 
 
416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  39.15 
 
 
413 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  37.74 
 
 
413 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  35.95 
 
 
413 aa  243  6e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  35.71 
 
 
408 aa  241  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  40.05 
 
 
423 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  36.53 
 
 
411 aa  238  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  36.75 
 
 
414 aa  237  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  36.28 
 
 
418 aa  236  4e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  38.52 
 
 
415 aa  236  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  34.86 
 
 
412 aa  236  7e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  35.05 
 
 
419 aa  235  8e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  36.54 
 
 
417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  36.65 
 
 
411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  35.97 
 
 
432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  34.62 
 
 
412 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  38.06 
 
 
430 aa  232  7.000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  37.6 
 
 
423 aa  229  6e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  38.28 
 
 
431 aa  227  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  40.36 
 
 
414 aa  228  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.97 
 
 
433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  35.44 
 
 
418 aa  226  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  36.87 
 
 
418 aa  225  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  35.8 
 
 
420 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  35.32 
 
 
421 aa  224  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  37.95 
 
 
423 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  37.56 
 
 
414 aa  223  6e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  33.41 
 
 
417 aa  223  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  40 
 
 
433 aa  222  9e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  36 
 
 
430 aa  220  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  35.81 
 
 
420 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  35.97 
 
 
425 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.06 
 
 
424 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  32.04 
 
 
403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  39.01 
 
 
438 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  33.49 
 
 
408 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.15 
 
 
431 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  34.45 
 
 
416 aa  210  3e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  34.9 
 
 
427 aa  210  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  34.46 
 
 
424 aa  209  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  36.1 
 
 
421 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  36.1 
 
 
421 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  36.1 
 
 
421 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.93 
 
 
430 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  34.91 
 
 
416 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  33.02 
 
 
408 aa  205  9e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  37.14 
 
 
432 aa  202  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  31.65 
 
 
401 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  33.43 
 
 
406 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  35.35 
 
 
419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  32.69 
 
 
430 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  34.04 
 
 
412 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.78 
 
 
424 aa  199  7e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  32.2 
 
 
412 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3616  competence/damage-inducible protein CinA  33.49 
 
 
416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>