More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3134 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3134  CinA domain-containing protein  100 
 
 		 164 aa  325  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1514  CinA domain-containing protein  59.38 
 
 		 167 aa  180  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  65.44 
 
 		 166 aa  178  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  63.97 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2602  CinA domain-containing protein  54.6 
 
 		 163 aa  173  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  62.14 
 
 		 175 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1808  CinA domain protein  53.05 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  63.31 
 
 		 175 aa  168  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  63.31 
 
 		 175 aa  167  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1615  CinA domain protein  52.44 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  55.7 
 
 		 166 aa  161  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  61.87 
 
 		 203 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  61.15 
 
 		 211 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  58.94 
 
 		 208 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  58.99 
 
 		 162 aa  157  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  58.7 
 
 		 208 aa  157  9e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  58.28 
 
 		 206 aa  156  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  54.48 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  58.7 
 
 		 208 aa  155  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1079  competence/damage-inducible protein CinA  54.48 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0607096  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2130  competence-damage associated protein  53.7 
 
 		 168 aa  154  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  51.32 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  51.32 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  55.33 
 
 		 202 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  51.32 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1086  CinA domain-containing protein  48.45 
 
 		 165 aa  150  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1422  CinA domain-containing protein  50 
 
 		 171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  52.17 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2068  CinA domain-containing protein  52.38 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  54.2 
 
 		 165 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  53.73 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  55 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  53.96 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  49.07 
 
 		 203 aa  141  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  53.96 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  52.86 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  52.86 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  52.86 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  52.99 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  52.86 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  52.86 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  52.86 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  52.86 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  52.86 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  52.86 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  51.68 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  53.24 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  47.4 
 
 		 411 aa  138  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0243  CinA domain-containing protein  51.53 
 
 		 178 aa  138  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.912222  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  53.24 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  53.24 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  53.24 
 
 		 166 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  49.1 
 
 		 184 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  51.49 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  56.43 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1923  CinA-like  47.85 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.150163  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  52.17 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  50.97 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1482  CinA domain-containing protein  57.45 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  47.77 
 
 		 179 aa  134  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  55.71 
 
 		 161 aa  133  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  52.17 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0525  CinA domain protein  57.14 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  59.46 
 
 		 414 aa  132  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  45.58 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  53.38 
 
 		 184 aa  131  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  53.38 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  53.38 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  50.71 
 
 		 165 aa  130  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  50.71 
 
 		 165 aa  130  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  46.84 
 
 		 166 aa  130  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  50.71 
 
 		 165 aa  130  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  50.71 
 
 		 165 aa  130  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  50.71 
 
 		 165 aa  130  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  50.71 
 
 		 165 aa  130  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  50.71 
 
 		 165 aa  130  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  50.71 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  51.49 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  52.21 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  52.86 
 
 		 421 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  51.57 
 
 		 168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2173  CinA domain-containing protein  58.52 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19979  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  52.14 
 
 		 421 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  52.14 
 
 		 421 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  50.36 
 
 		 173 aa  127  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  53.24 
 
 		 422 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  51.08 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  49.29 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  49.29 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  49.29 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  53.38 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  49.29 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  48.57 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  51.94 
 
 		 418 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  52.55 
 
 		 140 aa  125  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  49.24 
 
 		 175 aa  124  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  48.57 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  56.45 
 
 		 165 aa  124  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  57.76 
 
 		 426 aa  124  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  50 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>