More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3016 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  100 
 
 		 166 aa  338  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  98.8 
 
 		 166 aa  334  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  90.91 
 
 		 166 aa  315  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  72.67 
 
 		 165 aa  244  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  72.67 
 
 		 165 aa  243  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  67.27 
 
 		 166 aa  229  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  67.88 
 
 		 166 aa  228  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  66.67 
 
 		 166 aa  225  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  64.85 
 
 		 166 aa  221  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  63.64 
 
 		 166 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  63.64 
 
 		 166 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  63.64 
 
 		 166 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  63.64 
 
 		 184 aa  217  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  63.03 
 
 		 166 aa  217  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  63.64 
 
 		 166 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  63.03 
 
 		 166 aa  216  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  62.42 
 
 		 166 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  62.42 
 
 		 166 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  62.42 
 
 		 166 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  62.42 
 
 		 166 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  62.42 
 
 		 166 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  62.42 
 
 		 166 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  62.42 
 
 		 166 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  65.25 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  60.39 
 
 		 173 aa  180  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  59.87 
 
 		 168 aa  177  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  56.6 
 
 		 175 aa  176  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  59.86 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  59.06 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  51.53 
 
 		 165 aa  169  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  53.21 
 
 		 164 aa  167  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  57.32 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  51.95 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  57.25 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  51.95 
 
 		 164 aa  161  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  51.83 
 
 		 166 aa  161  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  53.59 
 
 		 166 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0483  CinA domain protein  62.68 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  50 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  54.55 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0069  CinA family protein  50.63 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  49.68 
 
 		 162 aa  158  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  48.1 
 
 		 169 aa  158  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  58.96 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  50.64 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  52.94 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0076  CinA-like  55.26 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  55.07 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  52.67 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  52.67 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  52.67 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  52.67 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  52.67 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  52.67 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3134  CinA domain-containing protein  51.32 
 
 		 164 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582332 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  52.67 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  52.67 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  52.67 
 
 		 165 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  52.67 
 
 		 165 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  52.67 
 
 		 165 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  51.22 
 
 		 168 aa  150  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  58.04 
 
 		 166 aa  150  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  52 
 
 		 165 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  51.63 
 
 		 203 aa  149  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  52 
 
 		 165 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  47.5 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  52.2 
 
 		 165 aa  148  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  51.33 
 
 		 165 aa  147  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  51.97 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  48.7 
 
 		 172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  51.55 
 
 		 166 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  50.33 
 
 		 414 aa  145  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1593  CinA-like  44.51 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0633  putative competence-damaged protein  51.35 
 
 		 165 aa  145  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2602  CinA domain-containing protein  54.97 
 
 		 163 aa  144  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  58.33 
 
 		 140 aa  144  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2530  competence/damage-inducible protein CinA  51.09 
 
 		 424 aa  144  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  48.75 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  53.5 
 
 		 168 aa  143  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  48.75 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  48.75 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1377  CinA, C-terminal  48.34 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.368331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  47.17 
 
 		 166 aa  141  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  46.88 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  44.3 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  51.43 
 
 		 418 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  50.94 
 
 		 420 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4034  cinA domain protein  48.34 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.344001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4031  CinA domain-containing protein  49.01 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306417  unclonable  0.0000000000000327829 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1473  CinA domain protein  47.77 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1656  CinA domain-containing protein  49.04 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1174  CinA-like  47.77 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4089  CinA domain-containing protein  47.4 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1079  competence/damage-inducible protein CinA  49.37 
 
 		 165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0607096  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  49.68 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  49.09 
 
 		 168 aa  137  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  42.58 
 
 		 411 aa  137  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  51.37 
 
 		 414 aa  137  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1628  CinA domain-containing protein  47.4 
 
 		 160 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  46.79 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>