More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2530 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2530  competence/damage-inducible protein CinA  100 
 
 		 424 aa  853    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  38.26 
 
 		 415 aa  262  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  37.56 
 
 		 420 aa  242  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  41.38 
 
 		 413 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  39.17 
 
 		 420 aa  230  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  35.51 
 
 		 432 aa  226  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  36.5 
 
 		 411 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  38.26 
 
 		 417 aa  223  7e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  39.17 
 
 		 413 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  35.93 
 
 		 429 aa  219  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  36.89 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  35.97 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  35.58 
 
 		 423 aa  216  7e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  36.71 
 
 		 414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  34.77 
 
 		 423 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  38.07 
 
 		 414 aa  212  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  37.37 
 
 		 417 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  36.02 
 
 		 418 aa  209  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  33.91 
 
 		 415 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  32.84 
 
 		 413 aa  206  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  34.75 
 
 		 423 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  35.47 
 
 		 408 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  34.05 
 
 		 415 aa  203  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  34.94 
 
 		 420 aa  202  8e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  33.49 
 
 		 430 aa  202  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  39.19 
 
 		 423 aa  199  9e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  33.25 
 
 		 413 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  33.77 
 
 		 416 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  30.99 
 
 		 415 aa  196  5.000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  33.66 
 
 		 419 aa  196  7e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  36.27 
 
 		 419 aa  196  8.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  35.19 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  34.05 
 
 		 424 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  32.22 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.57 
 
 		 424 aa  193  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  35.48 
 
 		 408 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  31.98 
 
 		 412 aa  193  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  31.65 
 
 		 418 aa  192  7e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  34.72 
 
 		 413 aa  192  9e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  35.92 
 
 		 424 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  34.84 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  31.8 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  35.08 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  33.58 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  34.65 
 
 		 408 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  34.37 
 
 		 424 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  38.96 
 
 		 414 aa  190  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.98 
 
 		 433 aa  190  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  35.12 
 
 		 424 aa  189  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  37.8 
 
 		 413 aa  189  9e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  33.42 
 
 		 417 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  33.92 
 
 		 416 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  34.03 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  33.01 
 
 		 424 aa  186  5e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  34.42 
 
 		 410 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  30.51 
 
 		 417 aa  186  9e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  30.21 
 
 		 408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  36.39 
 
 		 419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.64 
 
 		 431 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  32.03 
 
 		 408 aa  184  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  32.46 
 
 		 420 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  31.9 
 
 		 401 aa  182  7e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  33.51 
 
 		 424 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  32.05 
 
 		 437 aa  182  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  32.98 
 
 		 424 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  32.98 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  33.58 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.67 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  30.48 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  33.01 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  32.71 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  30.62 
 
 		 418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  31.25 
 
 		 400 aa  180  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  33.92 
 
 		 424 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  31.71 
 
 		 408 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  32.71 
 
 		 424 aa  179  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  32.43 
 
 		 430 aa  179  8e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  36.9 
 
 		 425 aa  179  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  33.77 
 
 		 424 aa  179  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  33.17 
 
 		 418 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  32.71 
 
 		 424 aa  178  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.45 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  32.17 
 
 		 425 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  35.04 
 
 		 414 aa  177  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  32.17 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  35.66 
 
 		 432 aa  177  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  32.17 
 
 		 425 aa  176  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  33.96 
 
 		 430 aa  176  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  30.05 
 
 		 415 aa  176  9e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  35.48 
 
 		 433 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  36.6 
 
 		 438 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  34.28 
 
 		 426 aa  176  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  32.17 
 
 		 424 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  32.52 
 
 		 413 aa  173  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 416 aa  173  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  31.08 
 
 		 414 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  29.63 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  29.79 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  34.15 
 
 		 427 aa  169  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  29.83 
 
 		 412 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>