More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4628 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  100 
 
 		 426 aa  834    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  60.09 
 
 		 421 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  60.09 
 
 		 421 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  60.09 
 
 		 421 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  59.86 
 
 		 422 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  57.01 
 
 		 430 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  60.56 
 
 		 422 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  53.27 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  51.63 
 
 		 434 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  34.74 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  35.96 
 
 		 413 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  36.56 
 
 		 414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  35.6 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  35.12 
 
 		 415 aa  217  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  35.73 
 
 		 419 aa  216  7e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  32.87 
 
 		 401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.86 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  37.47 
 
 		 414 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  38.22 
 
 		 420 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  36.58 
 
 		 420 aa  209  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  34.27 
 
 		 425 aa  209  8e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  36.07 
 
 		 414 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  33.49 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  38.89 
 
 		 420 aa  203  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  36.66 
 
 		 414 aa  203  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  33.65 
 
 		 411 aa  202  7e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  35.43 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  34.88 
 
 		 416 aa  199  7e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  34.43 
 
 		 416 aa  199  9e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  33.65 
 
 		 424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  35.9 
 
 		 411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  31.85 
 
 		 408 aa  196  6e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  35.71 
 
 		 413 aa  196  9e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  31.85 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  34.97 
 
 		 416 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.91 
 
 		 433 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.18 
 
 		 430 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  36.3 
 
 		 430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  32.17 
 
 		 412 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  32.94 
 
 		 408 aa  190  5e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  34.78 
 
 		 437 aa  189  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  34.73 
 
 		 416 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  30.42 
 
 		 424 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  34.33 
 
 		 413 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  38.55 
 
 		 408 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  31.7 
 
 		 412 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  34.26 
 
 		 418 aa  186  8e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  38.66 
 
 		 408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  31.16 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  31.16 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  32.39 
 
 		 430 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  32.62 
 
 		 424 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  34.1 
 
 		 432 aa  184  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  31.16 
 
 		 412 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  31.16 
 
 		 412 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  31.16 
 
 		 412 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  31.16 
 
 		 412 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  36.2 
 
 		 421 aa  182  7e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  30.93 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  32.14 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  38.13 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  30.23 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  31.55 
 
 		 412 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  31.91 
 
 		 424 aa  180  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 413 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  30.12 
 
 		 403 aa  179  5.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  31.83 
 
 		 424 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  34.39 
 
 		 431 aa  177  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  34.84 
 
 		 418 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  36.13 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  33.57 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  31.68 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  31.68 
 
 		 425 aa  177  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  31.35 
 
 		 424 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  37.41 
 
 		 410 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  33.11 
 
 		 423 aa  176  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  31.44 
 
 		 425 aa  176  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  34.88 
 
 		 429 aa  176  7e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  31.35 
 
 		 424 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  36.52 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  31.68 
 
 		 424 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  33.59 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  32.78 
 
 		 424 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 423 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  34.03 
 
 		 420 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  30.39 
 
 		 412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  29.44 
 
 		 406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.46 
 
 		 424 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  35.02 
 
 		 433 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  33.1 
 
 		 424 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  29.47 
 
 		 412 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  35.46 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  31.44 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  35.13 
 
 		 419 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  32.55 
 
 		 424 aa  170  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  31.26 
 
 		 424 aa  170  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  31.81 
 
 		 416 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2530  competence/damage-inducible protein CinA  33.81 
 
 		 424 aa  169  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  36.89 
 
 		 420 aa  169  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  30.07 
 
 		 415 aa  167  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>